New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5846732 | 62 (1.090) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 4.4% | coding (100/813 nt) | mutM | formamidopyrimidine‑DNA glycosylase |
? | NC_002947 | = 5846766 | 71 (1.340) | coding (66/813 nt) | mutM | formamidopyrimidine‑DNA glycosylase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GACCAGCCGCAGGTTGCCCGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAGGTTTTCGAAA > NC_002947/5846586‑5846880 | gACCAGCCGCAGGTTGCCCGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCa < 4:343865/149‑1 (MQ=255) gACCAGCCGCAGGTTGCCCGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCG > 7:56347‑M1/1‑147 (MQ=255) ccAGCCGCAGGTTGCCCGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAgc > 8:28797/1‑149 (MQ=255) cGCAGGTTGCCCGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGccgccg < 3:64737/149‑1 (MQ=255) tGCCCGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTcgcg > 1:175951/1‑148 (MQ=255) gCCCGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGaa > 3:221221/1‑149 (MQ=255) ccGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAacc > 1:51363/1‑149 (MQ=255) cGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTc > 4:211164/1‑141 (MQ=255) cGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTc < 3:211164/141‑1 (MQ=255) gACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAaccac < 7:28797/149‑1 (MQ=255) aTGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAAccacca > 1:56545/1‑148 (MQ=255) aGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTg < 2:51363/149‑1 (MQ=255) gTGGCGGACCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGa < 8:131895/149‑1 (MQ=255) gATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCcgct < 7:242950‑M2/149‑5 (MQ=255) aTCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCcgctg < 7:39051‑M2/149‑6 (MQ=255) aTCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACAACACGGCTGACCcgctg < 1:38038‑M2/149‑6 (MQ=255) tCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCcgctg > 4:64972‑M2/1‑143 (MQ=255) aGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGggtcagccgtgtggtggttcgcgaccggcggctgcgctggc < 8:154150‑M1/148‑42 (MQ=255) aGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCcgctggcc < 6:285613‑M2/149‑9 (MQ=255) gCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCt < 8:56347/149‑1 (MQ=255) cccACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAg < 8:3808/149‑1 (MQ=255) cACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGgt < 2:175951/149‑1 (MQ=255) aCTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGgtg > 6:88202/1‑149 (MQ=255) aCTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGgtg > 1:117119/1‑149 (MQ=255) ttCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGtgtg > 7:102180/1‑149 (MQ=255) ggCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGgcg < 4:221221/149‑1 (MQ=255) cATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGgcgc > 7:119812/1‑148 (MQ=255) aTTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCaa < 1:245038/149‑1 (MQ=255) ttGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGATGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCaa > 2:312499/1‑148 (MQ=255) gATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAAACGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATAc > 8:190917/1‑149 (MQ=255) cAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACcgc > 6:358095/1‑149 (MQ=255) aCAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGggtcagccgtgtggtggttcgcgaccggcggctgcgctggccga < 1:337597‑M1/126‑45 (MQ=255) aCAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGggtcagccgtgtggtggttcgcgaccggcggctgcgctggccga > 2:337597‑M1/1‑82 (MQ=255) gTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCggg > 6:212836/1‑149 (MQ=255) gTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCggg > 7:23238/1‑149 (MQ=255) tACTTGGCTCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGggt < 8:242950/149‑1 (MQ=255) tACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGggt < 5:358095/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGggtgg < 1:34602/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGACAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGCTGTGCCGCAATACCGCGTCGggagg > 4:171608/1‑149 (MQ=255) ggCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGtt < 2:56545/148‑1 (MQ=255) tCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACtt < 8:119812/149‑1 (MQ=255) tCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTgg > 1:268275/1‑149 (MQ=255) cACGCTGACGATGCGCGGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTgg < 6:305836/147‑1 (MQ=255) gCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAAtt < 7:190917/149‑1 (MQ=255) tGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCt > 3:234081/1‑134 (MQ=255) tGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCt < 4:234081/134‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGTCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCgg < 3:171608/149‑1 (MQ=255) cGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGc < 5:212836/149‑1 (MQ=255) cGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGc < 1:259854/149‑1 (MQ=255) aTGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCAt < 5:88202/149‑1 (MQ=255) cgcTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCAtgt < 5:285613/148‑1 (MQ=255) gcTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCAt > 8:9516/1‑145 (MQ=255) gcTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCAt < 7:9516/145‑1 (MQ=255) gcTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGCCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATgtgt > 5:100457/1‑149 (MQ=255) cccTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAgt > 7:157375/1‑149 (MQ=255) cccTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAgt < 7:22643/149‑1 (MQ=255) tGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTc > 4:204744/1‑149 (MQ=255) aGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGcc > 5:163839/1‑149 (MQ=255) aGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGcc > 4:47902/1‑149 (MQ=255) gCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAAc > 2:322529/1‑149 (MQ=255) acaTCGAGGTCTTCCGGAATCTGCAAGCCCAGCAGCCGGTCGAGAACAACCACACGGCTCACCCACTGGCCTTCCACGTGTCCCGCAAAACCGCGTCGGCTGGTATCTACTTCAGACAATTCCGGCATGTAAAACTGTCAGCCAAACTc > 8:179078/1‑149 (MQ=255) acaTCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTc > 6:233512/1‑149 (MQ=255) acaTCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTc > 7:133990/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTcgc < 8:102180/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTcgcg < 2:38038/149‑1 (MQ=255) ttCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCt > 3:180357/1‑149 (MQ=255) ttCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCt > 4:185017/1‑149 (MQ=255) ccGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTc < 2:268275/146‑1 (MQ=255) ccGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCt < 3:47902/147‑1 (MQ=255) aaTCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGTCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGa < 8:23238/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAg < 1:312499/149‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCcgctggccgattccggaagacctcgatgtgcgtctgtcagggcagcgcatcgtcagcgtggagcgacgcgccaagtacctgt < 1:337597‑M2/126‑83 (MQ=255) tCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCcgctggccgattccggaagacctcgatgtgcgtctgtcagggcagcgcatcgtcagcgtggagcgacgcgccaagtacctgt > 2:337597‑M2/1‑44 (MQ=255) tCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAgg > 3:228824/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCGggtcagccgtgtggtggttcgcgaccggcggctgcgctggccgattccggaagacctcgatgtgcgtctgtcagggcagcgcatcgtcagcgtggagcgacgcgccaagtacctgttgatcaatgccgaagtgggtacgct < 6:285613‑M1/149‑142 (MQ=255) gCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCcgctggccgattccggaagacctcgatgtgcgtctgtcagggcagcgcatcgtcagcgtggagcgacgcgccaagtacctgttgatcaatgccgaagtgggtacgct < 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cAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAGGTTTTc < 8:39051/149‑1 (MQ=255) aGCGggtcagccgtgtggtggttcgcgaccggcggctgcgctggccgattccggaagacctcgatgtgcgtctgtcagggcagcgcatcgtcagcgtggagcgacgcgccaagtacctgttgatcaatgccgaagtgggtacgctgatc < 7:242950‑M1/149‑146 (MQ=255) aGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCCCACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAGGTTTTc > 3:334980/1‑148 (MQ=255) gcAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGTGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAGGTTTTCGaaa < 7:179078/149‑1 (MQ=255) gcAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAGGTTTTCGaaa < 4:334980/149‑1 (MQ=255) gcAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAGGTTTTCGaaa < 5:233512/149‑1 (MQ=255) | GACCAGCCGCAGGTTGCCCGACATGCCCAAGTGGCTGATCAGCGTACCCACTTCGGCATTGATCAACAGGTACTTGGCGCGTCGCTCCACGCTGACGATGCGCTGCCCTGACAGACGCACATCGAGGTCTTCCGGAATCGGCCAGCGCAGCCGCCGGTCGCGAACCACCACACGGCTGACCCGCTGGCCTTCCAGGTGTGGCGCAATACCGCGTCGGGTGGTTTCTACTTCTGGCAATTCCGGCATGTGTCAGTGTCCGCCCAACTCGCGAATGTTCTGCTTGAGGTTTTCGAAA > NC_002947/5846586‑5846880 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |