| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 344,045:1 | +T | 10.3% | intergenic (+134/+55) | PP_5440 → / ← PP_t72 | hypothetical protein/tRNA‑Phe |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 344,045 | 1 | . | T | 10.3% | 246.9 / 25.0 | 68 | intergenic (+134/+55) | PP_5440/PP_t72 | hypothetical protein/tRNA‑Phe |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (25/36); new base T (4/3); total (29/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.35e-01 | |||||||||||
TCGGACGAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGAGCTATCTGGGCGACGAGGTGAATTAAATA > NC_002947/343900‑344193 | tCGGACGAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCg < 5:225378/149‑1 (MQ=255) ggACGAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCgg < 8:308717/148‑1 (MQ=255) gACGAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAACAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGt > 2:278803/1‑149 (MQ=255) cGAGTAAGGTTATTAGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGt < 1:305674/149‑1 (MQ=255) gAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCgg < 3:322851/144‑1 (MQ=255) gAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCgg > 4:322851/1‑144 (MQ=255) gAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTc < 3:282593/149‑1 (MQ=255) gAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTc > 2:71394/1‑149 (MQ=255) aGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTAGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAT‑GCGGGTTTCt < 3:330611/149‑1 (MQ=255) gTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCgg > 4:140449/1‑142 (MQ=255) gTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCgg < 3:140449/142‑1 (MQ=255) gTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCtt > 6:46166/1‑149 (MQ=255) gTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGCTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCtt > 4:333045/1‑149 (MQ=255) tAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCtt < 4:23778/148‑1 (MQ=255) aGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCttgtt > 3:31949/1‑149 (MQ=255) ggT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAGAAACCCGC‑‑CTAGTGCGGGTTTTttgttg < 8:44738/149‑1 (MQ=39) ggCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAGAAACCCGC‑‑CTAGTGCGGGTTTTttgt < 1:55016/142‑1 (MQ=39) ggCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAGAAACCCGC‑‑CTAGTGCGGGTTTTttgt > 2:55016/1‑142 (MQ=39) cccGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTc < 3:337147/149‑1 (MQ=255) ccGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAGAAACCCGC‑‑CTAGTGCGGGtttt < 4:220699/135‑2 (MQ=255) ccGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAGAAACCCGC‑‑CTAGTGCGGGtttt > 3:220699/1‑134 (MQ=255) ccGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATAACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCg > 8:328440/1‑149 (MQ=255) cGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCgg < 2:217735/149‑1 (MQ=255) gTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTaa > 2:69273/1‑149 (MQ=255) cTCATTGCGGAGGTTTTCTCGATGGCATGGCTAGCATTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTATTGTTCTTCGACGCAGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCTC‑ACTAG‑GCGTGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACtt < 4:338453/147‑1 (MQ=255) cTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACttt < 1:253209/148‑1 (MQ=255) cTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACt < 1:69273/146‑1 (MQ=255) aTGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGGCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGc < 3:121975/147‑1 (MQ=255) aTGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCaa > 6:267525/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAac > 8:31960/1‑148 (MQ=255) gTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAg > 2:211726/1‑149 (MQ=255) gATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGaa < 7:31960/148‑1 (MQ=255) gATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGCTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGaa < 3:333045/148‑1 (MQ=255) tGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAggtg > 3:70088/1‑149 (MQ=255) ggCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGc < 8:50370/135‑1 (MQ=255) ggCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGc > 7:50370/1‑135 (MQ=255) cTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGAc > 7:223000/1‑149 (MQ=255) cTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGAc < 8:223000/149‑1 (MQ=255) cTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGAc < 5:46166/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGt < 2:191932/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGt > 4:91358/1‑149 (MQ=255) gTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGAAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTTCCCAgaga > 7:212492/1‑137 (MQ=255) tgAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAAccgcc < 3:265771/148‑1 (MQ=255) tcGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGt > 8:233004/1‑132 (MQ=255) tcGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGt < 7:233004/132‑1 (MQ=255) gtgtTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGCTAGTAG‑GCGGGTTTATTGTTTTCGGTTCGGGTACATTTGAAACCACAAGAAGATTAAAGTTGTTGCCAAGAGCCGGAGTCGAACCGCCGACACGAgg > 1:89675/1‑149 (MQ=255) gtgtTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGa < 1:71394/149‑1 (MQ=255) cGACGCCGCTACCAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCaa < 1:123425/148‑1 (MQ=255) cGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAACAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTc < 1:278803/146‑1 (MQ=255) gACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGAttgaaaatc > 5:155319/1‑142 (MQ=255) gACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGAttgaaaatc > 1:279220/1‑142 (MQ=255) gACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATc < 5:267525/149‑1 (MQ=255) ccTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTGAAAATCctcgtgt < 6:155319/149‑5 (MQ=255) ccTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTGAAAATCctcgtgt < 2:279220/149‑5 (MQ=255) cTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTGAAAATCctcgtgtc < 7:328440/149‑6 (MQ=255) aGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTAc < 4:70088/148‑1 (MQ=255) ttAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTc < 6:314251/108‑1 (MQ=255) ttAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTc > 5:314251/1‑108 (MQ=255) aaaaTCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAGCCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACt > 6:195381/1‑148 (MQ=255) aaaaTCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTg < 3:91358/149‑1 (MQ=255) aaaTCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGa < 4:31949/149‑1 (MQ=255) aacaaGAAACCCGC‑‑CTAGTGCGGGTTTTTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGAGCTATCTGGGc > 3:246373/1‑149 (MQ=39) aacaaGAAACCCGC‑‑CTAGTGCGGGTTTTTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGAGCTATCTGGGc > 3:28148/1‑149 (MQ=39) acaaAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGAGCTATCTGGGc > 6:39370/1‑148 (MQ=255) aaaaaaCCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACg < 2:305458/85‑1 (MQ=255) aaaaaaCCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACg > 1:305458/1‑85 (MQ=255) aaaaaCCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGATCCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGAGCTATCTGGGcgacg < 5:195381/149‑1 (MQ=255) aaCCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGAGCTATCTGGGCGACGAgg < 2:89675/149‑1 (MQ=255) g‑gCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGAGCTATCTGGGCGACGAGGTGAATTAAATa < 5:39370/149‑1 (MQ=255) | TCGGACGAGTAAGGT‑‑TTGGCCCGCAGTCTGCTCATGGCTGCGGGTTTCTCGATTGCATGGCTAGCCTTCAGGTTGCGTTGTGAGGTCTCGTGTTCTTCGACGCCGCCTGAAGTTAAAAATCACAGACAACAAAAAACCCGC‑ACTAG‑GCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTCGGGTAACTTTGCAACCACCAGAAGCTTGAAGGTGGTGCCCAGAGACGGAGTCGAACCGCCGACACGAGGATTTTCAATCCTCTGCTCTACCGACTGAGCTATCTGGGCGACGAGGTGAATTAAATA > NC_002947/343900‑344193 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |