| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,015,893 | Δ1 bp | 100% | intergenic (‑156/+78) | PP_5679 ← / ← PP_4421 | hypothetical protein/aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,015,893 | 0 | A | . | 88.2% | 236.1 / 27.0 | 68 | intergenic (‑156/+78) | PP_5679/PP_4421 | hypothetical protein/aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/4); new base . (32/28); total (36/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | |||||||||||
CTCGTTTGAGTCCACGATGAGATGAATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCT > NC_002947/5015747‑5016041 | ctcGTTTGAGTCCACGATGAGATGAATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACaa > 6:168643/1‑148 (MQ=255) tttGAGTCCACGATGAGATGAATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACaaaaaa > 1:274649/1‑148 (MQ=255) tGAGTCCACGATGAGATGAATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACaaaaaaaa < 5:122469/148‑1 (MQ=255) gAGTCCACGATGAGATGAATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACaaaaaaaaag > 1:16473/1‑148 (MQ=255) atgaATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTCCGGCCTTGTGACCTGATGACAGCGTCTTGGCGTTGAGTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCGCCGAAAGGc > 3:243385/1‑149 (MQ=255) taaaaGCCCGCGCCGGAGACCGGTGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGc > 4:95901/4‑149 (MQ=255) aaTAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCggg < 5:168643/148‑1 (MQ=255) aaTAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCggg < 5:58093/148‑1 (MQ=255) aaGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCtt > 8:197442/1‑148 (MQ=255) gCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAATTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAGCCCGCCTTTAGGCGGGCttt < 4:270637/149‑2 (MQ=255) gCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTaa > 2:93316/1‑148 (MQ=255) cccGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTaaaa < 6:339958/149‑1 (MQ=255) ccGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTTAAAc > 7:292502/1‑149 (MQ=255) ccGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGGCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTaaaa < 4:220592/149‑1 (MQ=255) cACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGaa < 2:274649/149‑1 (MQ=255) aCCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAACGCGGGCTTAAAACg > 3:229607/1‑146 (MQ=255) ggCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCCGCAAAAAGCGGGCATAAAACGAAGAGGGGAAt > 2:317100/1‑148 (MQ=255) gcgGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAg < 1:72629/149‑1 (MQ=255) gggCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTg > 4:281814/1‑149 (MQ=255) 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7:340065/122‑1 (MQ=255) gACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCa > 8:340065/1‑122 (MQ=255) gACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCt > 2:363387/1‑148 (MQ=255) aCCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCtt < 3:95901/147‑1 (MQ=255) gAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTTATGGCTCAGACCTTCAGc > 7:328104/1‑148 (MQ=255) aaaGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCtc > 2:178109/1‑148 (MQ=255) tACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCtcatc > 8:278593/1‑147 (MQ=255) gTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAgg < 4:306166/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGa > 5:25686/1‑149 (MQ=255) tCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAaga < 6:5742/88‑1 (MQ=255) tCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAaga > 5:5742/1‑88 (MQ=255) ttGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGATGGCATCATAACCAACGTTTATGGCTCATACCTTAAGCTAATCAAGGACg > 1:119031/1‑149 (MQ=255) ttGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGAt < 1:202072/119‑1 (MQ=255) ttGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGAt > 2:202072/1‑119 (MQ=255) gtgAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTc < 1:178109/148‑1 (MQ=255) aCTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTACAGCTCATCAAGGACGCAAAGca > 6:194602/1‑148 (MQ=255) atgaCAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCt < 2:16473/149‑1 (MQ=255) gaCAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCCGCACAGCt > 3:50119/1‑149 (MQ=255) cAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCgt < 2:292111/149‑1 (MQ=255) aGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCgt < 1:363387/149‑1 (MQ=255) gTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGc < 6:25686/149‑1 (MQ=255) tGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATg > 1:348187/1‑149 (MQ=255) ggCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATg < 2:40263/148‑1 (MQ=255) ggCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTAAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCACAGCACAGCTTCGTGTGCGATGc > 6:221228/1‑149 (MQ=255) gCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATg < 4:50119/149‑1 (MQ=255) gCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGc < 7:278593/148‑1 (MQ=255) cTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCt > 6:243895/1‑148 (MQ=255) tttGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCt > 1:101523/1‑148 (MQ=255) tttGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGcatcat > 3:216057/1‑80 (MQ=255) tttGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGcatcat < 4:216057/80‑1 (MQ=255) tttGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCtga > 1:99089/1‑149 (MQ=255) tttGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGAGTGCGATGCtga > 1:195445/1‑149 (MQ=255) gATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCtgatg < 3:281814/148‑1 (MQ=255) aTTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCtgatga < 2:99089/148‑1 (MQ=255) aTTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTgatgat > 6:256603/1‑149 (MQ=255) ttGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTgatgat < 5:124651/148‑1 (MQ=255) tgATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGa < 5:243895/149‑1 (MQ=255) gATAGCACTACAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCGTAAAACGAAGAGGGTAATTAAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCCCAGCTTAGTGTGCGATGCTGATGATGc > 2:281469/1‑148 (MQ=255) gATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGAt > 4:42638/1‑149 (MQ=255) gATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGAt > 6:249889/1‑149 (MQ=255) gATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGAt > 2:94380/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaaaaaaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACtt < 1:318317/146‑1 (MQ=255) cAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAg < 3:185669/100‑1 (MQ=255) cAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAg > 4:185669/1‑100 (MQ=255) aaaaaaaaaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGGTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCATCGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCt > 7:274132/1‑149 (MQ=255) | CTCGTTTGAGTCCACGATGAGATGAATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCT > NC_002947/5015747‑5016041 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |