| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 334,737 | T→A | 5.1% | intergenic (‑52/+236) | PP_0276 ← / ← PP_t73 | Cro/CI family transcriptional regulator/tRNA‑Thr |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 334,737 | 0 | T | A | 5.1% | 235.4 / 2.3 | 78 | intergenic (‑52/+236) | PP_0276/PP_t73 | Cro/CI family transcriptional regulator/tRNA‑Thr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/40); new base A (2/2); total (35/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
ATGAAAATGGACAAGTCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGA > NC_002947/334591‑334883 | ttgaAAATGGACTTGTCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGAttg > 5:240319/2‑149 (MQ=255) gaAAATGGACTTGTCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGAttggt > 5:175883/1‑149 (MQ=255) aaTGGACAAGTCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGACATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGAttggttgg > 8:181959/1‑149 (MQ=255) aTGGACTTGTCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGc < 6:175883/149‑1 (MQ=255) aCAAGTCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑TCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCTATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAg < 7:103130/148‑1 (MQ=255) tCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGt > 8:8307/1‑144 (MQ=255) tCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGt < 7:8307/144‑1 (MQ=255) cATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTTGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGc < 5:135840/148‑1 (MQ=255) cATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGc < 2:42800/148‑1 (MQ=255) ttCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGttt < 1:248113/148‑1 (MQ=255) ccATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGga < 7:78086/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAgt < 1:278354/148‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAgt < 7:181959/148‑1 (MQ=255) gCGGTATCTGCGTAGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTg > 7:121408/1‑149 (MQ=255) tCTGCGTGGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGATATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTTGATTGGTTGGCTAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGTGAGTGTGTCTGttttt < 7:96987/148‑1 (MQ=255) tCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAACTTTTATCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGt < 1:102246/148‑1 (MQ=255) cTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGttttt > 1:14128/1‑147 (MQ=255) tGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAg > 6:99134/1‑149 (MQ=255) gCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCAACGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAGATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGc > 1:66561/1‑149 (MQ=255) cgtcgtGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCt > 3:218938/1‑149 (MQ=255) cgtcgtGGGGGGCCTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGa < 8:216854/146‑1 (MQ=255) gtcgtGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGttt < 5:75471/141‑1 (MQ=255) gtcgtGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGttt > 6:75471/1‑141 (MQ=255) gtcgtGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCtg > 1:153818/1‑149 (MQ=255) gggtggCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTg > 1:286409/1‑149 (MQ=255) ggtggCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTgg < 6:240319/149‑1 (MQ=255) gTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAATTATCTATAATTTGCGATTAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCa < 5:97419/149‑1 (MQ=255) gTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGAt > 8:3215/1‑147 (MQ=255) gTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGAATGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGAt > 8:286345/1‑147 (MQ=255) gTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGAATGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGAt > 8:282448/1‑147 (MQ=255) tGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGAt > 4:17511/1‑146 (MQ=255) aaGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGaa < 3:17511/149‑1 (MQ=255) aaGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGaa < 2:14128/149‑1 (MQ=255) aGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGaa < 3:44005/148‑1 (MQ=255) gggCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTg > 1:307319/1‑135 (MQ=255) gggCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTg < 2:307319/135‑1 (MQ=255) gggCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAAtt > 3:72097/1‑149 (MQ=255) ggCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTg < 7:3215/149‑1 (MQ=255) cTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGc < 8:34757/130‑1 (MQ=255) cTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGc > 7:34757/1‑130 (MQ=255) tttCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTg < 1:111421/131‑1 (MQ=255) tttCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTg > 2:111421/1‑131 (MQ=255) tttCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCt > 8:213638/1‑148 (MQ=255) tttCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGATGGTGATCAGAGAATTGCt > 5:173183/1‑148 (MQ=255) tttCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGGGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCtt > 5:168983/1‑149 (MQ=255) tCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTc < 8:121408/148‑1 (MQ=255) gAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTg < 4:218938/149‑1 (MQ=255) gAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTg < 6:40177/149‑1 (MQ=255) aaTTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTgg < 5:99134/149‑1 (MQ=255) aaTTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTgg < 7:102984/149‑1 (MQ=255) gAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGAATGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGggt < 7:286345/148‑1 (MQ=255) gAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGAATGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGggt < 7:282448/148‑1 (MQ=255) aa‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTc < 3:170648/137‑1 (MQ=255) aa‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTc > 4:170648/1‑137 (MQ=255) cATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTgggg < 2:286409/149‑1 (MQ=255) cATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTgggg > 1:272789/1‑149 (MQ=255) cATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTgggg > 8:72906/1‑149 (MQ=255) gCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTgcg > 3:18431/1‑148 (MQ=255) tCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGc > 6:105310/1‑149 (MQ=255) ggCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGc < 2:153818/147‑1 (MQ=255) cAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCAt < 2:272789/149‑1 (MQ=255) tCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTggg > 8:24738/1‑124 (MQ=255) tCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTggg < 7:24738/124‑1 (MQ=255) tCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGc > 1:29252/1‑148 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGaa > 6:193943/1‑98 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGaa < 5:193943/98‑1 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTgggg > 3:17368/1‑123 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTgggg < 4:17368/123‑1 (MQ=255) tttGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGcc < 2:288375/146‑1 (MQ=255) tttGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGcc > 1:288375/1‑146 (MQ=255) ttGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCt > 7:101299/1‑149 (MQ=255) gATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTa > 1:11923/1‑149 (MQ=255) aaaTCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTacac > 3:226365/1‑149 (MQ=255) actCGTAGTGTTGATTGGGTGGAGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGGGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTacac < 6:173183/146‑1 (MQ=255) aaTCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTacac < 4:72097/148‑1 (MQ=255) aaTCGTAGTGGGGAGTGGTGGGCGAGTCACAGCGGTTGTGTTGGAGAGGGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTacac < 6:168983/148‑1 (MQ=255) gtgtGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTCTGCTGGTGATCAGAGAATTGAATATGCTTGTGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGACCTTCGCAGGCAAGCCAGCACCGACACCGAGCgtg > 2:287300/1‑149 (MQ=255) gtgGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCgtggt > 5:223532/1‑149 (MQ=255) gtgGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCgtgg < 4:18431/148‑1 (MQ=255) gATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGtggtgg < 5:105310/148‑1 (MQ=255) gATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGa < 2:11923/149‑1 (MQ=255) | ATGAAAATGGACAAGTCCATTTTCAAGGCCATTTTGCTGGCGGTATCTGCGTCGTGGGTGGCGTGGAAAGGGCTTTCGTGGAATTGAA‑‑‑‑GCGCCATCGGCTTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGA > NC_002947/334591‑334883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |