Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 338,065 | G→T | 5.1% | A168A (GCC→GCA) | PP_0280 ← | amino acid ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 338,065 | 0 | G | T | 5.1% | 293.2 / 3.5 | 90 | A168A (GCC→GCA) | PP_0280 | amino acid ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/48); new base T (3/2); total (40/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGATCGC > NC_002947/337918‑338211 | cagcagCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAggg > 2:176398/1‑149 (MQ=255) gcagcTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCa > 5:86650/1‑149 (MQ=255) cTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGTGCCCTgg > 5:75155/1‑149 (MQ=255) aaGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGTGCCCTGGcca < 6:75155/148‑2 (MQ=255) aGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGTGCCCTGGccagt < 7:337551/149‑4 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCtt > 8:234970/1‑147 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGa < 7:175171/149‑1 (MQ=255) ccTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAg > 5:278425/1‑149 (MQ=255) cACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCa < 4:286154/149‑1 (MQ=255) aCCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAg > 6:127591/1‑149 (MQ=255) ccAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAATATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCTGGCTATGATTGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCGTCAgg < 6:342227/149‑1 (MQ=255) cAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGa < 4:346587/149‑1 (MQ=255) cATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCa < 6:23127/149‑1 (MQ=255) tGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACt > 8:182185/1‑149 (MQ=255) cGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGa > 6:260414/1‑131 (MQ=255) cGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGa < 5:260414/131‑1 (MQ=255) gagaTCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGTCTTGAGCATCAGGATCACTTCGtt > 1:307558/1‑149 (MQ=255) gagaTCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGtt < 2:59921/149‑1 (MQ=255) agaTCACCAGGGAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTg < 8:271693/149‑1 (MQ=255) aTCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCt < 5:127591/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGa > 5:193316/1‑124 (MQ=255) aCCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGa < 6:193316/124‑1 (MQ=255) aCCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTa > 3:169898/1‑149 (MQ=255) gTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCg > 6:117019/1‑149 (MQ=255) gTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCg < 4:258982/149‑1 (MQ=255) gTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCg > 4:234198/1‑149 (MQ=255) gAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGc < 3:353990/148‑1 (MQ=255) cacGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGACCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGc < 1:311318/149‑1 (MQ=255) acGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGcc > 4:122630/1‑149 (MQ=255) cggcgAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATgcg < 6:224182/148‑1 (MQ=255) cggcgAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATgc < 6:278425/147‑1 (MQ=255) cgAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCa < 5:117019/149‑1 (MQ=255) gaagaaGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGa < 4:21317/101‑1 (MQ=255) gaagaaGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGa > 3:21317/1‑101 (MQ=255) aagaagATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGt < 6:304989/118‑1 (MQ=255) aagaagATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGt > 5:304989/1‑118 (MQ=255) 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cACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGgcagc < 7:182185/148‑1 (MQ=255) cACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGgcagc < 2:358378/148‑1 (MQ=255) ccGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCatg < 3:234198/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGt < 6:30472/149‑1 (MQ=255) aggtaggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTa < 5:328316/149‑1 (MQ=255) aggtaggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCAGCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTa < 7:234970/149‑1 (MQ=255) ggtaggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAg < 3:316458/149‑1 (MQ=255) agaggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATc < 4:211184/83‑1 (MQ=255) taggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGaa < 1:192468/149‑1 (MQ=255) ggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAAc < 7:39812/148‑1 (MQ=255) ggtGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAAc < 3:330607/148‑1 (MQ=255) tGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGc > 5:97492/1‑149 (MQ=255) gggCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCa < 2:354595/119‑1 (MQ=255) gggCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCa > 1:354595/1‑119 (MQ=255) gCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGtttt < 1:53891/149‑1 (MQ=255) gCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGtttt < 3:122630/149‑1 (MQ=255) gCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGtttt < 6:86650/149‑1 (MQ=255) 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tgGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCAcgc > 8:192091/1‑149 (MQ=255) tgGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCAcgc < 4:169898/149‑1 (MQ=255) gTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGTCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGa < 2:307558/149‑1 (MQ=255) gCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTAACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATAACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGAGGCAGCATGAAGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGcc > 7:297308/1‑149 (MQ=255) cATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGcc > 4:202301/1‑147 (MQ=255) 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ggTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAAtct > 7:256675/1‑149 (MQ=255) gTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCttt < 6:97492/149‑1 (MQ=255) ctcaaggCCAGTGCCCTGGCCTTGCGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCCCGCGACATACCCAGCGCCAGTGCCGCTTCCATCTCCCCtg > 1:364461/6‑147 (MQ=255) tACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTa < 3:202301/149‑1 (MQ=255) cTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAgg < 5:108589/149‑1 (MQ=255) cTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAgg < 6:171365/149‑1 (MQ=255) cTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAg < 8:187443/148‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCCCTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGa > 3:339554/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGAt > 3:223737/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCAATTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATCCCCACCGCCCGTGCCGCTTAAATCTCACATTTAGTGAt > 8:266405/1‑149 (MQ=255) cAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGATCg > 5:253639/1‑149 (MQ=255) aGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGATCGc < 5:124624/149‑1 (MQ=255) | CAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAAGAAGATTTCCACCGGCAGGTAGGTGCGGGCGATGATGGTACGGGCCATGCCGGTCAGTTCCAGCAGGGTCACGGTACTGGCCAGGGCACTGGCCTTGAGCATCAGGATCACTTCGTTGCTGTACGCCGGCAGGCCGATGCGCGCAGCGCGTGGCAGCATGATGTAGAACAGCGTTTTGCCACGCGACATGCCCAGCGCCCGTGCCGCTTCAATCTCACCTTTAGGGATCGC > NC_002947/337918‑338211 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |