New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3456775 = | 54 (0.950) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.3% | coding (514/771 nt) | hbdH | 3‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 3456819 = | 55 (1.010) | coding (470/771 nt) | hbdH | 3‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
AGCCAGCGACGGTTGCTTTTCTGCCAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAG > NC_002947/3456629‑3456922 | aGCCAGCGACGGTTGCTTTTCTGCCAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACtggtgg > 6:98960/1‑149 (MQ=255) aGCGACGGTTGCTTTTCTGCCAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGt < 1:118787/149‑1 (MQ=255) gACGGTTGCTTTTCTGCCAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTc < 6:259916/149‑1 (MQ=255) cTTTTCTGCCAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCg < 5:344579/148‑1 (MQ=255) ttttCTTCCAGCTCATCGTGGTGCTGTTGGAGCCGATCGGCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGac < 6:54405/149‑1 (MQ=255) tttCTGCCAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGacc > 7:296149/1‑149 (MQ=255) tGCCAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCt > 2:270998/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTg < 1:270998/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTg < 7:69281/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTGGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTg > 5:366172/1‑149 (MQ=255) agcagATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGt > 6:186892/1‑149 (MQ=255) agcagATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGt < 5:98960/149‑1 (MQ=255) cagATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGt > 8:187540/1‑147 (MQ=255) tgcGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCAc > 8:109078/1‑149 (MQ=255) tgcGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCAc > 4:235672/1‑149 (MQ=255) cgcTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACg < 4:257308/148‑1 (MQ=255) ctgccgggcatgcgcacgcgcaactgggggcgcatcatcaatatcgcttcggtgcatggcctgggcggctcgattggcaaggcagcctacgtggcagccaagcaTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCAt > 4:183411‑M1/105‑149 (MQ=255) ggcatgcgcacgcgcaactgggggcgcatcatcaatatcgcttcggtgcatggcctggtcggctcgattggcaaggcagcctacgtggcagccaagcaTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTgg > 1:134670‑M1/99‑149 (MQ=255) ccGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTgg > 5:159714/1‑149 (MQ=255) cccTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTa < 3:235672/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAgg > 1:132826/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTa > 4:244261/1‑146 (MQ=255) ttGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTa < 3:244261/146‑1 (MQ=255) ggCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGGGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCt < 6:366172/148‑1 (MQ=255) gCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGc > 5:205862/1‑149 (MQ=255) ctgggggcgcatcatcaatatcgcttcggtgcatggcctggtcggctcgattggcaaggcagcctacgtgaaagccaagcaTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATAACGCCATGc < 1:294619‑M1/47‑1 (MQ=255) gCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCtt < 7:655/149‑1 (MQ=255) aCGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGc < 6:159714/149‑1 (MQ=255) aCGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGc < 7:109078/149‑1 (MQ=255) aCGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGc > 8:289143/1‑149 (MQ=255) tcgtcgATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCaa > 2:229787/1‑148 (MQ=255) tcgtcgATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAAt > 6:54268/1‑149 (MQ=255) tcgATCCGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGa < 1:105590/149‑1 (MQ=255) gATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGc > 3:168495/1‑149 (MQ=255) cTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCGTAACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGATGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGa > 7:55498/1‑149 (MQ=255) cTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGAcc < 7:187540/148‑1 (MQ=255) ttGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGc > 7:129112/1‑149 (MQ=255) cACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCAt < 4:106813/149‑1 (MQ=255) aCCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATg > 8:220234/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACAAGGCCATGCa > 8:85116/1‑149 (MQ=255) tCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGc > 6:175956/1‑148 (MQ=255) tCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGc > 2:213561/1‑148 (MQ=255) cAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGa < 7:289143/149‑1 (MQ=255) cACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGatat > 1:152352/1‑149 (MQ=255) cACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGatat < 7:85116/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATAtt < 7:220234/149‑1 (MQ=255) gCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATtgatga > 6:220444/1‑149 (MQ=255) cGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATgc < 8:296149/149‑1 (MQ=255) gggCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTa > 5:188476/1‑92 (MQ=255) gggCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTa < 6:188476/92‑1 (MQ=255) ggCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATgcgc < 1:229787/149‑1 (MQ=255) tatGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGcccc > 5:75741/1‑148 (MQ=255) aTTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTgc < 5:54268/149‑1 (MQ=255) aGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTg > 7:341562/1‑149 (MQ=255) gTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTa > 4:296879/1‑74 (MQ=255) gTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTa < 3:296879/74‑1 (MQ=255) gTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTgcg < 5:175956/149‑1 (MQ=255) tGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTgcg > 2:100449/1‑148 (MQ=255) gTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGcccggaag < 7:52299‑M1/148‑4 (MQ=255) | AGCCAGCGACGGTTGCTTTTCTGCCAGCAGATCGTGCTGCGCTTGCAGCCGATCGCCACCCTTGGCCGCACGATCGTCGATCTGCTTTTGCACCAGCGGTGTCAGCACCCAGCCCGGGCATATGGCATTGCAGGTGACATGACTGGTGGCGGTTTCCAGGCCGACCACCTTGGTCAGGCCGATCACGCCATGCTTGGCTGCCACGTAGGCTGCCTTGCCAATCGAGCCGACCAGGCCATGCACCGAAGCGATATTGATGATGCGCCCCCAGTTGCGCGTGCGCATGCCCGGCAG > NC_002947/3456629‑3456922 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |