| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,348,705 | A→G | 62.0% | intergenic (‑70/+404) | PP_3820 ← / ← galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,348,705 | 0 | A | G | 62.0% | 34.2 / 88.9 | 92 | intergenic (‑70/+404) | PP_3820/galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (17/18); new base G (29/28); total (46/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 | |||||||||||
TCTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCTCACC > NC_002947/4348590‑4348853 | tCTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGt < 4:192316/148‑1 (MQ=31) cTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTg < 4:179015/148‑1 (MQ=17) cTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTg < 1:288339/148‑1 (MQ=17) tGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTCCACGCTCGTCCCGTCCCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTgg > 1:140805/1‑148 (MQ=12) cATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGc < 1:329765/147‑1 (MQ=17) cATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTgg < 6:231437/146‑1 (MQ=32) aTTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAg > 3:155869/1‑149 (MQ=17) tACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTg < 8:284373/142‑1 (MQ=32) tACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTg > 7:284373/1‑142 (MQ=32) ggTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCAATGGAATACCGTCGCCTT‑TAGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa > 1:301652/1‑148 (MQ=11) gTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACa < 3:89772/149‑1 (MQ=21) ttACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa > 2:335217/1‑146 (MQ=21) ccAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAtc < 7:105562/149‑1 (MQ=34) cAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAtct < 5:155484/149‑1 (MQ=21) aaCGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa > 5:180225/1‑141 (MQ=21) aaCGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa < 6:180225/141‑1 (MQ=21) cGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCAT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTcc > 4:125287/1‑148 (MQ=21) gagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGTTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTATGAACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGAAGCGAGGTAGCAAAGTGGCAAGCGTACAGATCTcc > 6:42059/1‑147 (MQ=11) gagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTcc > 1:8935/1‑147 (MQ=21) gagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTcc > 5:307326/1‑147 (MQ=34) aCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAggg < 2:65146/149‑1 (MQ=21) aCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAggg > 4:82308/1‑149 (MQ=34) cGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACAGTACTACGGCTTCGGCTGACTTATGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TAGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATATCCCAGGGTaa > 1:98796/1‑149 (MQ=11) gCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgc > 7:256882/1‑149 (MQ=21) gCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgc > 8:138439/1‑149 (MQ=21) gCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGGGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTACACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgc < 8:246442/149‑1 (MQ=255) tACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 7:70072/1‑148 (MQ=21) aCTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGa > 2:360491/1‑149 (MQ=21) aCTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGACTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGa > 2:231444/1‑149 (MQ=21) cTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGTACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGAc > 8:150760/1‑149 (MQ=21) gctgcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCtt < 1:335217/146‑1 (MQ=21) gcggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACa > 1:265462/1‑121 (MQ=25) gcggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACa < 2:265462/121‑1 (MQ=25) gcggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGAcc < 4:349004/147‑1 (MQ=21) cggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTc > 1:234062/1‑149 (MQ=21) ggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTcc < 2:98796/149‑1 (MQ=34) gcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCt > 8:39656/1‑149 (MQ=34) gcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCt < 3:82308/149‑1 (MQ=34) aTAACCTGTTCGGCCCTTGGTGTCTCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACACTGGCAAGCGTACATATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTg < 5:42059/148‑1 (MQ=255) tAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTCTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGc < 1:107172/149‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCCCGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTa < 2:234062/149‑1 (MQ=21) ccagTTCCGCCCATGGAGCCGCGGATAACCGCCAC‑TAACTACGGCTACGGCAGACTACTCCACGCTCGTCCAGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGAACAGAACTCCCACGGTAATTCACGCACCCATCCTGCTTAt > 6:72695/4‑149 (MQ=2) ccTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt > 8:194460/1‑149 (MQ=21) cTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATg > 3:277773/1‑149 (MQ=21) cTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATg < 7:194460/149‑1 (MQ=21) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc < 1:236058/147‑1 (MQ=34) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCt > 3:227712/1‑149 (MQ=34) cGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTg < 8:256882/148‑1 (MQ=21) cGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGt > 3:247428/1‑149 (MQ=21) ggCCCTTGGTGGCGCTGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCa < 5:325518/114‑1 (MQ=255) ggCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGt < 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cgcgGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACTCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGGGCGGTAGGACAGTTGCAATCGTACATATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTca < 4:344340/149‑1 (MQ=11) cgcgGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCGTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTca < 5:221274/149‑1 (MQ=21) gcgGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTca > 4:165134/1‑148 (MQ=34) gTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTAGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGTACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGc < 7:150760/149‑1 (MQ=21) ccGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTcc < 8:70072/149‑1 (MQ=21) c‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGc > 3:261410/1‑147 (MQ=21) c‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCaa < 5:59811/149‑1 (MQ=21) c‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCaa < 6:307326/149‑1 (MQ=34) ttACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCg > 7:50847/1‑138 (MQ=21) ttACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCg < 8:50847/138‑1 (MQ=21) actacGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTa > 6:113729/1‑149 (MQ=34) tacGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTAtt > 5:119265/1‑149 (MQ=21) cGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTgg > 4:262909/1‑149 (MQ=21) cGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTg < 2:8935/148‑1 (MQ=21) cGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTgg < 2:301652/149‑1 (MQ=34) ggCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTggg < 4:155869/149‑1 (MQ=21) tCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCttt > 5:358610/1‑149 (MQ=34) cGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCttt < 3:165134/148‑1 (MQ=34) cTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGc > 7:329031/1‑148 (MQ=34) tGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGa > 2:307139/1‑149 (MQ=21) ttCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtg > 5:313588/1‑149 (MQ=21) ttCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCCTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtg > 6:53842/1‑149 (MQ=21) tCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt > 2:100487/1‑149 (MQ=21) cTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGTCGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACTGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTCTGCCTGTCGTATCTTCGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt < 1:263070/148‑1 (MQ=11) cTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt < 6:358610/148‑1 (MQ=34) gCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGc > 8:199266/1‑148 (MQ=21) gCACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGc > 6:47662/1‑148 (MQ=21) gCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGc < 7:239015/148‑1 (MQ=34) gCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGc > 8:239015/1‑148 (MQ=34) cACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTg > 8:145532/1‑129 (MQ=25) cACGCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTg < 7:145532/129‑1 (MQ=25) aCGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAc < 3:342768/149‑1 (MQ=34) gCTCGTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCt < 4:261410/149‑1 (MQ=21) gCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCt > 8:22361/1‑149 (MQ=34) tCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt < 3:197357/140‑1 (MQ=34) tCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt > 4:197357/1‑140 (MQ=34) aTCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCatacccgc > 6:364103/1‑142 (MQ=21) | TCTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCAC‑TTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTT‑TCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCTCACC > NC_002947/4348590‑4348853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |