| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1913196 = | 58 (1.020) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.7% | coding (276/1410 nt) | PP_1712 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1913251 = | 56 (1.040) | coding (221/1410 nt) | PP_1712 | hypothetical protein | |||||
GTAGCGATCCGTGGTCAGCGTGTTGAAATTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTGGGGGTGAAGTGGTCAT > NC_002947/1913049‑1913344 | gTAGCGATCCGTGGTCAGCGTGTTGAAATTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGggccg > 7:15997/1‑149 (MQ=255)gTAGCGATCCGTGGTCAGCGTGTTGAAATTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGggccg > 3:338909/1‑149 (MQ=255) cGATCCGTGGTCAGCGTGTTGAAATTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGgccggccg > 7:135730/1‑149 (MQ=255) gCGTGTTGAAATTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGctcct > 7:149525/1‑148 (MQ=255) ttGAAATTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCa < 5:135733/148‑1 (MQ=255) gAAATTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCCCATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGc > 5:189009/1‑149 (MQ=255) aaTTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTg < 8:15997/149‑1 (MQ=255) aTTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGctc < 6:48243/136‑1 (MQ=255) aTTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGctc > 5:48243/1‑136 (MQ=255) aTTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCa < 6:213201/140‑1 (MQ=255) aTTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCa > 5:213201/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGAc < 8:149525/149‑1 (MQ=255) gCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGAcc > 4:105038/1‑149 (MQ=255) aTTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGc < 1:112723/124‑1 (MQ=255) aTTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGc > 2:112723/1‑124 (MQ=255) gtCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCttt > 5:329776/1‑149 (MQ=255) cAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTgg > 5:87824/1‑149 (MQ=255) aaGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTggg > 7:102547/1‑149 (MQ=255) aaGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTgg < 8:135730/148‑1 (MQ=255) aaGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTgg < 4:338909/148‑1 (MQ=255) aaGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTgg < 6:329776/148‑1 (MQ=255) aaGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATATTGCCGCGGCCGCTTTggg > 5:246191/1‑149 (MQ=255) cccaaggctcttcagcagctacccgtggcccccatcgatctcagttatggccacaaaggccatggccacttcacccaaagCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGc > 2:187324‑M1/81‑133 (MQ=255) cccaaggctcttcagcagctacccgtggcccccatcgatctcagttatggccacaaaggccatggccacttcacccaaagCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGc < 1:187324‑M1/53‑1 (MQ=255) aTGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCttt < 7:1026/137‑1 (MQ=255) aTGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCttt > 8:1026/1‑137 (MQ=255) gcaggcaATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATATTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTtgt < 6:246191/149‑1 (MQ=255) aggcaATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTgg > 3:264969/1‑149 (MQ=255) gcaATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGc > 2:192227/1‑148 (MQ=255) aaTGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCAGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCAATGTTGCCGCGGCCGCTATGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGTCCa > 4:297336/1‑148 (MQ=255) tGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCAt > 3:248317/1‑147 (MQ=255) gAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAAc > 6:329732/1‑149 (MQ=255) aaaCACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACt > 8:21874/1‑148 (MQ=255) aaCACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTga < 7:21874/149‑1 (MQ=255) aaCACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTga < 1:192227/149‑1 (MQ=255) cacTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACt > 7:211771/1‑145 (MQ=255) cacTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACt > 4:166939/1‑145 (MQ=255) cccatcgatctcagttatggccacaaaggccatggccacttcacccaaagCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGc < 1:326728‑M1/56‑1 (MQ=255) cccatcgatctcagttatggccacaaaggccatggccacttcacccaaagCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGc > 2:326728‑M1/51‑106 (MQ=255) tgtgTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATc > 3:33520/1‑148 (MQ=255) tgtAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGAt < 2:195770/149‑1 (MQ=255) tAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATg < 8:211771/148‑1 (MQ=255) cccATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATggg < 8:7354/147‑1 (MQ=255) cccATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATggg > 7:7354/1‑147 (MQ=255) ccATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGAc > 1:123669/1‑78 (MQ=255) ccATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGAc < 2:123669/78‑1 (MQ=255) cATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTg > 6:2343/1‑134 (MQ=255) cATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTg < 5:2343/134‑1 (MQ=255) gTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGTCCATAACTGAGATCGATGGGTGCCACGGGTAgctc > 3:249738/1‑148 (MQ=255) cccAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTTCGCCTCACCACGCGGGTCGTCGACCCCCTGTTGCCGCGGCCGCTTGGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAaga < 7:146830/148‑1 (MQ=25) ccAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTTTGGCCATAACAGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGATGCTGAag > 2:105125/1‑146 (MQ=255) ccAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTTAag < 1:105125/146‑1 (MQ=255) ccAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGc > 1:40593/1‑149 (MQ=255) ccAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGc < 2:40593/149‑1 (MQ=255) ccAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGCGGCAACGGGTAGATGATGAACAGc > 2:279550/1‑149 (MQ=38) gTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCtt < 8:102547/149‑1 (MQ=255) acaTAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTgg < 4:264969/148‑1 (MQ=255) caTAGAAGCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTg < 4:353968/146‑1 (MQ=255) caTAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTgggg < 4:33520/149‑1 (MQ=255) caTAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTgggg < 6:189009/149‑1 (MQ=255) caTAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTg > 3:353968/1‑146 (MQ=255) gAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGAGCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTGGGGGTg > 5:188808/1‑148 (MQ=255) aaCCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTGGGGGGTGag > 1:335536/1‑148 (MQ=255) ccGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGTGCCACGGTGAGCTGCTGATGAGCCTTGGGGGTGAAGt > 6:77842/1‑149 (MQ=255) gggCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTGGGGGTGAAGTgg < 6:87824/149‑1 (MQ=255) ggccggccGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTGGGGGTGAAGTGGt > 3:100963/1‑149 (MQ=255) ccggccgCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGTTGAAGTGGCCATGGCCTTTTTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTTGGGGTGAAGTGGTCa < 3:297336/149‑1 (MQ=255) CGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTGGGGGTGAAGTGGTCAt > 7:103535‑M1/1‑149 (MQ=255) | GTAGCGATCCGTGGTCAGCGTGTTGAAATTGACCATGCCGCTACCATTGAACGTGGTGTCAAGCTTTCCATGTGCGTCCAGGCAGGCAATGAAAACACTGTGTAGCCCATCGGGATCGGTTTGATGCCCAGTCACATAGAACCGGGCCGGCCGCACTTTGCTCCTCAGCACGCTGGTCGTCGACCCCATGTTGCCGCGGCCGCTTTGGGTGAAGTGGCCATGGCCTTTGTGGCCATAACTGAGATCGATGGGGGCCACGGGTAGCTGCTGAAGAGCCTTGGGGGTGAAGTGGTCAT > NC_002947/1913049‑1913344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |