New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 162900 = | 44 (1.470) | 5 (0.180) | 4/278 | 3.4 | 11.5% | coding (934/1494 nt) | scpC | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
? | NC_002947 | 162945 = | 35 (1.230) | coding (889/1494 nt) | scpC | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CACTTCCGGGTGGTTGGAGATTTCCTGCGGGCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACT > NC_002947/162799‑163093 | cACTTCCGGGTGGTTGGAGATTTCCTGCGGGCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGt > 4:77375/1‑149 (MQ=255) gggTGGTTGGAGATTTCCTGCGGGCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGt > 2:171912/1‑149 (MQ=255) ggAGATTTCCTGCGGGCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCt > 7:58301/1‑149 (MQ=255) gagaTTTCCTGCGGGCGTAGCACCAGCTTGGCCTTGTAGCGCTCCAGTTTGACGAACACATCGGCATTTCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTg < 8:34976/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACtt < 8:53691/149‑1 (MQ=255) cGGGCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCg < 8:65911/148‑1 (MQ=255) cGGGCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCg < 2:76424/148‑1 (MQ=255) gggCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCg > 3:93968/1‑147 (MQ=255) gggCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGa < 6:17030/149‑1 (MQ=255) gggCGTAGCACCAGCTTGGCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGAGAGGGTGATCGAGCTGCATGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGa < 8:97062/149‑1 (MQ=255) gCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATg > 7:129420/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGTGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGACCTTAGGAGTACATGGt > 7:116371/1‑147 (MQ=255) tCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTc < 5:43283/149‑1 (MQ=255) cTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCg > 7:142673/1‑148 (MQ=255) gTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACg > 3:150152/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGCCGAACGCATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGa > 3:5220/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGa < 7:71451/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCGAACACATCGGGATTGCGTCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCAGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATc < 7:144318/149‑1 (MQ=255) gCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAgg < 8:142673/148‑1 (MQ=255) cGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCg > 6:39696/1‑149 (MQ=255) cGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCg > 8:47049/1‑149 (MQ=255) cGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCg > 4:70442/1‑149 (MQ=255) aaCACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGca < 7:123154/149‑1 (MQ=255) acaTCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACAt > 5:104264/1‑149 (MQ=255) aTCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATCGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCa > 8:45382/1‑149 (MQ=255) ggcgCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGTAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCa < 5:28449/149‑1 (MQ=255) aGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGTCAATGCTGCCAAt > 8:72530/1‑149 (MQ=255) ggTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGc > 8:144216/1‑149 (MQ=255) gAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCtt < 4:43538/148‑1 (MQ=255) gAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTg < 2:14640/149‑1 (MQ=255) ccGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCgg < 7:83658/149‑1 (MQ=255) gAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCt > 1:109925/1‑149 (MQ=255) taagctTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCttgttg > 1:94154/1‑149 (MQ=255) agctTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCttgttg < 6:104264/147‑1 (MQ=255) ccGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCCCTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTAGTTGGGCATACg > 5:21220/1‑149 (MQ=255) gATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCAt < 5:119545/149‑1 (MQ=255) ggTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGAGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCAct > 2:23187/1‑149 (MQ=255) | CACTTCCGGGTGGTTGGAGATTTCCTGCGGGCGTAGCACCAGCTTGTCCTTGTAGCGCTCCAGGTTGCCGAACACATCGGCATTGCGGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACT > NC_002947/162799‑163093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |