| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,723,683 | G→T | 5.6% | intergenic (+13/+17) | PP_3288 → / ← PP_3289 | universal stress protein family protein/acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,723,683 | 0 | G | T | 5.6% | 227.1 / 3.6 | 72 | intergenic (+13/+17) | PP_3288/PP_3289 | universal stress protein family protein/acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/34); new base T (2/2); total (36/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.92e-01 | |||||||||||
TACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCAT > NC_002947/3723546‑3723825 | tACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CTTGCGGGCCTTg < 1:80526/149‑1 (MQ=255) cTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTc > 2:258695/1‑149 (MQ=255) tCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCtttt < 5:60376/149‑1 (MQ=255) aTGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CTTGCGGGCCTTg < 4:269457/141‑1 (MQ=255) aTGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CTTGCGGGCCTTg > 3:269457/1‑141 (MQ=255) aTGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTc < 5:71551/148‑1 (MQ=255) tGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTc > 5:173059/1‑147 (MQ=255) tGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCaa < 5:205577/149‑1 (MQ=255) tGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCaa < 6:310502/149‑1 (MQ=255) ggCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAg < 7:264071/148‑1 (MQ=255) aGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCg > 1:281024/1‑149 (MQ=255) aTCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTc < 8:168726/138‑1 (MQ=255) aTCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTc > 7:168726/1‑138 (MQ=255) accaccGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTc < 6:173059/148‑1 (MQ=255) accaccGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTc > 5:128155/1‑148 (MQ=255) ccaccGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCGGGTCTTGTCAAGGCCGCAGGTCaa > 6:212952/1‑149 (MQ=255) gCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTg < 8:293419/148‑1 (MQ=255) aTCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAg < 1:9828/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAAtc > 1:101206/1‑149 (MQ=255) gTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGc > 5:63088/1‑149 (MQ=255) cGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACAt > 3:84292/1‑149 (MQ=255) gCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATcg > 2:91594/1‑149 (MQ=255) cTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGccgccg < 4:273319/149‑1 (MQ=255) ccGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCgggg > 1:308701/1‑149 (MQ=255) 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aTCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAg > 1:62128/1‑149 (MQ=255) tCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCgg > 7:64645/1‑132 (MQ=255) tCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCgg < 8:64645/132‑1 (MQ=255) tCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTg < 2:62128/148‑1 (MQ=255) gcagTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCTGGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGTTCAAGTACGTGCAGAATCTCGCACACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCt > 1:234993/1‑148 (MQ=255) cagTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGACCAGTGCCTTGa > 1:233997/1‑149 (MQ=255) agTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑AGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGACGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGCTGAAGCCCAGTGACTTGAc > 5:4345/1‑149 (MQ=255) cTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGcc < 2:308701/148‑1 (MQ=255) cTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCg < 2:234993/149‑1 (MQ=255) cTGGTGATTTCTACAGAGCGCTCCTAAGTCTTAAGTACAAGGCC‑GGCTAGGTCGTTGTCTTTTCAAGGCGGCATGTGAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACTTCGACGCCGGGGTAGCTGGTGTTGAAGATGAGTGGCTTGACCAGGCg < 6:4345/149‑1 (MQ=255) tGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCgg > 3:254624/1‑149 (MQ=255) tGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCgg > 1:94621/1‑149 (MQ=255) gTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCATGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTg < 5:212952/149‑1 (MQ=255) gTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGt < 2:281024/148‑1 (MQ=255) cAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAg > 3:138904/1‑149 (MQ=255) cAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTATTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCCGGGGACCCGCAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGCCCAGCCGGTGCCTCGCGTAg > 7:136955/1‑149 (MQ=255) gagCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCATGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCg < 2:263310/134‑1 (MQ=255) gagCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCg > 1:263310/1‑134 (MQ=255) gagCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATcgc > 5:227605/1‑143 (MQ=255) gagCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATcgc < 6:227605/143‑1 (MQ=255) gagCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGtt < 1:258695/149‑1 (MQ=255) gcTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAATTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTg < 6:128155/149‑1 (MQ=255) gcTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTg < 2:233997/149‑1 (MQ=255) tCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTg > 8:120458/1‑147 (MQ=255) tCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTg < 7:120458/147‑1 (MQ=255) tCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGAGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGc > 3:227556/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAg > 2:268024/1‑139 (MQ=255) ccAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAg < 1:268024/139‑1 (MQ=255) ccAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCa < 6:63088/149‑1 (MQ=255) cAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAg < 4:84292/149‑1 (MQ=255) aaGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGccgccg > 4:209403/1‑86 (MQ=255) aaGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGccgccg < 3:209403/86‑1 (MQ=255) gCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTcc < 5:169074/149‑1 (MQ=255) aagacaAGGCC‑CTTGCGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGCGAGGAGAAGCCCAGTGCCTTGCCCATCCGGTGCATCGCGTAGTTCCTGGCCAGGTCACTGga > 4:179487/4‑149 (MQ=255) gctcaAGGCC‑CGAAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGATTCTCGCTCTCATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCTTCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGgag < 8:136955/146‑1 (MQ=255) gCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTg > 5:46582/1‑146 (MQ=255) gCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGgag < 2:101206/149‑1 (MQ=255) gCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGgag > 3:215621/1‑149 (MQ=255) gCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGgag < 4:138904/149‑1 (MQ=255) acaAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGAcc < 7:175760/108‑1 (MQ=255) acaAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGAcc > 8:175760/1‑108 (MQ=255) caAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAc > 3:251758/1‑148 (MQ=255) aGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCAt < 6:45575/149‑1 (MQ=255) | TACTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCC‑CGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCAT > NC_002947/3723546‑3723825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |