New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3066171 = | 48 (0.850) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 7.6% | coding (305/924 nt) | PP_2678 | hydrolase |
? | NC_002947 | 3066244 = | 51 (0.940) | coding (378/924 nt) | PP_2678 | hydrolase |
CCGCGTTCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCC > NC_002947/3066024‑3066315 | ccGCGTTCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCAtgtg < 4:222087/149‑1 (MQ=255) gtatgcccgcccagccccagcaacctcaggcggtgcccacccacctcatgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTg > 3:97626‑M1/148‑149 (MQ=255) cgcgTTCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGc > 1:101471/1‑149 (MQ=255) tatgcccgcccagccccagcaacctcaggcggtgcccacccacctcatgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGc < 5:67232‑M1/3‑1 (MQ=255) tatgcccgcccagccccagcaacctcaggcggtgcccacccacctcatgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGc > 5:164366‑M1/147‑149 (MQ=255) gcgTTCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCt < 5:309331/149‑1 (MQ=255) cgTTCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTg < 7:277611/149‑1 (MQ=255) ttCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTggg > 5:108810/1‑149 (MQ=255) aTCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCaa < 2:101471/149‑1 (MQ=255) tCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAAc > 7:201884/1‑149 (MQ=255) tgtgGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGAtg > 3:320256/1‑149 (MQ=255) tgggtggtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAATGCTATGGCGTGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCCCCGACAAGC‑CGTTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGAtgt < 1:290327/147‑1 (MQ=255) gtggtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAg > 5:324931/1‑132 (MQ=255) gtggtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAg < 6:324931/132‑1 (MQ=255) gtggtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGcc > 6:237062/1‑149 (MQ=255) gtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGCCCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGAt > 5:211046/1‑149 (MQ=255) gtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGc < 6:356518/145‑1 (MQ=255) gtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGc > 5:356518/1‑145 (MQ=255) gACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTg < 8:201884/148‑1 (MQ=255) tgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCgg < 5:184873‑M1/49‑1 (MQ=255) aaGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCcgc > 5:233636/1‑149 (MQ=255) aGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCcgcg < 6:108810/149‑1 (MQ=255) aGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTgcgc > 5:327783/1‑149 (MQ=255) cATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCGCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGcc > 1:58336/1‑126 (MQ=255) cATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGcc < 2:58336/125‑1 (MQ=255) aTTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGc < 7:41039/149‑1 (MQ=255) aTTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGc < 5:237062/149‑1 (MQ=255) aTTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACACATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCACGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCAGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAg > 8:112008/1‑148 (MQ=255) gcgcAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAg > 5:207535/1‑149 (MQ=255) tcggcatcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAg > 5:147961‑M1/75‑149 (MQ=255) ggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGc > 6:184873‑M1/73‑149 (MQ=255) ggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgcagaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAgg > 1:8308‑M1/73‑148 (MQ=255) aaGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCGGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGa > 5:273827/1‑149 (MQ=255) aaTTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCAc > 6:44080/1‑117 (MQ=255) aaTTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCAc < 5:44080/117‑1 (MQ=255) ccTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTgg < 1:336171/62‑1 (MQ=255) ccTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTgg > 2:336171/1‑62 (MQ=255) ccTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGAGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCgag > 1:19303/1‑148 (MQ=255) tCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCga < 7:297577/145‑1 (MQ=255) tCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCga > 8:297577/1‑145 (MQ=255) cACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACa > 5:34449/1‑149 (MQ=255) aCCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAAc < 4:320256/147‑1 (MQ=255) aaGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCAGATGTGCAGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCg > 6:63590/1‑149 (MQ=255) aGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGc < 6:327783/149‑1 (MQ=255) gC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGcc < 6:34449/149‑1 (MQ=255) ggAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGc > 7:9295/1‑148 (MQ=255) gAGGTGCTGCTGCCCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGAGCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGa > 2:11932/1‑149 (MQ=255) gAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGa > 6:54089/1‑149 (MQ=255) gAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGa > 2:17722/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACt > 1:77491/1‑149 (MQ=255) aCCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCGGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATgcgc < 6:273827/147‑1 (MQ=255) aCCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTTCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCgg < 6:233636/149‑1 (MQ=255) aCCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGc < 5:110181/110‑1 (MQ=255) aCCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGc > 6:110181/1‑110 (MQ=255) ccATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTa > 3:197309/1‑149 (MQ=255) tcCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAggtgg > 3:333104/1‑149 (MQ=255) tcCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAg > 6:64616/1‑145 (MQ=255) tcCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAg < 5:64616/145‑1 (MQ=255) cTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAggtggt < 8:9295/148‑1 (MQ=255) acgattTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGtgct > 2:148107‑M1/7‑148 (MQ=255) tttgtgCTGGGCAACCAGGCCTTTGCGGATGGGCCGATGGGTGCCCTGGCGGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCTACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTTCTGcc < 5:129291/147‑1 (MQ=255) TGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAg > 6:342191‑M1/1‑75 (MQ=255) TGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAg < 5:342191‑M1/75‑1 (MQ=255) | CCGCGTTCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGC‑CGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCC > NC_002947/3066024‑3066315 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |