New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1878358 | 46 (0.810) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 6.7% | coding (480/1221 nt) | PP_1684 | transporter |
? | NC_002947 | = 1878392 | 40 (0.730) | coding (514/1221 nt) | PP_1684 | transporter |
TTCTCGGTCATCCTCGGTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTT > NC_002947/1878248‑1878540 | ttCTCGGTCATCCTCGGTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTcgg < 8:22779‑M2/148‑4 (MQ=255) ctcGGTCATCCTCGGTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTcgtcag < 8:192621‑M2/149‑7 (MQ=255) gTCATCCTCGGTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGtt > 2:165368/1‑149 (MQ=255) ccTCGGTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTgg > 2:290869/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTa > 4:35175/1‑149 (MQ=255) ggTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTAc < 3:35175/148‑1 (MQ=255) ggTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTAc < 4:252309/148‑1 (MQ=255) tCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCtt < 1:133195/149‑1 (MQ=255) gggCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCtttt > 7:25540/1‑149 (MQ=255) gCGTGCAGTGCCGGGCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTg > 7:309137/1‑133 (MQ=255) gCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTg < 8:309137/133‑1 (MQ=255) cGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGTCACCCAAGGCCTGATTCAGTTGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCtttggtg < 7:170557/149‑5 (MQ=255) cGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCAGGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTtggt < 8:232641/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCg > 1:175205/1‑149 (MQ=255) cgAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGc < 8:186578/149‑1 (MQ=255) cgAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGc > 2:215944/1‑149 (MQ=255) cgAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGc < 1:165368/149‑1 (MQ=255) aaaaGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCt < 4:292348/149‑1 (MQ=255) aaaaGCGCAGCATCGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGATCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCCGCAGCGTTGCTGGTACTGGCCCGTATGGTGGCGTTCATCATGcc > 7:332481/1‑148 (MQ=255) aGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTc < 1:290869/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCg < 1:132176/140‑1 (MQ=255) gcgcAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCg > 2:132176/1‑140 (MQ=255) gcgcAGCATGGCCATGGGGAGGGCCAGCGCCGCCGGGGCGGTGGGCCATGTCGCCATGTTGGCGGGGACCCAAGGCCTGTTTCAGTGGCTGGGCGGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCg < 4:131706/149‑1 (MQ=255) cgcAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCgt > 2:211606/1‑149 (MQ=255) cagcaTGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCgtct < 7:151751/149‑1 (MQ=255) gCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTctgc < 2:175205/148‑1 (MQ=255) gATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATc < 1:211606/149‑1 (MQ=255) ccgGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGt > 6:60769/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGt < 7:192621/148‑1 (MQ=255) gTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGACTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTg > 1:44041/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAg < 5:60769/149‑1 (MQ=255) gTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGa < 1:215944/149‑1 (MQ=255) gCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTcggcaacatggcgaactggccgaacgacccggcggcgctggcgatccccatggccatgctgcgcttttcggccggcactgcacgcccgaccacaccgaggat < 2:291957‑M2/148‑103 (MQ=255) ccATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTg > 7:44345/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGc > 8:220270/1‑148 (MQ=255) gCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGACTGGTcggcaacatggcgaactggccgaacgacccggcggcgctggcgatccccatggccatgctgcgcttttcggccggcactgcacgcccgaccacaccgagg < 6:51629‑M2/138‑101 (MQ=255) gCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGACTGGTcggcaacatggcgaactggccgaacgacccggcggcgctggcgatccccatggccatgctgcgcttttcggccggcactgcacgcccgaccacaccgagg > 5:51629‑M2/1‑38 (MQ=255) ccGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGgc > 2:145688/1‑149 (MQ=255) ccTGATTCTGTGGCGGGGCGGGTCGGGAGCGTTGCTTGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCATGCCTTTGGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCGCGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGt < 8:332481/149‑1 (MQ=255) ccTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGt > 4:131413/1‑149 (MQ=255) gATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGTCCGTTACCCAGTCACGGCGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTgca < 7:22779/149‑1 (MQ=255) aTTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTgc < 2:44041/147‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTgcacgca > 3:189821/1‑149 (MQ=255) gctgggctggTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAgg > 8:334594/1‑122 (MQ=255) gctgggctggTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAgg < 7:334594/122‑1 (MQ=255) tgggctggTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGc > 7:319421/1‑149 (MQ=255) tggTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTg > 1:15998/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGtt > 3:196166/1‑149 (MQ=255) | TTCTCGGTCATCCTCGGTGTGGTCGGGCGTGCAGTGCCGGCCGAAAAGCGCAGCATGGCCATGGGGATCGCCAGCGCCGCCGGGTCGTTCGGCCAGTTCGCCATGTTGCCGGGCACCCAAGGCCTGATTCAGTGGCTGGGCTGGTCGGCAGCGTTGCTGGTACTGGGCCTTTTGGTGGCGTTCATCGTGCCTTTCGTCTGTCTGCTGCGCGATCGCCCGTTACCCAGTCACGGTGCCGAGCAGACCCTGGGCCAGGCGCTGCGCGAGGCGTGCACGCACTCCGGCTTCTGGTT > NC_002947/1878248‑1878540 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |