New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5864825 = | 55 (0.970) | 4 (0.070) | 3/246 | NT | 7.8% | coding (1326/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 5864867 = | 43 (0.800) | coding (1284/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
CCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGTCGAACCAGGCGCCAGCCAGGAACAGCG > NC_002947/5864719‑5865009 | ccgcgccttggtgctgctggtggtggactgcccttgcgcgctggtgatctcgaccccggttaccatcttcagtggccttgccgccgccgcgcgcaaaggcatcctgATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGCTACACGCCACCCTTGATc > 1:109064‑M1/107‑149 (MQ=255) gccAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACTGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAg > 2:253830/1‑149 (MQ=255) cgcACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTgc < 5:365703/149‑1 (MQ=255) gctggtggtggcctgcccgtgcgcgctggttatctcgaccccggtgaccatcgtcagtggcctggccgccgccgcgcgcaaaggcatcctgATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGAtcagtat > 5:120168‑M1/92‑136 (MQ=255) gctggtggtggcctgcccgtgcgcgctggtgatctcgaccccggtgaccatcgtcagtggcctggccgccgccgcgcgcaaaggcatcctgATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGAt < 6:120168‑M1/48‑1 (MQ=255) ggTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGAt < 2:30764/136‑1 (MQ=255) aaCAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCggcggcggc > 3:88086/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCggccaggcca > 2:297188/1‑149 (MQ=255) cgcCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCAc < 7:281370/149‑1 (MQ=255) gcCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACt > 1:179003/1‑149 (MQ=255) aGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGAc > 4:195260/1‑149 (MQ=255) cACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGa < 5:57771/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCGTCGGTCTGCACTGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATg < 1:253830/149‑1 (MQ=255) gTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGCTGATAGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCg < 7:305229/149‑1 (MQ=255) tCTGCACCGGCTTGCCATGGTTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATGAATGTGTCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTc < 4:153753/149‑1 (MQ=255) tCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTc < 8:136709/149‑1 (MQ=255) aCCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGAc > 3:84782/1‑128 (MQ=255) aCCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGAc < 4:84782/128‑1 (MQ=255) cTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCAc > 2:255895/1‑147 (MQ=255) gCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAgc < 4:88086/148‑1 (MQ=255) gCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAgc < 1:297188/148‑1 (MQ=255) cATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAgcgcg > 6:155791/1‑149 (MQ=255) cATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAACGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAgcgcg > 1:68062/1‑149 (MQ=255) cATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGACAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTCCACGCCACCCTTGATCAGGATCCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGCCGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAgcgcg > 8:290689/1‑149 (MQ=255) gTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACgg < 3:195260/149‑1 (MQ=255) tGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACggg < 7:256083/149‑1 (MQ=255) tGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACggg < 7:149887/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACATGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAgg > 6:364396/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGc > 6:21634/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGCGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGc > 6:347324/1‑148 (MQ=255) cGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGccacc < 5:155791/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACcagca < 4:72189/148‑1 (MQ=255) cAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAgcagca > 2:119267/1‑149 (MQ=255) gCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCAcc > 5:256718/1‑147 (MQ=255) cAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAg < 4:102965/148‑1 (MQ=255) cAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAg > 3:102965/1‑148 (MQ=255) atcctgatcaagggtggcgtgtacctggagggtggccgccaccttgatCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACcagc < 6:120168‑M2/91‑1 (MQ=255) atactgatcaagggtggcgtgtacctggagggtggccgccaccttgatCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATAACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACcagc > 5:120168‑M2/49‑139 (MQ=255) gatcaagggtggcgtgtagctggagggtggccgccaccttgatCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCAAGGCCACTGAAGATGGTAACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCAAGGGCAGTCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCgg > 1:109064‑M2/44‑149 (MQ=255) aaTCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCgg < 2:362895/149‑1 (MQ=255) aagggtggcgtgtacctggagggtggccgccaccttgatCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTaaa > 5:223311‑M2/40‑149 (MQ=255) AAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTaaa > 2:179003‑M1/1‑149 (MQ=255) GTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGTGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAAccc > 1:119267‑M1/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCAGCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCa < 1:29167/149‑1 (MQ=255) ggcggcCACCCTCCAGGTACATGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAg < 5:364396/149‑1 (MQ=255) gcggcCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGt < 8:223917/149‑1 (MQ=255) gcggcCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGt < 7:65961/149‑1 (MQ=255) ggcCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGTc > 8:267029/1‑148 (MQ=255) ccTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCCGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGTCGCACCAg > 3:291844/1‑149 (MQ=255) gTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGTCGAACCAGGCgccag > 8:24847/1‑149 (MQ=255) cacGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCTGTAAACCCAGTCGAACCAGCCgccagcc < 5:347324/148‑1 (MQ=255) cacGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGTCGAACCAGGCgccagc > 3:189515/1‑147 (MQ=255) cGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGTCGAACCAGGCGCCAGCCAgg < 4:189515/149‑1 (MQ=255) cttgagCAGTATGCCTTTGAGCGCGGCGGCGGCCAGGACACTGACGATGTTCACCGGGGTCGATATCACCAGCGAGAACGGTCAGGCCACCACCAGCAGCACCAACGCGCGTTAAACCCAGTCGAACCAGGCGCCAGCCAGGAACAGCg < 2:109064‑M2/143‑1 (MQ=255) tgatCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGt < 1:352642‑M2/116‑1 (MQ=255) tgatCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGAAGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGt > 2:352642‑M2/5‑120 (MQ=255) cAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGTGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCgag > 3:308017/1‑58 (MQ=255) cAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGTGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCgag < 4:308017/58‑1 (MQ=255) | CCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTGACGATGGTCACCGGGGTCGAGATCACCAGCGCGCACGGGCAGGCCACCACCAGCAGCACCAAGGCGCGGTAAACCCAGTCGAACCAGGCGCCAGCCAGGAACAGCG > NC_002947/5864719‑5865009 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |