Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,848,920 | A→T | 6.0% | K74* (AAG→TAG) | hemN → | oxygen‑independent coproporphyrinogen III dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,848,920 | 0 | A | T | 6.0% | 204.5 / 2.3 | 67 | K74* (AAG→TAG) | hemN | oxygen‑independent coproporphyrinogen III dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/30); new base T (2/2); total (35/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.41e-01 |
ACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTGGCGGCGGCACACCGACCTTCCTCAGCCATG > NC_002947/4848774‑4849067 | aCCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAg > 1:362483/1‑149 (MQ=255) aCCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAg > 5:224947/1‑149 (MQ=255) ccAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGt > 6:145857/1‑149 (MQ=255) cAACCGCCGTGCCACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTAGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTGCGACTTCGGCTGCAACAAGGt > 8:287320/1‑148 (MQ=255) cAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtc < 8:137637/149‑1 (MQ=255) tcgctgTGCAGTTGCACGGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtcatc > 6:157321/2‑149 (MQ=255) ctgTGCAGTTGCACGGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCAc > 7:288705/3‑148 (MQ=255) ccgTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCAc > 5:70266/1‑148 (MQ=255) aaCTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGAc > 5:215384/1‑149 (MQ=255) caGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGAccgcgccc > 7:85334/1‑149 (MQ=255) gggTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTgcgc > 2:126157/1‑149 (MQ=255) gggTTCGTTCGACCTGCTAAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTgcgc > 2:122193/1‑149 (MQ=255) ggTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTgcgc < 5:157321/148‑1 (MQ=255) ttcgACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCt > 4:296713/1‑149 (MQ=255) gACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTg > 6:253039/1‑147 (MQ=255) aCCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAg > 6:126767/1‑149 (MQ=255) gCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGcc > 7:275560/1‑149 (MQ=255) cTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCt > 1:51764/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGa < 5:61536/149‑1 (MQ=255) aaCGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGa < 5:126767/149‑1 (MQ=255) aaCGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGAACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGAGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTg > 1:75325/1‑147 (MQ=255) gCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAg > 4:168208/1‑147 (MQ=255) cccTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAACAGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCa < 1:251438/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGCCCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAg > 1:150166/1‑148 (MQ=255) cgcgAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGaa < 7:8296/147‑1 (MQ=255) cgcgAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGaa < 2:51764/147‑1 (MQ=255) gcgAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATc < 8:275560/149‑1 (MQ=255) gcgAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATc < 1:126157/149‑1 (MQ=255) gcgAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATc < 1:122193/149‑1 (MQ=255) ccGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTTCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTgg < 6:49527/149‑1 (MQ=255) ccGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTgg < 5:145857/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTg > 5:134858/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑CGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGa < 5:253039/149‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGa > 3:163452/1‑149 (MQ=255) cgctgtcgctgtACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGAc < 4:352659/149‑1 (MQ=255) gctgtACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTaaa < 6:70266/148‑1 (MQ=255) tACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACg > 7:332555/1‑149 (MQ=255) gaCGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAaacaac < 4:252399/147‑1 (MQ=255) cGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCGCCTGGACCCTAAACAACgt < 2:362483/148‑1 (MQ=255) gTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACTAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAaacaa > 2:224308/1‑144 (MQ=255) gTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACTAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAaacaa > 2:218901/1‑144 (MQ=255) gTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACTAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAaacaa < 1:224308/144‑1 (MQ=255) gTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACTAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAaacaa < 1:218901/144‑1 (MQ=255) gTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACgtgt < 8:332555/149‑1 (MQ=255) gTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACgtgt < 3:168208/149‑1 (MQ=255) gCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGAcc > 7:79853/1‑134 (MQ=255) gCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGAcc < 8:79853/134‑1 (MQ=255) aTGTGGCGTTCTGCGCCATCATCTGCTACTACTGCGCCTGCTACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCGTACCTGCTGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGaa < 6:224947/149‑1 (MQ=255) ccGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATcc > 6:195094/1‑103 (MQ=255) ccGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATcc < 5:195094/103‑1 (MQ=255) cGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGtt > 1:271890/1‑148 (MQ=255) cTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTTGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCAt < 7:287320/148‑1 (MQ=255) tGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAg < 6:217600/99‑1 (MQ=255) tGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAg > 5:217600/1‑99 (MQ=255) gcgcCAACATCTGCTACTACTGCGTCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCAtttt > 7:52677/1‑149 (MQ=255) cgcCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCAtt < 2:271890/146‑1 (MQ=255) cAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACgtg > 7:128277/1‑128 (MQ=255) cAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACgtg < 8:128277/128‑1 (MQ=255) cAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTggcg > 5:315311/1‑149 (MQ=255) cAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTggcg > 3:110145/1‑149 (MQ=255) cTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCAt > 7:339548/1‑136 (MQ=255) cTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCAt < 8:339548/136‑1 (MQ=255) gCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTGGCGGCGGcaca > 7:281093/1‑149 (MQ=255) ctactaCTGCGCCTGCAACACGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGAGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGGCTGCCACCTTGACGCTAAACAAGGTGTTGAACAGTTGCATTTTGGCGGCGGCacac < 2:75325/149‑1 (MQ=255) ctGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTggc > 2:343133/1‑133 (MQ=255) ctGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTggc < 1:343133/133‑1 (MQ=255) ccTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTGGCGGCGGCACACCGACCTTCCTc < 6:315311/149‑1 (MQ=255) acaaGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTGGCGGCGGCACACCGACCTTCCTCAGCCAt > 4:75522/1‑149 (MQ=255) caaGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGACCAGTTGGATTTTGGCGGCGGCACACCGCCCTTCCTCAGCCTtg > 4:222384/1‑149 (MQ=255) caaGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTGGCGGCGGCACACCGACCTTCCTCAGCCAtg > 8:45175/1‑149 (MQ=255) | ACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAA‑AGACCGCGCCCGCGCTGCGCCCTACCTGCAGCGCCTGGAGCAGGAAATCCAGCTGGTCGCCTGCCACCTGGACCCTAAACAACGTGTTGAACAGTTGCATTTTGGCGGCGGCACACCGACCTTCCTCAGCCATG > NC_002947/4848774‑4849067 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |