| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,635,581 | C→T | 92.5% | G59S (GGC→AGC) | uvrY ← | BarA/UvrY two‑componenent system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,635,581 | 0 | C | T | 92.5% | 185.6 / 2.2 | 65 | G59S (GGC→AGC) | uvrY | BarA/UvrY two‑componenent system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/3); new base T (29/31); total (31/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCCTGCACCCTTGGTCAGGTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCCGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTAC > NC_002947/4635435‑4635719 | gCCTGCACCCTTGGTCAGGTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTgg < 6:324868/149‑1 (MQ=255) tGCACCCTTGGTCAGGTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCa > 5:26419/1‑149 (MQ=255) cACCCTTGGTCAGGTAGCCGGCAGCGCCCGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCAtt > 1:201600/1‑149 (MQ=255) ttGGTCAGGTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTca > 2:259478/1‑148 (MQ=255) tGGTCAGGTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTcaca > 7:30512/1‑149 (MQ=255) tCAGGTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCAcatc > 3:32479/1‑148 (MQ=255) gTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCAcatc‑cat > 5:76202/1‑147 (MQ=255) gTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCAcatc‑cat > 7:340974/1‑147 (MQ=255) gTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCATGAGGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCCGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCAcatc‑cat > 5:302381/1‑147 (MQ=255) gCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGGCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGca < 7:76917/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTAGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGca > 1:210377/1‑148 (MQ=255) aGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATCTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTCGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCAAAACGt > 1:142677/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTc < 2:346098/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGt < 6:26419/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGtt < 2:210377/149‑1 (MQ=255) ccTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTc < 4:32479/149‑1 (MQ=255) cTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGttt > 5:200779/1‑147 (MQ=255) caaGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTccc > 4:10309/1‑149 (MQ=255) gCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCCGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCgg‑g > 5:274762/1‑149 (MQ=255) tgGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAg < 2:201600/148‑1 (MQ=255) gggAACGGGTCTTCCTGGGAGTACGTGACGGGCTCTACCTTGATTTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGTC‑TCCCGGCCGCCGATGCTTGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGttt < 2:142677/149‑1 (MQ=255) gggAACGGGTCTTCCGCGCTCACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCGGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGttt < 6:302381/149‑1 (MQ=255) ggAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTc < 8:219492/149‑1 (MQ=255) aCGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGt < 6:69686/149‑1 (MQ=255) aCGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGt < 4:303980/149‑1 (MQ=255) gggTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATCGCGAAAGCACAACGTACGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCCGTg > 1:120040/1‑149 (MQ=255) gTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGcc > 6:333297/1‑148 (MQ=255) gTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGcc > 7:146292/1‑148 (MQ=255) gTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCg > 7:81826/1‑149 (MQ=255) gTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCACGGCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGcc > 3:112405/1‑148 (MQ=255) ccTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCCAACCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTc > 1:107000/1‑149 (MQ=255) cTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCTCAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGc < 1:250147/149‑1 (MQ=255) tCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGcc > 1:185867/1‑149 (MQ=255) tCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCCGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGcc > 2:74176/1‑149 (MQ=255) cacaCCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGa < 8:340974/149‑1 (MQ=255) acCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAAtc < 8:146292/149‑1 (MQ=255) cGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAAtctc < 3:10309/149‑1 (MQ=255) aCTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCCGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTcacccac < 6:274762/149‑1 (MQ=255) cTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTcacccac > 1:212196/1‑148 (MQ=255) tACCTTGATGTCAGGTTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CAACAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACccacca > 1:113653/1‑149 (MQ=255) ccTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCaccacc > 6:191440/1‑149 (MQ=255) gTCAGGGTGGCTGAGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGc > 2:29538/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGcc > 2:184588/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGcc > 7:213074/1‑149 (MQ=255) gcAGGGTGGCTGCGCACCATTTTGCGGGGGGCC‑CCCACGCCGCCGATGCCGGGCATTTTCACAAC‑CATCACCACAACGGCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAg < 4:112405/145‑1 (MQ=255) ggTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAAtc < 6:174310/121‑1 (MQ=255) ggTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAAtc > 5:174310/1‑121 (MQ=255) ggTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTc > 2:244337/1‑148 (MQ=255) ggTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCg < 1:29538/149‑1 (MQ=255) ggCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCAGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATg < 6:152380/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGGATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGt > 1:257024/1‑149 (MQ=255) gcagcaGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGcc < 1:259478/149‑1 (MQ=255) cagcagTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCa < 2:112238/149‑1 (MQ=255) tttGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATcc < 8:81826/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCgt < 2:107000/148‑1 (MQ=255) cGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCgtg < 2:212196/148‑1 (MQ=255) ggTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCCGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCCCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTaa < 1:74176/149‑1 (MQ=255) gTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAAt < 1:184588/149‑1 (MQ=255) gCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATAcc < 1:244337/149‑1 (MQ=255) gCC‑TCCAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATAcc < 8:30512/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTc < 2:113653/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTc < 6:200779/149‑1 (MQ=255) gccgccGATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTa < 8:213074/149‑1 (MQ=255) ccgccgATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTAc < 6:76202/149‑1 (MQ=255) cgATGCTGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGGAGCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACATGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTAc > 1:93272/1‑146 (MQ=255) | GCCTGCACCCTTGGTCAGGTAGCCGGCAGCGCCGGCCTGCAACAAGCGTGTGGGGAACGGGTCTTCCTCGCACACCGTCACCGCCACTACCTTGATGTCAGGGTGGCTGCGCAGCAGTTTGCGGGTGGCC‑TCCAGGCCGCCGATGCCGGGCATTTTCACATC‑CATCAGCACAACGTCCGGTTTCAGCTCCCGG‑GCCAGTTTCAGTGCCGACTCGCCGGAATCTCCCTCACCCACCACCTGCAGGCCGTCGATGTCGGCCAACATCCGTGTAATACCGGTTCGTAC > NC_002947/4635435‑4635719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |