New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6031192 = | 48 (0.850) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 8.0% | coding (46/1590 nt) | dppA‑IV | dipeptide transport protein |
? | NC_002947 | 6031240 = | 46 (0.850) | coding (94/1590 nt) | dppA‑IV | dipeptide transport protein |
GTGTGGTCATTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGGCGCAAG > NC_002947/6031061‑6031339 | gtgtGGTCATTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGcc > 1:3893/1‑149 (MQ=255) tCATTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTCTTCACAACCCTGTT‑CGCAGCTGGCGCTGCCCAGGccgctccg > 8:212606/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGTCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGccgctccgc < 7:18674/148‑1 (MQ=255) aTTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGccgctccgc < 5:94039/148‑1 (MQ=255) tGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGa < 5:37094/148‑1 (MQ=255) ccGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGc < 6:147672/148‑1 (MQ=255) cggcggGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCTACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGt < 7:29402/149‑1 (MQ=255) ggcgggcgCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGtt < 7:212606/149‑1 (MQ=255) tcggcaccaccttgccttgcgccgcatcgaactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcgggGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGttt < 8:176341‑M1/34‑1 (MQ=255) gcACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCg < 7:294769/149‑1 (MQ=255) tAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAg < 1:6672/142‑1 (MQ=255) tAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAg > 2:6672/1‑142 (MQ=255) cttgcgccgcatcgaactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcgggGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAg > 5:176559‑M1/101‑147 (MQ=255) cttgcgccgcatcgaactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcgggGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAg < 6:176559‑M1/47‑1 (MQ=255) gcgccgcatcgaactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcgggGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGccc > 7:176341‑M1/98‑147 (MQ=255) cTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCATATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGaa < 1:114882/149‑1 (MQ=255) ttttCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAg > 5:112423/1‑149 (MQ=255) ttCCAGACTGCACTGGAAGATGGGCCACTGACAGCCTAGGAGCCACCATGCGTGTCGCAGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAgg < 4:59675/148‑1 (MQ=255) cAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGc < 6:336758/125‑1 (MQ=255) cAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGc > 5:336758/1‑125 (MQ=255) gACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGa > 8:162883/1‑149 (MQ=255) aCTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCg > 2:46216/1‑138 (MQ=255) aCTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCg < 1:46216/138‑1 (MQ=255) cTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACg < 1:180693/149‑1 (MQ=255) tGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCtt > 2:232561/1‑143 (MQ=255) tGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCtt < 1:232561/143‑1 (MQ=255) tccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcgggGCTGgc > 6:219407‑M1/84‑89 (MQ=255) tccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcgggGCTGgc < 5:219407‑M1/6‑1 (MQ=255) cACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGa > 1:12131/1‑110 (MQ=255) cACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGa < 2:12131/110‑1 (MQ=255) aGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTa < 6:112423/149‑1 (MQ=255) aGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTa > 3:235418/1‑149 (MQ=255) ccACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGAACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCg < 5:274973/149‑1 (MQ=255) ccACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCCTGTCGCCGCACTTTACTTATAGATCACCACCCTGTA‑CGCCGCTGGCGCTCCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAATGCTTCGACGTGGTCCAGAACAAATCg > 2:311214/1‑149 (MQ=255) cACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGc > 3:48358/1‑149 (MQ=255) tGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACAACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTca > 5:251170/1‑149 (MQ=255) ggaatgAGCTAGCATGAGTGGGGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTcaccacca < 6:251170/144‑1 (MQ=255) ccAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTc < 6:333839/127‑1 (MQ=255) cAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTGCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTcaccacca > 1:93800/1‑149 (MQ=255) aaGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGTGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTcaccaccac > 2:269853/1‑148 (MQ=255) gAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAAc < 7:312078/149‑1 (MQ=255) accaTGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCAc > 4:184405/1‑149 (MQ=255) caTGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTAGCTCACCACCACCAACGCCAccg > 5:218255/1‑149 (MQ=255) gtgtCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGAc > 8:176453/1‑149 (MQ=255) gcACTTTCCTTTTTGTTCACCACCCTGTT‑CGACGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCtgat < 1:311214/149‑1 (MQ=255) gcACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCtgat > 7:323137/1‑149 (MQ=255) gcACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCtgat < 7:162883/149‑1 (MQ=255) tCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAAc < 3:139433/147‑1 (MQ=255) ttCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGa < 2:93800/149‑1 (MQ=255) accaccCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGtt > 6:307055/1‑149 (MQ=255) ccaccCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTc < 3:184405/149‑1 (MQ=255) caccCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTc > 5:311743/1‑148 (MQ=255) caccCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCg < 8:323137/149‑1 (MQ=255) tt‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGTAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATgcggc > 8:250375/1‑149 (MQ=255) ccgcTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGgcgc > 1:84032/1‑147 (MQ=255) cgcTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGGCgcaag > 1:348810/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGGCgcaag > 3:202936/1‑149 (MQ=255) | GTGTGGTCATTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTT‑CGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGGCGCAAG > NC_002947/6031061‑6031339 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |