Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 324,136 | A→T | 5.5% | V35V (GTT→GTA) | PP_0267 ← | ferric siderophore receptor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 324,136 | 0 | A | T | 5.5% | 232.7 / 2.5 | 73 | V35V (GTT→GTA) | PP_0267 | ferric siderophore receptor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/34); new base T (2/2); total (37/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 |
AGCGTGTTGCTGCCGTAATCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATAAAGTGCGAATG > NC_002947/323990‑324281 | aGCGTGTTGCTGCCGTAATCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAAc > 3:49772/1‑149 (MQ=255) gCGTGTTGCTGCCGTAATCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAAcc < 3:345611/149‑1 (MQ=255) tgcCGTAATCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGCCTcc > 3:264318/1‑149 (MQ=255) gcCGTAATCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGTCGGTTACCgccgacag > 6:154456/1‑145 (MQ=255) gcCGTAATCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGTCGGTTACCgccgacag < 5:154456/147‑3 (MQ=255) tAATCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAg > 4:143305/1‑149 (MQ=255) tCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAgtgt > 3:227619/1‑149 (MQ=255) cAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTgtgg > 8:74896/1‑149 (MQ=255) cAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTgtgg > 4:306988/1‑149 (MQ=255) cAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTgtgg > 3:298283/1‑149 (MQ=255) aGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTgtggt < 7:74896/149‑1 (MQ=255) tGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAgtgt > 4:241304/1‑139 (MQ=255) tGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAgtgt < 3:241304/139‑1 (MQ=255) ggAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTggcggcg < 4:49772/148‑1 (MQ=255) ggAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTggcggcg < 8:121000/148‑1 (MQ=255) aGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCa < 8:41341/149‑1 (MQ=255) ttttCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTg < 4:298283/149‑1 (MQ=255) ttCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGc > 1:162276/1‑149 (MQ=255) tCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGc < 3:143305/148‑1 (MQ=255) ccGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAgg < 2:162276/149‑1 (MQ=255) cGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCgg < 3:291427/115‑1 (MQ=255) cGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCgg > 4:291427/1‑115 (MQ=255) cGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGgcg > 4:263750/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCt > 6:206816/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCACATACCGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAAca < 3:226992/149‑1 (MQ=255) cGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAAcagca < 3:234666/149‑1 (MQ=255) gCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACagcagc < 7:49370/149‑1 (MQ=255) cacaTAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACagcagc > 4:85894/1‑148 (MQ=255) tAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAg < 5:206816/149‑1 (MQ=255) gCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGcc > 2:126631/1‑148 (MQ=255) cACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGa < 7:206706/149‑1 (MQ=255) cGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGc < 8:200403/149‑1 (MQ=255) gCGTCCAGGTGCGGGTTGCGCTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGATAACCGACGACTCCGGCAGTGTGCTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGACGCGACAGGCCGAGCGt > 8:63701/1‑148 (MQ=255) cgtggTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAggg < 1:126631/146‑1 (MQ=255) gAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAggg < 3:85894/148‑1 (MQ=255) cGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGa > 5:338618/1‑146 (MQ=255) gggTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGaaa < 6:363683/147‑1 (MQ=255) gggTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGaaa > 5:363683/1‑147 (MQ=255) ggTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGAc > 6:106758/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCa < 3:263750/148‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCTCCTTCTCCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAgg < 5:193493/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAgg < 3:306988/149‑1 (MQ=255) cTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGCGCGTCAGGCGTGAAAGACGGCAGGGTa > 7:281767/1‑148 (MQ=255) tCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCAGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTAc > 2:52136/1‑148 (MQ=255) cACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACaa > 6:214329/1‑149 (MQ=255) aCCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAgg > 4:282917/1‑114 (MQ=255) aCCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAgg < 3:282917/114‑1 (MQ=255) cctTCACCCGCGGGTTGGCCTTCTCGCGTTCGCTGTCAGCGGTAACCGACTACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGAAGCGACAGGCCTTGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATg < 1:52136/149‑1 (MQ=255) ctTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGcc > 6:12297/1‑111 (MQ=255) ctTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGcc < 5:12297/111‑1 (MQ=255) ctTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATgg < 6:338618/149‑1 (MQ=255) ttCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTTGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATggg > 5:212387/1‑149 (MQ=255) cccGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGcaca > 1:254612/1‑149 (MQ=255) ccGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGACAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGCGTGAAAGACGTCAGGGTACAAGCATGGGCACAt > 5:182227/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGa > 2:209290/1‑149 (MQ=255) ttGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGAc < 5:214329/149‑1 (MQ=255) ttGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGAc > 4:50524/1‑149 (MQ=255) tCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACTAGCATGGGCACATCCGGGACgg < 2:254612/148‑1 (MQ=255) ccTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACaa > 5:177426/1‑126 (MQ=255) ccTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACaa < 6:177426/126‑1 (MQ=255) ccTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACggg > 7:36994/1‑148 (MQ=255) cTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCa < 8:36994/149‑1 (MQ=255) ttCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAg > 3:146308/1‑149 (MQ=255) gcgTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCATTGTTGTGGCGGGGGCACTGGCCAGGCTTGCGCTGAAGAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGATAGACGGCAGGGTACATGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGa < 7:63701/148‑1 (MQ=255) cgTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGaa < 3:218008/71‑1 (MQ=255) cgTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGaa > 4:218008/1‑71 (MQ=255) cggagtcgtcGGTTACCGCCGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATa > 4:122398/5‑148 (MQ=255) cTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATAAAg < 5:106758/149‑1 (MQ=255) tGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATAAAGt > 5:16312/1‑149 (MQ=255) tGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATAAAGt > 2:319283/1‑149 (MQ=255) gtcggTTACCGCCGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATAAAGTGCGa < 3:122398/147‑1 (MQ=255) ggTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATAAAGTGCGAATg > 6:343434/1‑149 (MQ=255) ggTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATAAAGTGCGAATg < 5:343434/149‑1 (MQ=255) | AGCGTGTTGCTGCCGTAATCCAGCACATTGGAGGTTTTCACCGTATCGATGGCCTGCGGCACATAACGCACGGGCGTCGAGGTGCGGGTTGCGGTGCTCACCTCCTTCACCCGCGGGTTGTCCTTCTCGCGTTCGCTGTCGGCGGTAACCGACGACTCCGGCAGTGTGGTGGCGGCGGCACTGGCCAGGCTGGCGCTGAACAGCAGCGACAGGCCGAGCGTCAGGGGTGAAAGACGGCAGGGTACAAGCATGGGCACATCCGGGACGGGCAGTTGAAAATAAAGTGCGAATG > NC_002947/323990‑324281 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |