| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 274,151 | A→T | 9.5% | L140Q (CTG→CAG) | PP_0221 ← | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 274,151 | 0 | A | T | 9.5% | 177.4 / 8.1 | 63 | L140Q (CTG→CAG) | PP_0221 | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/30); new base T (2/4); total (29/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
AGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAG > NC_002947/274004‑274298 | atgTCTGCGTCGTCGTACGGGCGTACCTGTAGCACCGCCTCGACCTGAAGGAGCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTCGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCcagcagcag < 7:129970/147‑1 (MQ=255)aGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACAGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCcagcagcag > 4:201403/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCcagcagcagcag < 3:201403/149‑1 (MQ=255) gCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTGGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCGTGGCCTGCTGCTGCTGGcc < 1:290094/149‑1 (MQ=255) gtcgtcgtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGTGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCTGCTGCTGCTGGCCaa < 7:276723/149‑2 (MQ=255) gtcgtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCGTGGCCTGCTGCTGCTGGCCAAGGc < 4:242187/149‑1 (MQ=255) tcgtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGcc > 4:268061/1‑149 (MQ=255) tAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGNCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCt < 1:25636/149‑1 (MQ=255) tAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCt < 1:30405/149‑1 (MQ=255) tAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCACACGCAGTGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCAACGGCCgat > 8:268006/1‑147 (MQ=255) ggCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTg < 8:219969/148‑1 (MQ=255) gcgcGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACAGCGGCCGTGGCCTGCTGCTGCTGGCCAAGGCCgggtt < 6:44819/149‑5 (MQ=37) ccAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCggg < 5:83702/149‑1 (MQ=255) aGTTGCACCGCGTCGAGCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTc < 3:173825/149‑1 (MQ=255) ttGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGt < 5:25457/149‑1 (MQ=255) ttGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGt > 6:25457/1‑149 (MQ=255) gCACCGCCTCGACCTGAAGGATGTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGt > 5:225632/1‑135 (MQ=255) gCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGt < 6:221409/135‑1 (MQ=255) gCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGt < 6:225632/135‑1 (MQ=255) gCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGt > 5:221409/1‑135 (MQ=255) gCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTg > 6:8937/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTg < 8:278323/147‑1 (MQ=255) aCCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTg > 7:278323/1‑147 (MQ=255) gCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGAt < 4:102276/149‑1 (MQ=255) aaGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTg < 3:129468/148‑1 (MQ=255) ggATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGgcg < 5:175724/149‑1 (MQ=255) tCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCt > 4:44042/1‑149 (MQ=255) cTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCg > 2:296800/1‑109 (MQ=255) cTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCg < 1:296800/109‑1 (MQ=255) cAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAg > 7:274103/1‑149 (MQ=255) cAGCTTTTTAGGGGTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa < 3:205856/148‑1 (MQ=255) aGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGTTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg < 8:161590/149‑1 (MQ=255) aGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg < 3:44042/149‑1 (MQ=255) ttttAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAg > 6:257474/1‑148 (MQ=255) ttGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCa > 4:228564/1‑147 (MQ=255) aGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtttt < 2:44525/149‑1 (MQ=255) ggATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTg > 8:26669/1‑149 (MQ=255) cAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAg < 7:122823/137‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAg > 8:122823/1‑137 (MQ=255) ccTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTc < 4:266494/149‑1 (MQ=255) cTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACtcgaaaa < 3:268061/149‑7 (MQ=255) ggTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGa < 5:277807/147‑1 (MQ=255) gTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGTCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTa < 8:274103/149‑1 (MQ=255) gTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTa < 5:8937/149‑1 (MQ=255) ccACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACgttg > 3:45976/1‑149 (MQ=255) ccACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACgttg > 2:243059/1‑149 (MQ=255) cGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTtgatg < 3:228564/149‑1 (MQ=255) cGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTtgat > 3:211864/1‑148 (MQ=255) ttGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGcc > 8:95426/1‑149 (MQ=255) gggTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGGCCggg > 7:206920/1‑149 (MQ=255) ggTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCgggg > 7:10344/1‑149 (MQ=255) ggTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCgggg > 5:162416/1‑149 (MQ=255) tGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCg > 5:307105/1‑149 (MQ=255) aTCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTAGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTGGATGAAGATGCCCGGGGCGt > 8:102086/1‑148 (MQ=255) tCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCCCGCTGGCGCCGTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGGTGTGGATGATGCCCGGGGCGt > 5:296564/1‑147 (MQ=255) tCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTaa < 6:307105/149‑1 (MQ=255) cAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTaa < 4:45976/148‑1 (MQ=255) acagcGGCCGTGGCGTGCTGCTGCTGGCCAAGG‑CGGGGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCCCGCTGGCGCCTTCAGGACGCTCGGCAAAGCTTTTGTAGTTTTTAGAGTACAGGCCAACGTTTTTGATGATGCCCGGGGCGTAAgg > 4:77456/5‑148 (MQ=255) aC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGCCGATGGTTACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGc < 1:252754/149‑1 (MQ=255) c‑ccGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGca > 6:134838/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACaa < 8:10344/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACaa < 7:95426/149‑1 (MQ=255) ccgtGGCCTGCTGCTGCTGGCCAAGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAgg > 2:280562/4‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAgg > 8:71194/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGt < 2:236658/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGt > 8:35587/1‑149 (MQ=255) agcagGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTgcag > 3:112225/1‑148 (MQ=255) | AGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAC‑CCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAG > NC_002947/274004‑274298 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |