| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,497,336:1 | +G | 8.5% | coding (261/765 nt) | PP_5562 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,497,336 | 1 | . | G | 8.5% | 264.9 / 15.7 | 70 | coding (261/765 nt) | PP_5562 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/32); new base G (2/4); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGAAGGCGTGGAAGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTGCGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGG > NC_002947/3497191‑3497484 | cGAAGGCGTGGAAGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGc > 6:234177/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGTGGAAGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGc < 5:234177/148‑1 (MQ=255) aGGCGTGGAAGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCT‑GGTCACCGAGCTgg < 1:20852/149‑1 (MQ=255) aGGCGTGGAAGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCT‑GGTCACCGAGCTgg < 5:76967/149‑1 (MQ=255) tGGAAGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACgg > 8:304810/1‑149 (MQ=255) ggAAGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGgc > 3:334566/1‑149 (MQ=255) aaGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGgcgc < 7:304810/149‑1 (MQ=255) caccacCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgcc > 2:153171/1‑148 (MQ=255) accaccCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgccga < 6:106164/149‑1 (MQ=255) accaccCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgcc > 7:293204/1‑147 (MQ=255) accaccCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgcc > 7:33712/1‑147 (MQ=255) caccCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgccgagc > 5:241177/1‑149 (MQ=255) cccAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgccgagccg < 5:1325/149‑1 (MQ=255) cccAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgccgagcc > 5:38081/1‑148 (MQ=255) cAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgccgagccga > 6:315338/1‑148 (MQ=255) aGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATa > 4:278367/1‑149 (MQ=255) gggCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTa < 6:235173/149‑1 (MQ=255) gggCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTa < 5:150878/149‑1 (MQ=255) gggCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTa < 3:98434/149‑1 (MQ=255) gTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTc < 6:241177/149‑1 (MQ=255) aTGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGgc < 5:25071/117‑1 (MQ=255) aTGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGgc > 6:25071/1‑117 (MQ=255) aTGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGa < 8:33712/148‑1 (MQ=255) ggATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCTGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAgg < 5:315338/149‑1 (MQ=255) ggATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAgg < 3:278367/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTg < 4:334566/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTa < 3:38567/126‑1 (MQ=255) gCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTa > 4:38567/1‑126 (MQ=255) gCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGt > 3:285389/1‑149 (MQ=255) cGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTgg > 3:8680/1‑149 (MQ=255) cTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTGGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGcc > 4:347175/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTggg > 4:249400/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTgg < 4:285389/148‑1 (MQ=255) ttCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTgg < 1:153171/148‑1 (MQ=255) gggTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGAcc > 7:116581/1‑122 (MQ=255) gggTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGAcc < 8:116581/122‑1 (MQ=255) tCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑c < 1:39534/145‑1 (MQ=255) tCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑c > 2:39534/1‑145 (MQ=255) tCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGaa < 2:235326/77‑1 (MQ=255) tCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGaa > 1:235326/1‑77 (MQ=255) tCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCgct > 6:193911/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgccgagc < 4:284636/86‑1 (MQ=255) ttCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGgccgagc > 3:284636/1‑86 (MQ=255) ttCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGaa > 4:334681/1‑120 (MQ=255) ttCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGaa < 3:334681/120‑1 (MQ=255) ccAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTgcgc > 6:134074/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCt > 2:215136/1‑149 (MQ=255) aaCAGTTCGGGGGTGGGGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGcc < 3:113502/149‑1 (MQ=255) gTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGc < 3:249400/149‑1 (MQ=255) cGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAg < 8:293204/148‑1 (MQ=255) cGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAg < 6:38081/148‑1 (MQ=255) gggggTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAg < 1:215136/148‑1 (MQ=255) gggTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTCGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCCCCTTGCAGGTAt < 3:347175/149‑1 (MQ=255) ggtgCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGCTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGc < 5:350243/149‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAggg > 5:282949/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGttt > 7:302444/1‑149 (MQ=255) gCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTGcgga > 5:223255/1‑149 (MQ=255) cGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCt > 5:88259/1‑110 (MQ=255) cGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCt < 6:88259/110‑1 (MQ=255) tACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTGcggacgga > 8:248174/1‑149 (MQ=255) cgttCCAGCT‑GGTCACCGAGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGttt < 2:294972/137‑1 (MQ=255) cgttCCAGCT‑GGTCACCGAGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCCCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGttt > 1:294972/3‑139 (MQ=255) gttCCAGCT‑GGTCACCGAGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTg > 7:117668/2‑139 (MQ=255) gttCCAGCT‑GGTCACCGAGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTg < 8:117668/138‑1 (MQ=255) tCCTGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCg < 4:201794/93‑1 (MQ=255) tCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCg > 3:201794/1‑93 (MQ=255) ccAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTGCGGACGGATCAGc > 5:320660/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTGCGGACGGATCAGc < 4:8680/148‑1 (MQ=255) cTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGc > 3:238614/1‑109 (MQ=255) cTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGc < 4:238614/109‑1 (MQ=255) c‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAgg > 6:5919/1‑118 (MQ=255) c‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAgg < 5:5919/118‑1 (MQ=255) c‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTGCGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTgg > 6:311991/1‑149 (MQ=255) | CGAAGGCGTGGAAGCCCACCACCCAGCGGGTCGGGCTGGTGATGCGGATGACCTGGCCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTT‑CGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTGCGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGG > NC_002947/3497191‑3497484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |