Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,825,791 | A→G | 6.2% | F1800S (TTC→TCC) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,825,791 | 0 | A | G | 6.2% | 189.2 / 2.3 | 64 | F1800S (TTC→TCC) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/30); new base G (2/2); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.75e-01 |
GTCAGCACGAAGAAGTGCTCGCGCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTCCACGTGCAGGGTGCC > NC_002947/4825644‑4825939 | gTCAGCACGAAGAAGTGCTCGCGCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGaa < 5:10234/149‑1 (MQ=255) aGCACGAAGAAGTGCTCGCGCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTc < 8:296784/149‑1 (MQ=255) aCGAAGAAGTGCTCGCGCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTg > 7:140779/1‑149 (MQ=255) gaagaaGTGCTCGCGCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGGCGGAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGc > 5:262871/1‑148 (MQ=255) agaagTGCTCGCGCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCCGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAg > 5:299606/1‑149 (MQ=255) cTCGCGCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGAt < 2:266619/149‑1 (MQ=255) cgcgCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATg > 8:66402/1‑148 (MQ=255) gcgcTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATg > 1:1011/1‑147 (MQ=255) gTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGc > 4:289839/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCt < 5:335833/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCt < 2:199083/149‑1 (MQ=255) ccTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCt < 2:1011/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCgg < 1:167906/148‑1 (MQ=255) caggcaggCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCa < 8:140779/149‑1 (MQ=255) aggcaggcGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCAc > 5:13727/1‑149 (MQ=255) gcgcgcAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTg > 7:11830/1‑149 (MQ=255) cgcgcAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTgg < 6:347947/149‑1 (MQ=255) cgcAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTa < 8:11830/149‑1 (MQ=255) agcagcGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACgg > 6:221877/1‑149 (MQ=255) cagcGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGaa > 3:320635/1‑96 (MQ=255) cagcGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGaa < 4:320635/96‑1 (MQ=255) cccccGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGt > 2:19425/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCCGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTg < 6:262871/148‑1 (MQ=255) cAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCCGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTg < 6:299606/148‑1 (MQ=255) aGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTggg < 1:253004/149‑1 (MQ=255) gAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACg > 4:334873/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTg > 6:32246/1‑136 (MQ=255) cTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTg < 5:32246/136‑1 (MQ=255) cTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTgc < 5:249705/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTgc < 5:144654/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTgcgc > 5:172067/1‑148 (MQ=255) gTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTgcgc > 3:303247/1‑148 (MQ=255) gTGCGCCTGGTCGTAGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTgcgc > 7:310356/1‑148 (MQ=255) tGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTgc > 3:106862/1‑145 (MQ=255) tGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTgc < 4:106862/145‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCaa < 5:221877/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGtt > 4:222048/1‑149 (MQ=255) tcgtcgGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGCGGATGAAGTATTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGATTTCTTCGGCCACGCACTGTTACGGAACGCCGTCCATGCTGGGGAACTTGTTGCGCAAGGTTTctt > 1:88614/1‑147 (MQ=255) ggCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCa > 2:333389/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCAc > 1:307373/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCAc > 2:121850/1‑149 (MQ=255) aGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGAt < 7:66402/149‑1 (MQ=255) ttgttgCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGAt > 7:8856/1‑147 (MQ=255) gttgCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAgc > 7:279142/1‑149 (MQ=255) gCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTg < 8:198666/107‑1 (MQ=255) gCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTg > 7:198666/1‑107 (MQ=255) aaaCGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTg < 4:303247/149‑1 (MQ=255) gCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAgcgc < 2:88614/148‑1 (MQ=255) ggcaggcaTCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGc < 3:289839/149‑1 (MQ=255) gcaTCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGaa < 1:121850/149‑1 (MQ=255) caTCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGt < 7:46515/69‑1 (MQ=255) caTCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGt > 8:46515/1‑69 (MQ=255) caTCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGGACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAg < 2:307373/149‑1 (MQ=255) caTCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGGCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAg > 8:128291/1‑149 (MQ=255) cGTCTGACAAAGC‑GCTGGAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGc > 1:150417/1‑131 (MQ=255) cGTCTGACAAAGC‑GCTGGAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGc < 6:258666/131‑1 (MQ=255) cGTCTGACAAAGC‑GCTGGAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGc > 5:258666/1‑131 (MQ=255) cGTCTGACAAAGC‑GCTGGAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGc < 2:150417/131‑1 (MQ=255) gTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGt < 6:172067/149‑1 (MQ=255) gTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGt < 8:310356/149‑1 (MQ=255) tCTGCCAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTc > 2:236793/1‑149 (MQ=255) gACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTc > 6:297470/1‑146 (MQ=255) gACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTc < 5:297470/146‑1 (MQ=255) gACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTCCAc > 5:12124/1‑149 (MQ=255) aaaGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTCCACGTg > 8:171652/1‑149 (MQ=255) gc‑gcTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTCCACGTGCAg < 7:128291/149‑1 (MQ=255) c‑gcTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTCCACGTGCAgg < 8:279142/149‑1 (MQ=255) aaGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTCCACGTGCAGGGTGcc > 7:9082/1‑149 (MQ=255) aaGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTCCACGTGCAGGGTGc < 7:171652/148‑1 (MQ=255) | GTCAGCACGAAGAAGTGCTCGCGCTCGTTGGCCTTGACCAGGCAGGCGCGCAGCAGCGGCCCCCGCTCCAGGTCGAAGGGCTGGTGCGCCTGGTCGTCGGCCAGTTGTTGCAAACGTTGCTGGCAGGCATCGTCTGACAAAGC‑GCTGAAGTCTTGCCAGTCCAGATGCAGGCCGCTGTCTTCGGCCACGCACTGGTACGGCACGCCGTCGATGCTGGGGAACGTGGTGCGCAAGGTTTCGTGGCGCACGATCAGCGCCTGCAGCGCACGCTCGAAGGCGTCCACGTGCAGGGTGCC > NC_002947/4825644‑4825939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |