New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5839704 | 53 (0.940) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.0% | intergenic (+81/+22) | yheT/sseA | putative hydrolase/3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
? | NC_002947 | = 5839733 | 44 (0.810) | coding (848/855 nt) | sseA | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
GCCTGCGAAATCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTATGGCAAGCGGTTACCC > NC_002947/5839559‑5839850 | gCCTGCGAAATCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCgg > 6:287864/1‑149 (MQ=255) cTGCGAAATCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCgggg < 3:232399/149‑1 (MQ=255) cTGCGAAATCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCgggg < 5:109569/149‑1 (MQ=255) cGAAATCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCggggg < 2:255152/147‑1 (MQ=255) cGAAATCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGt < 7:19231/148‑1 (MQ=255) aaaTCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTc > 5:246046/1‑148 (MQ=255) aaTCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCaa > 7:41196/1‑149 (MQ=255) gggTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGt < 6:246046/149‑1 (MQ=255) actTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTgt < 4:229029/146‑2 (MQ=255) actTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTgt > 3:229029/1‑145 (MQ=255) ctTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTa > 2:251138/1‑148 (MQ=255) ctTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTAc < 3:237940/149‑1 (MQ=255) ctTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCGGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGTACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCtt < 3:276208/147‑1 (MQ=255) aaCGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGcc > 1:14276/1‑149 (MQ=255) gacgGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGc > 4:19023/1‑137 (MQ=255) gacgGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGc < 3:19023/137‑1 (MQ=255) acgTATTCCGGAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTTCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCTCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTg < 7:178128/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTg < 1:60661/134‑1 (MQ=255) gCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTg > 2:60661/1‑134 (MQ=255) tggtggACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCgg < 1:155556/149‑1 (MQ=255) gtggACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACt < 2:274186/122‑1 (MQ=255) gtggACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACt > 1:274186/1‑122 (MQ=255) gctagcCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCca > 2:169943/1‑149 (MQ=255) gcCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCcactca < 5:287864/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCcactcact > 1:59675/1‑149 (MQ=255) gcgAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTcc < 8:41196/149‑1 (MQ=255) aTTGGTAATGGGTGCGCGCCGCCTGTGGCTGCGGGCATGCCGGCGAACACGGGCTTTGCCGGTGCCACCCACCGGGGGGGTTCAACCGGGTATGCTTAGTCGCTGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCAc < 1:251138/147‑1 (MQ=255) tAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCcac < 8:234267/133‑1 (MQ=255) tAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCg > 5:151651/1‑149 (MQ=255) tAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACACACCGCGGGGGTTCAAACCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCcac > 7:234267/1‑133 (MQ=255) aaaGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCg > 5:100163/1‑148 (MQ=255) cccccTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCGCTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGcc > 3:298752/1‑149 (MQ=255) cccccTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGcc > 6:74757/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAg > 7:219855/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGc < 6:151651/149‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCgg < 4:232721/148‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCg < 8:219855/147‑1 (MQ=255) gAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTAc > 4:324638/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCAACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTAc > 3:31734/1‑149 (MQ=255) gCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCcgcc > 4:13523/1‑149 (MQ=255) aTGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCcgccag < 2:59675/149‑1 (MQ=255) cgcgAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCcgccagcgc > 1:346471/1‑147 (MQ=255) cgcgAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCcgccagcgc > 6:7424/1‑147 (MQ=255) gcgAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTACACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCcgccagcgccag > 4:272641/1‑149 (MQ=255) cGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCAcc < 6:345266/64‑1 (MQ=255) cGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCaaa > 4:89254/1‑147 (MQ=255) gCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAgg > 4:309964/1‑149 (MQ=255) ttGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTa < 5:7424/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTATg > 1:168458/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTATg < 2:346471/148‑1 (MQ=255) ccGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTATg < 2:14276/148‑1 (MQ=255) ttaacctacccaccGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTATGGc < 1:177624/142‑1 (MQ=255) gTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTATGGCaa < 5:74757/149‑1 (MQ=255) gCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCACATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTATGGCAAGc > 8:82302/1‑149 (MQ=255) acccaccGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCg < 6:235782/88‑1 (MQ=255) acccaccGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCg > 5:235782/1‑88 (MQ=255) ccGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCATCGCAAACAGGTTATGGCAAGCGGATAccc < 4:31734/149‑1 (MQ=255) | GCCTGCGAAATCCGGGGTACTACTTGGAACGACGGATTCCGCAGTGGCTGGTGGACGGTAGCTAGCCCGCGAATTGGTAAAGGCTGCGCGCCCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCATTGCCGGTGCCACCCACCGCGGGGGTTCAACCCGGTCTGCTTACTCGCCGGTGGCCACCGCATGCTGCGGGTTGTTGATCCACTCACTCCACGACCCCGCATACAGCTTGCCCAGCGGGTACCCCGCCAGCGCCAGCGCAAACAGGTTATGGCAAGCGGTTACCC > NC_002947/5839559‑5839850 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |