Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,273,232 | C→G | 7.2% | L215F (TTG→TTC) | glcC ← | transcriptional regulator GlcC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,273,232 | 0 | C | G | 7.2% | 206.0 / 2.6 | 65 | L215F (TTG→TTC) | glcC | transcriptional regulator GlcC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/28); new base G (3/2); total (35/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCCCAGCCATCCATACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACTGATGG > NC_002947/4273089‑4273380 | ccccAGCCATCCATACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACcg > 1:218760/1‑149 (MQ=255) ccccAGCCATCCATACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACcg > 7:112967/1‑149 (MQ=255) cccAGCCATCCATACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACcgc > 7:204192/1‑149 (MQ=255) atccatACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CAtgct > 2:93847/1‑149 (MQ=255) atACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGcc > 5:240855/1‑148 (MQ=255) gTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTAGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTCTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATCCTGCCGATCAATCTg > 8:233633/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTgg < 2:218760/149‑1 (MQ=255) gCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCg > 3:336097/1‑149 (MQ=255) cccTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGt > 6:231052/1‑149 (MQ=255) ccTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGtt > 5:321670/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTgcg > 5:142571/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTgcg > 8:346276/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCA‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTgcg < 8:288849/149‑1 (MQ=255) gctgctCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTTGc < 6:321670/149‑1 (MQ=255) gctgctCTTCCTGCTCGATCTCCAGCAAACTGTCGCGTTTGCCGTTGATATGCTCACTGGCCGCCGGCTGCGCCTGGTCGGGCAGTTGTTCGATGACTGCGGGG‑TAGAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTgga < 7:233633/149‑2 (MQ=255) tgctCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCg > 7:32276/1‑149 (MQ=255) ctctTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCgg > 8:4685/1‑148 (MQ=255) ttCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCa < 3:196216/147‑1 (MQ=255) tGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTAc > 6:103607/1‑147 (MQ=255) tGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACaa > 1:278882/1‑149 (MQ=255) cTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACaa < 8:204192/147‑1 (MQ=255) cTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACaa < 7:346276/147‑1 (MQ=255) gATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgtt < 1:110076/147‑1 (MQ=255) tcCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAg < 4:293892/141‑1 (MQ=255) tcCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAg > 3:293892/1‑141 (MQ=255) cccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGAcc > 6:5035/1‑149 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCGACATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGttgttg < 1:93847/146‑1 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttgtt < 8:112967/144‑1 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGa < 7:4685/146‑1 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGAcc > 3:300226/1‑148 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGAcc < 2:335545/148‑1 (MQ=255) cGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttgt > 2:176855/1‑142 (MQ=255) cGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttgt < 1:176855/142‑1 (MQ=255) cGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGa > 8:44304/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCaaa < 5:103607/149‑1 (MQ=255) tGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCaaa > 8:90293/1‑148 (MQ=255) tCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAacac > 3:44764/1‑149 (MQ=255) cgTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGt > 5:302681/1‑149 (MQ=255) gATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTc < 7:90293/148‑1 (MQ=255) tatGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAg < 7:44304/148‑1 (MQ=255) atGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAgg < 8:330442/148‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGa < 6:240855/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGc < 4:336097/149‑1 (MQ=255) cgcccgcTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGAtt < 7:273383/149‑1 (MQ=255) cgcccgcTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGAtt < 4:300226/149‑1 (MQ=255) ccgcTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCa < 7:115921/149‑1 (MQ=255) gcTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCGACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAgg < 8:345785/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTa > 3:264492/1‑149 (MQ=255) gcCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATg > 6:237473/1‑149 (MQ=255) tCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGGTTACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCAc > 1:22197/1‑147 (MQ=255) tCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACGGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCa < 5:5035/148‑1 (MQ=255) cGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGc < 6:302681/149‑1 (MQ=255) gggCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCa > 3:164631/1‑149 (MQ=255) aGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTgg < 2:278882/149‑1 (MQ=255) aGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTgg < 6:142571/149‑1 (MQ=255) gttgttCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTggg < 5:231052/149‑1 (MQ=255) ttgttCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACTCAAACACAGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGt > 1:90676/1‑149 (MQ=255) ccATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGATCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATga > 3:30121/1‑148 (MQ=255) catGCGCGG‑TTGTACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGc > 6:323562/3‑149 (MQ=255) atGCGCGG‑TTGTACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTggg < 5:8036/136‑1 (MQ=255) atGCGCGG‑TTGTACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGcc > 5:279622/2‑149 (MQ=255) atGCGCGG‑TTGTACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGAGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTggg > 6:8036/2‑137 (MQ=255) tGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCt > 5:185771/1‑149 (MQ=255) cgcgG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCa > 6:54096/1‑149 (MQ=255) tACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGAAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGAGACGCCTCACTGAt > 3:322902/1‑149 (MQ=255) cAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACTGATgg > 4:275452/1‑149 (MQ=255) cAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACTGATg < 4:44764/148‑1 (MQ=255) cAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACTGATg < 6:185771/148‑1 (MQ=255) cAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACTGATg < 5:54096/148‑1 (MQ=255) | CCCCAGCCATCCATACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTTGTTCCATGACTGCGCGG‑TACAACCGCG‑CATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACTGATGG > NC_002947/4273089‑4273380 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |