New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4383136 = | 46 (0.810) | 5 (0.090) | 3/244 | NT | 9.9% | coding (719/804 nt) | PP_3858 | tail fiber protein |
? | NC_002947 | 4383173 = | 48 (0.900) | coding (682/804 nt) | PP_3858 | tail fiber protein |
ATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACT > NC_002947/4382989‑4383282 | aTCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCa < 2:40215/148‑1 (MQ=255) gcgtcgtgggagcgcgatggctcaaccggcgcagtccaacagtacggtgtgttcaacatggcggcaggccccaatgagcagactatccccttcccggtgagctttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggAGGATgc > 5:91759‑M1/143‑149 (MQ=255) ggAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTAtt < 1:247591/149‑1 (MQ=255) gAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTg < 1:302878/149‑1 (MQ=255) aagaaCGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGca > 4:87387/1‑135 (MQ=255) gtccaacagtacggtgtgttcaacatggcggcaggccccaatgagcagactatccccttcccggtgagctttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGTCGCCGCATCCTCCa > 2:338570‑M1/110‑149 (MQ=255) gtccaacagtacggtgtgttcaacatggcggcaggccccaatgagcagactatccccttcccggtgagctttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCa > 5:180030‑M1/110‑149 (MQ=255) gtacaacagtacggtgtgttcaacatggcggcaggccccaatgagcagactatccccttcccggtgagctttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGTCGCCGCATCCTCCa > 2:333369‑M1/110‑149 (MQ=255) cgtgCTGAACGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGGGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGCATGGTGACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAg < 8:75660/146‑1 (MQ=255) cGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAg < 8:28390/149‑1 (MQ=255) ggCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGt > 6:319978/1‑149 (MQ=255) cTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTg < 1:204450/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTg < 1:125270/149‑1 (MQ=255) tGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTgg > 7:188087/1‑149 (MQ=255) tGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTgg > 4:108812/1‑149 (MQ=255) aaGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTc < 4:326273/149‑1 (MQ=255) aGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGt > 8:291418/1‑147 (MQ=255) ggAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAg > 2:362799/1‑149 (MQ=255) ccATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCcaca > 2:76998/1‑148 (MQ=255) ccATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCcaca > 5:85312/1‑148 (MQ=255) ccATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACAt < 1:362799/149‑1 (MQ=255) acatggcggcaggccccaatgagcagactatccccttcccggtgagctttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCAtcctc > 7:233276‑M1/88‑125 (MQ=255) acatggcggcaggccccaatgagcagactatccccttcccggtgagctttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCAtcctc < 8:233276‑M1/38‑1 (MQ=255) ttCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGc > 4:355019/1‑149 (MQ=255) ccTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCgg > 4:151491/1‑148 (MQ=255) ccTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCgg < 4:190937/148‑1 (MQ=255) cTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCGAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTa < 3:151491/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTa < 1:76998/149‑1 (MQ=255) tGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAg < 6:85312/147‑1 (MQ=255) gCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGaaa < 8:188087/149‑1 (MQ=255) cATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCGACATACCTGCATGCGGTAGGAAAg < 3:108812/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCa > 8:70913/1‑149 (MQ=255) ggTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCg < 7:291418/149‑1 (MQ=255) ggTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGa < 5:319978/149‑1 (MQ=255) gTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGt < 8:155860/97‑1 (MQ=255) tACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCa > 5:119439/1‑149 (MQ=255) ccGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTg > 8:328312/1‑146 (MQ=255) ccGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTg < 7:328312/146‑1 (MQ=255) aGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTgccgc > 1:53856/1‑149 (MQ=255) ggATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTgccgc > 7:33427/1‑148 (MQ=255) gATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCTGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCa > 3:239207/1‑149 (MQ=255) tGGTCACCGAAGAGGTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCGCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATg < 3:272809/149‑1 (MQ=255) tCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGtt > 4:348622/1‑148 (MQ=255) ccGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTgg < 6:51246/129‑1 (MQ=255) ccGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTgg > 5:51246/1‑129 (MQ=255) agagTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAacacac < 3:348622/149‑1 (MQ=255) agagTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAacacac > 8:61014/1‑149 (MQ=255) ttCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTa > 1:54393/1‑149 (MQ=255) gTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTg > 3:162466/1‑149 (MQ=255) tCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAGGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGt > 6:302201/1‑149 (MQ=255) ccACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTg < 2:336164/108‑1 (MQ=255) ccACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTg > 1:336164/1‑108 (MQ=255) cACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGtt < 7:70913/148‑1 (MQ=255) ccGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAGGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGa < 5:302201/149‑1 (MQ=255) gCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACt < 8:33427/149‑1 (MQ=255) cAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTg < 7:78397/144‑1 (MQ=255) cAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTg > 8:78397/1‑144 (MQ=255) | ATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACT > NC_002947/4382989‑4383282 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |