New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1670777 = | 61 (1.080) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 5.9% | coding (106/408 nt) | PP_1466 | acyl‑CoA thioesterase |
? | NC_002947 | 1670841 = | 69 (1.290) | coding (170/408 nt) | PP_1466 | acyl‑CoA thioesterase |
GCCGCACCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCGAGAACATGTACCT > NC_002947/1670700‑1670988 | gccgcACCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTg < 5:96050/149‑1 (MQ=255) gccgcACCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTg < 2:296184/149‑1 (MQ=255) ccgcACCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTgg > 1:261066/1‑149 (MQ=255) cgcACCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGt < 6:208531/149‑1 (MQ=255) aCCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGAc > 4:78097/1‑149 (MQ=255) aCCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGAc < 4:214419/149‑1 (MQ=255) aCCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGACCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGAc > 4:286294/1‑149 (MQ=255) ccGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGAcc > 1:327205/1‑149 (MQ=255) gAACTGTCGGTGACCCGCGTTAACAA‑AGCGGTGTTGCCCAATAACACCAACCACCACAACACCCAGTTAGGCGG‑CACCCCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTGGTTAATAGCAGCCAACCGATTATGC‑Cgccggccg > 2:159275/1‑138 (MQ=255) aCTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCgtgt < 4:341300/149‑1 (MQ=255) tCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATGCCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTac > 3:313389/1‑149 (MQ=255) ggTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTaccg > 4:171261/1‑149 (MQ=255) ggTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTacc < 4:337570/148‑1 (MQ=255) ggTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑AACCGCCATGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGACACGCGTTTCTGC‑CGCCTCCCGTTGGTGACCGTGTCTaccg > 8:206720/1‑149 (MQ=255) cccGGGGTACCAATGCCGGGGTGCCCCAATA‑CACCCACCACCACCACCCCCGTGTCGGCGGCCACGGCCCTGGCCTGCAGGTACCATG‑GGGGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTaccgaccg < 8:67444/148‑1 (MQ=255) cccGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTATaccgaccg > 1:278141/1‑148 (MQ=255) ccGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCTCa > 8:233716/1‑149 (MQ=255) ccGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCa > 4:236434/1‑149 (MQ=255) 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ccccAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCACTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTc > 1:73085/1‑149 (MQ=255) cccAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCCTCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTcc > 5:332674/1‑149 (MQ=255) ccAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGAttt > 8:288339/1‑133 (MQ=255) ccAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGAttt < 7:288339/133‑1 (MQ=255) accaccaaccaccaCAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCggg > 2:33160/1‑149 (MQ=255) ccaccaaccaccaCAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGc < 4:222195/149‑1 (MQ=255) ccaaccaccaCAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCcggcgg > 5:266302/1‑144 (MQ=255) ccaaccaccaCAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCcggcgg < 6:266302/144‑1 (MQ=255) ccaaccaccaCAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTc > 4:23406/1‑148 (MQ=255) caccacAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGAtcgt > 6:9834/1‑149 (MQ=255) caccacAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGAtcgt < 3:23406/149‑1 (MQ=255) accacAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCaa > 2:73476/1‑121 (MQ=255) accacAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCaa < 1:73476/121‑1 (MQ=255) acCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCtggt > 7:146180/1‑149 (MQ=255) cccTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCtggtg < 2:73085/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGc > 1:100568/1‑143 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ccGCCCTGGCCTGGATGGACGATGTTTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CTCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAg < 6:332674/149‑1 (MQ=255) gaaacgcgtggcagcgatgaacgacacttcgtccatccaggccagggcggtgccgccTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGAGTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAg > 5:40526‑M2/58‑149 (MQ=255) gCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGt > 3:101252/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGt < 5:9834/149‑1 (MQ=255) cccTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGtt < 4:313389/149‑1 (MQ=255) 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aCGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCGGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGt > 5:216541/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGt < 8:146180/149‑1 (MQ=255) aCGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGt < 1:50144/149‑1 (MQ=255) aCGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGCCGGGCACGATCGTCGAGGTGGGGGGGACGGGGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTCCAGGTGCAGGTGGTGGTGTTTgg > 4:89936/1‑148 (MQ=255) cgTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCga < 3:236434/149‑1 (MQ=255) cgTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCga < 6:216541/149‑1 (MQ=255) cgTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCg > 2:248753/1‑148 (MQ=255) cgTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCg < 1:248753/148‑1 (MQ=255) gTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGa > 5:135071/1‑136 (MQ=255) gTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGa < 6:135071/136‑1 (MQ=255) tttCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCgaga < 4:101252/149‑1 (MQ=255) tgccgccTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCGAGAACAt > 4:12477‑M2/8‑149 (MQ=255) cccgccTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGCTTGGCAATACCAGCCAGCAGGTGCAGGAGCATGTGTTTGTCGAGAACATg > 3:260830‑M2/7‑149 (MQ=255) gccTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCGAGAACATGTAc > 4:341308‑M2/4‑149 (MQ=255) cTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCGAGAACATGTACCt < 8:120167‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCCGCACCGAACTGTCGGTGACCCGCGTTACCAA‑GGCGGTGTTCCCCAATACCACCAACCACCACAACACCCTGTTCGGCGG‑CACCGCCCTGGCCTGGATGGACGAAGTGTCGTTCATCGCTGCCACGCGTTTCTGC‑CGCCTGCCGTTGGTGACCGTGTCTACCGACCGCATCGATTTCAAGCACCCGATTCCGGCGGGCTCGATCGTCGAGCTGGTGGGGACGGTGATCAAGGTTGGCAATACCAGCCTGCAGGTGCAGGTGGATGTGTTTGTCGAGAACATGTACCT > NC_002947/1670700‑1670988 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |