New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1032212 | 57 (1.010) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.8% | coding (306/1137 nt) | PP_0889 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1032289 | 56 (1.040) | coding (383/1137 nt) | PP_0889 | hypothetical protein |
GCCGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACTGGGCCA > NC_002947/1032069‑1032360 | gCCGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTc > 6:173607/1‑149 (MQ=255) cGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCTTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCgg > 3:287100/1‑149 (MQ=255) cGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCgg > 2:343585/1‑149 (MQ=255) gATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTaa < 8:87822/148‑1 (MQ=255) gATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTaa < 3:346340/148‑1 (MQ=255) aTGCCTCCGCCGTCCCTGCCCTCTCCCCTTCGGCGCGCACCGGCCTCCGCACGGACGCGCTGCGGATCCTCCGCGACGGGCGTCTCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGc < 4:287100/149‑1 (MQ=255) aTGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGGGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCACCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAg > 4:292625/1‑148 (MQ=255) tACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAagag > 2:168747/1‑149 (MQ=255) cGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAagag < 7:175429/147‑1 (MQ=255) gCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCg > 5:206391/1‑148 (MQ=255) tCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACt < 3:215431/147‑1 (MQ=255) tCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCACACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTg < 8:266711/148‑1 (MQ=255) ccTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGc > 1:242549/1‑149 (MQ=255) tGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCa > 4:110425/1‑149 (MQ=255) aCGCTCCCCCTCGGAGCGCAACTGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCActg < 2:358818/149‑3 (MQ=255) aCGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACgg < 4:279217/149‑1 (MQ=255) ccccTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAAt < 1:343585/147‑1 (MQ=255) cccTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCTCGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTgg < 1:271247/114‑1 (MQ=255) cccTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTgg > 2:271247/1‑114 (MQ=255) ccTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGc > 7:270138/1‑149 (MQ=255) cgcAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCTCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGccc < 3:110425/148‑1 (MQ=255) aaCGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAggg > 7:103857/1‑149 (MQ=255) gCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCg > 5:220862/1‑147 (MQ=255) gCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGaa < 1:168747/149‑1 (MQ=255) aactctGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAg < 6:153172/146‑1 (MQ=255) gCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTc < 8:193234/144‑1 (MQ=255) gCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTc > 7:193234/1‑144 (MQ=255) ctgctgATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGc > 7:107173/1‑148 (MQ=255) tgctgATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttacc > 4:260576‑M1/1‑77 (MQ=255) tcatcCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCg > 7:343403‑M2/1‑148 (MQ=255) atcCGCGACGGGCGTATCCTCCTCGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggt > 8:270138‑M2/1‑146 (MQ=255) atcCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCgg > 5:173607‑M2/1‑146 (MQ=255) ccGAGACCGGCCTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCCCCCACCCGCCCCGCCACCGCTCACCTTACCTCGTCGGAAAGCAAGACAGTACTGCCCACGGTAATCGGCGTACCCCAGGGCCAACGCCGCTTCCACCTGCAAGACCCgctac > 4:3888/1‑145 (MQ=255) cgACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggt < 3:260576‑M1/149‑86 (MQ=255) aCGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGc < 8:222322/149‑1 (MQ=255) gggCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCtt < 2:242549/149‑1 (MQ=255) aTCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATc > 6:146713/1‑148 (MQ=255) tcctccACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGc < 8:339226/113‑1 (MQ=255) tcctccACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGc > 7:339226/1‑113 (MQ=255) cACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCTCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCAt > 2:220535/1‑149 (MQ=255) cACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGc > 5:109089/1‑118 (MQ=255) cACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGc < 6:109089/118‑1 (MQ=255) cGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcagg < 4:129198‑M1/130‑85 (MQ=255) cGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcagg > 3:129198‑M1/1‑46 (MQ=255) cGAGCGATACACCGCGCCCAGCCGCGCCGCCACCGCGCAGCTGACGTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTATTGGGAGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCGAGCTTCAAGACGCGGTAAGCCGCTTGTCTCCACCCATgc < 3:3888/149‑1 (MQ=255) cgcTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATgcgcgc > 5:168955/1‑149 (MQ=255) tACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCa > 7:327527/1‑110 (MQ=255) tACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCa < 8:327527/110‑1 (MQ=255) tACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCAt > 5:328708/1‑140 (MQ=255) tACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCAt < 6:328708/140‑1 (MQ=255) tACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGccca > 8:198225/1‑149 (MQ=255) acCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGcccaccc > 7:317634/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCCACCCGCACCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGcccaccca < 3:292625/149‑1 (MQ=255) cgcgCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAg < 8:107173/149‑1 (MQ=255) gcgcCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCg < 4:68898‑M2/111‑2 (MQ=255) gcgcCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAgg > 3:29508/1‑149 (MQ=255) gcCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCg > 7:308944/1‑149 (MQ=255) ccACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTg > 6:333443/1‑149 (MQ=255) aCCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCAccc > 5:4192/1‑126 (MQ=255) aCCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCAccc < 6:4192/126‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTgcg > 5:194565/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGtgcg > 3:239324/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGtt < 6:206391/149‑1 (MQ=255) ccACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGAc < 6:168955/149‑1 (MQ=255) ccACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGAc < 5:333443/149‑1 (MQ=255) aCCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACct > 8:329780/1‑149 (MQ=255) cgcgCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACctgc < 6:194565/149‑1 (MQ=255) acctgacctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcg < 3:260576‑M2/149‑65 (MQ=255) acctgacctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGc > 6:260558/1‑136 (MQ=255) cctgacctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcg > 3:129198‑M2/1‑84 (MQ=255) cctgacctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcg < 4:129198‑M2/130‑47 (MQ=255) acctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACTGGGc > 5:362527/1‑149 (MQ=255) aCCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgaggaggatacgcccgtcgcggat > 8:270138‑M1/1‑3 (MQ=255) ccgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcgcggat > 5:173607‑M1/1‑2 (MQ=255) ctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACTGGGc > 1:111211/1‑147 (MQ=255) cgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcgcggatga > 7:343403‑M1/1‑1 (MQ=255) cgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgc < 4:68898‑M1/111‑111 (MQ=255) | GCCGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACTGGGCCA > NC_002947/1032069‑1032360 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |