New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4266531 = | 55 (0.970) | 8 (0.160) | 6/226 | NT | 15.0% | intergenic (‑73/+73) | PP_3738/galP‑IV | transcriptional regulator VanR/porin‑like protein |
? | NC_002947 | 4266602 = | 43 (0.870) | intergenic (‑144/+2) | PP_3738/galP‑IV | transcriptional regulator VanR/porin‑like protein |
ATCCAGGCGACTTCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGGTGTAGTTCACCTCGGCATC > NC_002947/4266457‑4266744 | aTCCAGGCGACTTCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGcccc > 5:62601/1‑148 (MQ=255) ccaaccggcgcagcttcaacagtgatctcgaccagacgcgcctgatcgtcagctatccgctgaccttgtaggggcgggttcacccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcACCTa > 2:86222‑M2/145‑149 (MQ=255) cAGGCGACTTCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTAc > 8:4469/1‑148 (MQ=255) ggCGACTTCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAg < 1:50617/149‑1 (MQ=255) ttCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGcccc < 7:148191/137‑1 (MQ=255) ttCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGcccc > 8:148191/1‑137 (MQ=255) ttCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAg < 1:321180/143‑1 (MQ=255) ttCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAg > 2:321180/1‑143 (MQ=255) ccAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGc < 3:66271/147‑1 (MQ=255) cAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGa > 6:366432/1‑149 (MQ=255) ataGACATGTGCGGGCATCTTAGGGCATGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAg < 8:294460/137‑1 (MQ=255) aaaGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAg > 7:294460/1‑139 (MQ=255) aaaGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGc < 6:368548/145‑1 (MQ=255) aaaGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGc > 5:368548/1‑145 (MQ=255) aGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCGGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAg < 2:1953/149‑1 (MQ=255) aTGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGa > 2:32851/1‑149 (MQ=255) aTGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGa < 5:274228/149‑1 (MQ=255) aGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACg < 7:94102/148‑1 (MQ=255) ttAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGt > 7:218687/1‑149 (MQ=255) aGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCga < 5:195097/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGt < 7:4469/149‑1 (MQ=255) ctgcAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGaa < 2:201499/149‑1 (MQ=255) ctgcAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCAGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGaa < 7:234734/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGGCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGccc > 1:26694/1‑90 (MQ=255) cAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGccc < 2:26694/89‑1 (MQ=255) gCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTgcg > 7:143677/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTgcgc > 6:78264/1‑149 (MQ=255) gtAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTg > 7:16557/1‑149 (MQ=255) gtAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTg > 1:86222/1‑149 (MQ=255) gtAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTg > 3:303688/1‑149 (MQ=255) gtAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTg > 4:41131/1‑149 (MQ=255) taggtGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTgg > 2:86222‑M1/6‑149 (MQ=255) gcGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTcg < 7:176526‑M1/147‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCt < 2:148998/135‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCt > 1:148998/1‑135 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTcg > 1:40024/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTcgc < 4:303688/149‑1 (MQ=255) acccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTc < 8:124293‑M2/84‑1 (MQ=255) acccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTc < 8:119188‑M2/84‑1 (MQ=255) acccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTc > 7:124293‑M2/64‑147 (MQ=255) acccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTc > 7:119188‑M2/64‑147 (MQ=255) cccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCgt > 7:128637‑M2/63‑141 (MQ=255) cccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCgt < 8:128637‑M2/79‑1 (MQ=255) CC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGcc > 5:366432‑M1/1‑149 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTgcgc > 1:161694‑M2/62‑127 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgcagccggtgccatgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTgcgc < 2:161694‑M2/66‑1 (MQ=255) GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCg < 1:224255‑M1/148‑1 (MQ=255) gCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGtt < 1:32851/149‑1 (MQ=255) ggCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAg > 8:280682/1‑149 (MQ=255) ggCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAg < 5:78264/149‑1 (MQ=255) ggCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAg < 8:143677/149‑1 (MQ=255) ggCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAg < 2:224255/149‑1 (MQ=255) ccgcgaacACCGGCGCAGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCa > 5:83247/8‑147 (MQ=255) cATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGc > 3:7474/1‑149 (MQ=255) cACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGc > 4:78595/1‑149 (MQ=255) cACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGc > 4:83698/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGctc > 5:339752/1‑149 (MQ=255) gcagcCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGaa < 6:83247/146‑1 (MQ=255) cgcCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAg < 2:40024/148‑1 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGgtg < 7:280682/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGgtg < 3:41131/149‑1 (MQ=255) cGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCgg < 5:319960/91‑1 (MQ=255) cGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGCTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCgg > 6:319960/1‑91 (MQ=255) gtgtTCGCGGTTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGGTGTAg < 6:62601/149‑1 (MQ=255) tcgcgggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGGTGTAGTTCa > 8:272870‑M2/17‑149 (MQ=255) ggtgaacccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGGTGTAGTTCACCTCg < 6:339752‑M2/138‑1 (MQ=255) acccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGGTGTAGTTCACCTCGGCATc < 4:7474‑M2/143‑1 (MQ=255) acccgcCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGGTGTAGTTCACCTCGGCATc > 1:196177‑M2/7‑149 (MQ=255) | ATCCAGGCGACTTCCAAAGACATGAGCGGGCATCTTAGCGCAAGCCGAGGGGTTGCTGCAGGCCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCC‑GCGAAGCAGGCAACGCGGAACATGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCCCCTACAAGGTCAGCGGATAGCTGACGATCAGGCGCGTCTGGTCGAGATCACTGTTGAAGCTGCGCCGGTTGGTCGCGTTGTTCAGCCGGATGTTGAGGTTCTTCAAAGCCCCGCTCTGGAAGGTGTAGTTCACCTCGGCATC > NC_002947/4266457‑4266744 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |