Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,668,407 | G→A | 5.7% | L93L (CTG→CTA) | nuoM → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,668,407 | 0 | G | A | 5.7% | 207.1 / 2.1 | 70 | L93L (CTG→CTA) | nuoM | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/37); new base A (2/2); total (31/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.77e-01 |
GTGGCTGTGGGGTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGTTCTTC > NC_002947/4668260‑4668551 | ctggctgtggGGTACCTGCGACTACACCGTTGCTCCCGCCCCGGGCTCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTg < 6:355885/147‑1 (MQ=255) gctgtggGGTACCGGCGACTACACACTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGACTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTCGACGGCCTGTCCCTGCTCATGATCCTg > 5:355885/1‑145 (MQ=255) tgtggGGTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCAcc > 6:91000/1‑149 (MQ=255) tggGGTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCg < 5:116718/148‑1 (MQ=255) ggggTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGc < 4:330158/149‑1 (MQ=255) gggTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGcc > 7:78654/1‑149 (MQ=255) gTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTg > 1:351068/1‑149 (MQ=255) cGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCg < 4:170159/149‑1 (MQ=255) cGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCg < 8:310474/149‑1 (MQ=255) gCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGgt < 6:293723/149‑1 (MQ=255) cGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGgtg < 2:351068/149‑1 (MQ=255) gACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGG‑CCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGtgtg < 8:30098/149‑1 (MQ=255) cacCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGt > 5:218159/1‑149 (MQ=255) cacCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGt > 5:245144/1‑149 (MQ=255) cacCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCGCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGt < 7:77907/149‑1 (MQ=255) cTTGCTCCCGCCCCGGTCGCCTAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGt < 6:209690/149‑1 (MQ=255) cTCCCGCTCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACt < 1:82502/148‑1 (MQ=255) cTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGACTACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCATCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACt < 5:142878/148‑1 (MQ=255) tCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACtgt > 7:79612/1‑149 (MQ=255) tCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACtgt > 7:260255/1‑149 (MQ=255) ccGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGGGGATCAAGCGTGTCGGCATCAGCATCCCCAAGGCCCTGGACGGACTGTCGATGATGATGATCCTGCACAACGAGCAGCCCGgtgacaa > 3:214458/1‑132 (MQ=255) ccGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTg > 5:292366/1‑149 (MQ=255) gcgcCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGaaa < 6:292366/149‑1 (MQ=255) gcgcCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGaaa < 2:10823/149‑1 (MQ=255) gcCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAaga < 5:91000/149‑1 (MQ=255) ggCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCAc < 8:260255/148‑1 (MQ=255) tcGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGaaa > 3:344996/1‑128 (MQ=255) tcGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGaaa < 4:344996/128‑1 (MQ=255) tcGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACCGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCAGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGc > 2:328989/1‑149 (MQ=255) gAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGctt < 3:208841/149‑1 (MQ=255) aTACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGcttct < 8:79612/149‑1 (MQ=255) gTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCt < 8:78654/149‑1 (MQ=255) gTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCACCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCt > 1:201028/1‑149 (MQ=255) gAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCaa > 4:237590/1‑149 (MQ=255) gttCAAGCGTTTGGGCATCAGCATCCTCGTGGGCCTGGACGGCGTGTCGCTGCTGATGTTCCTGCTCACCGGCCTGCTCGTTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCttcttc < 3:278741/134‑1 (MQ=255) gATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGa > 8:77961/1‑149 (MQ=255) gATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCACGGAGTGCTGACGGAACTGTGTTCCTGGAAAGAGATAAAGCGCCACGTCCGCttcatc > 4:278741/1‑136 (MQ=255) tCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTACTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGAtg > 2:12522/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTTTCGGCATCAGCATACACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCATGCTCGGTGTGCTGTCGGTAATGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCCGATTCTTCCACCTCAACCTGaag > 2:169635/1‑147 (MQ=255) aGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGAtgtg > 4:93117/1‑148 (MQ=255) aGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTgg < 2:201028/149‑1 (MQ=255) gCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGa < 7:77961/149‑1 (MQ=255) tttCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATcc > 2:160758/1‑149 (MQ=255) cGGCAACAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTc < 3:114823/148‑1 (MQ=255) ggCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTcg < 3:237590/148‑1 (MQ=255) tCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCggcggc > 6:281442/1‑149 (MQ=255) gCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGt < 7:292377/148‑1 (MQ=255) gCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGt > 8:292377/1‑148 (MQ=255) gCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTg > 8:220149/1‑149 (MQ=255) ccACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCg > 5:310498/1‑149 (MQ=255) aCCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGgt < 3:93117/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGgt < 7:220149/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGgt < 5:281442/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGgtgt < 6:245144/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACCGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTCCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGtt < 6:218159/149‑1 (MQ=255) ccTCGACGGCCTGACGCTGCTCATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTCTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTCGATCCTCGGCCGCGTCGTCGGTGTGTTcc > 8:130600/1‑149 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCt > 8:197166/1‑149 (MQ=255) aCGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTACTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCGGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGcc < 1:12522/149‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAcct > 4:15972/1‑149 (MQ=255) tCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAc < 1:160758/147‑1 (MQ=255) cGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAcctg < 7:197166/149‑1 (MQ=255) gctgctGATGATCCTACTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTc < 3:105467/133‑1 (MQ=255) gctgatGATGATCCTACTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGATTCTTCCAACTCAACCTGATGTGGATCCTCGCCCGCTTGGTCGGTGTGTTc > 4:105467/1‑133 (MQ=255) tgctgATGATCCTGCTCACCGGCCTGGTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGATAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCATCCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAcctgttc < 7:130600/149‑1 (MQ=255) ctgATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAcctgttcct > 7:145014/1‑149 (MQ=255) atgatCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAcctgttcctgt < 7:4001/148‑1 (MQ=255) atgatCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGAcctgttcctgt > 8:294768/1‑148 (MQ=255) gatCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTgg < 5:83273/134‑1 (MQ=255) gatCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTgg > 6:83273/1‑134 (MQ=255) tCCTGCTCAGCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGTTCTGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGttcttc < 1:169635/149‑1 (MQ=255) tCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGttct > 6:151919/1‑147 (MQ=255) tCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGttct < 5:151919/147‑1 (MQ=255) | GTGGCTGTGGGGTACCGGCGACTACACCCTTGCTCCCGCCCCGGGCGCCGAACCGGCCTGGGCTCTCGAATACAAAGTCGAGTGGATCAAGCGTTTCGGCATCAGCATCCACCTGGCCCTGGACGGCCTGTCGCTGCTGATGATCCTGCTCACCGGCCTGCTCGGTGTGCTGTCGGTACTGTGTTCCTGGAAAGAGATCCAGCGCCACGTCGGCTTCTTCCACCTCAACCTGATGTGGATCCTCGGCGGCGTGGTCGGTGTGTTCCTGGCCCTGGACCTGTTCCTGTTCTTC > NC_002947/4668260‑4668551 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |