Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,826,282 | G→T | 5.8% | I1636I (ATC→ATA) ‡ | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,826,282 | 0 | G | T | 5.8% | 223.4 / 3.2 | 69 | I1636I (ATC→ATA) ‡ | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/32); new base T (2/2); total (35/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.92e-01 |
GCTTCGAACAGGGCCTTGAGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAGTTGCGCCGGCACCATG > NC_002947/4826136‑4826429 | gCTTCGAACAGGGCCTTGAGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGa < 2:320844/148‑1 (MQ=255) gAACAGGGCCTTGAGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCcg > 5:282960/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGCCTTGAGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGAt < 8:269088/143‑1 (MQ=255) aaCAGGGCCTTGAGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGAt > 7:269088/1‑143 (MQ=255) ggCCTTGAGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCt > 6:235375/1‑149 (MQ=255) gCCTTGAGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCtg < 1:288215/149‑1 (MQ=255) aGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGCCCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGttgttg < 8:219496/149‑1 (MQ=255) gCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGc > 7:105504/1‑149 (MQ=255) gCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCg < 5:235375/149‑1 (MQ=255) cTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCgg > 4:174042/1‑149 (MQ=255) cTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCgg > 3:151666/1‑149 (MQ=255) gACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGTCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCTGTTc > 6:20492/1‑149 (MQ=255) gACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGtt < 3:151827/148‑1 (MQ=255) aCATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCg > 1:78788/1‑149 (MQ=255) aTCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTg < 4:346200/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTg‑‑‑g < 8:316659/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTg‑‑‑g < 3:174042/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATACAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTg‑‑‑g > 2:199038/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCt < 8:195632/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCg < 2:78788/149‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGc > 1:240094/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCAc > 6:185332/1‑149 (MQ=255) tGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACgc > 7:116212/1‑149 (MQ=255) cgAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACgctg‑ct < 5:204516/149‑1 (MQ=255) cgAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACgctg‑ct < 5:185332/149‑1 (MQ=255) gAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGctg‑ctg > 7:133259/1‑149 (MQ=255) gATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GATCGACATGCTCACGCTG‑CTGcccaa > 7:196171/1‑146 (MQ=255) tGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTgg < 4:133885/149‑1 (MQ=255) ggTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑Gc < 3:324515/118‑1 (MQ=255) ggTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑Gc > 4:324515/1‑118 (MQ=255) ggTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCacac < 8:116212/144‑1 (MQ=255) cAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTGCCTGCCCCAGTGTggcagca < 8:105504/149‑3 (MQ=255) cAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGggcaggca < 6:282960/149‑1 (MQ=255) cAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCcgc > 6:294958/1‑81 (MQ=255) cAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGAAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTGCCTGCCCCAGTGTggcagcagcg < 8:245886/149‑6 (MQ=255) aaCGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGc < 8:49838/149‑1 (MQ=255) gTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGc > 6:258599/1‑149 (MQ=255) accGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGa < 6:206403/149‑1 (MQ=255) aGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCtt > 3:270319/1‑149 (MQ=255) ggCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGc > 2:46703/1‑149 (MQ=255) gaagaaGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGc > 7:33904/1‑149 (MQ=255) aagaagTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCt > 4:352490/1‑149 (MQ=255) aagaagTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGGCGACCTTGCCGCt < 1:199038/149‑1 (MQ=255) gaagTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTgg > 1:31324/1‑149 (MQ=255) tcCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCaa > 6:353677/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATg < 4:270319/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATgg > 4:305278/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATgg > 8:202900/1‑148 (MQ=255) aaTGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCtgtg > 6:86545/1‑149 (MQ=255) aaTGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGAGGATGGTCGACATCCTCACGCTC‑CTGCCACACTCGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGCCATCt > 1:289846/1‑149 (MQ=255) cgcgGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCa > 4:310706/1‑148 (MQ=255) cgGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAg < 2:31324/149‑1 (MQ=255) aGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGAt < 5:176544/149‑1 (MQ=255) aGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGAt < 1:46703/149‑1 (MQ=255) ttCTACACGTAGC‑GCCAGATTGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGTTTCGTT‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGACACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAATGGATGa < 8:196171/148‑1 (MQ=255) ttCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATc > 2:300311/1‑132 (MQ=255) ttCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATc < 1:300311/132‑1 (MQ=255) ttCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAg > 5:354830/1‑149 (MQ=255) ttCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAg < 3:310706/149‑1 (MQ=255) acAACAGGTCGCGGCCATCTGG‑CGCGACGTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTggg > 3:152443/2‑118 (MQ=37) acAACAGGTCGCGGCCATCTGG‑CGCGACGTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTggg < 4:152443/117‑1 (MQ=37) cAACAGGTCGCGGCCATCTGG‑CGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCt < 7:164505/131‑1 (MQ=255) cAACAGGTCGCGGCCATCTGG‑CGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCt > 8:164505/1‑131 (MQ=255) aaCACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAGtt < 4:151666/148‑1 (MQ=255) aaCACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAGTTg > 2:294309/1‑149 (MQ=255) acGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAGTTgcgc < 2:240094/149‑1 (MQ=255) gc‑gcCAGATGGCGGCGACCTGTTGGTGCAGCGCGGTGCGTG‑‑‑GCTCGCCTTGCTCTCGGTG‑GTGCCACACTGGGGCTGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAGTTGCGCCGGCa < 2:289846/149‑1 (MQ=255) cAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAGTTGCGCCGGCACCAt > 1:341388/1‑149 (MQ=255) aGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAGTTGCGCCGGCACCATg > 7:3573/1‑149 (MQ=255) | GCTTCGAACAGGGCCTTGAGCGGCAGCTCGACATCGCAGGCCTGGCGGGTGCGCGAAACGATCTGGGTAGCCAGCAACGAGTGACCACCGAGGGCGAAGAAGTCGTCCTGCAGGCCAATGCGCGGCAGATTCAACACGTCGC‑GCCAGATGGCCGCGACCTGTTGTTGCAGCTCGGTTCGTG‑‑‑GCTCGACATGCTCACGCTG‑CTGCCACACTGGGGCAGGCAGTGCCTTGCGGTCGACCTTGCCGCTGGGGCCCAATGGCATCTGTGCCAAAGGGATGAGTTGCGCCGGCACCATG > NC_002947/4826136‑4826429 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |