Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 402,756 | A→G | 7.8% | Y148H (TAC→CAC) | msrA ← | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 402,756 | 0 | A | G | 7.8% | 177.2 / 4.7 | 64 | Y148H (TAC→CAC) | msrA | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/30); new base G (2/3); total (31/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 |
GCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGCACCACTTCGGTGTGGCCGGT > NC_002947/402612‑402903 | gctgGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTGGATg > 6:112193/1‑149 (MQ=255) ctgGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATgg > 4:214291/1‑149 (MQ=255) ggCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGt < 5:233778/149‑1 (MQ=255) gCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGt < 3:184026/149‑1 (MQ=255) gAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGc > 7:112017/1‑149 (MQ=255) aaaTAGTCGGTCGTTGGCTGGTCGATTTCGGTGGTTATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGcc < 8:112017/149‑1 (MQ=255) aaaTAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTgg > 1:317507/1‑144 (MQ=255) aaaTAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTgg < 2:317507/144‑1 (MQ=255) aGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATg > 8:42934/1‑149 (MQ=255) aGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATg > 8:38864/1‑149 (MQ=255) ggtcggtGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGt > 2:266042/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGgc > 1:80644/1‑149 (MQ=255) tGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGgcg > 6:147409/1‑149 (MQ=255) tGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGgcg > 4:69907/1‑149 (MQ=255) tGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGACTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGgcg > 8:159669/1‑149 (MQ=255) gTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCa < 3:214291/149‑1 (MQ=255) tCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGgc > 6:157149/1‑145 (MQ=255) tCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGgc < 5:157149/145‑1 (MQ=255) gATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGtt < 4:332573/135‑1 (MQ=255) gATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGtt > 3:332573/1‑135 (MQ=255) gATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGtt < 2:267161/135‑1 (MQ=255) gATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGtt > 1:267161/1‑135 (MQ=255) tCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCtt < 7:38864/148‑1 (MQ=255) ggtggtGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTtgg < 2:80644/148‑1 (MQ=255) tggtgATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTtgggtg < 4:258581/149‑1 (MQ=255) tgATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTgggg < 2:166784/149‑1 (MQ=255) ctcACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTc < 4:15343/117‑1 (MQ=255) ctcACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTc > 3:15343/1‑117 (MQ=255) aCCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCa < 7:42934/149‑1 (MQ=255) cGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTcc > 2:190446/1‑146 (MQ=255) ggCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGcc < 3:343863/82‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGcc > 4:343863/1‑82 (MQ=255) ttGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACAt > 8:36879/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTtgggtggg > 5:279299/1‑126 (MQ=255) gCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTtgggtggg < 6:279299/126‑1 (MQ=255) gCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTtgg > 4:206765/1‑121 (MQ=255) gCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTtgg < 3:206765/121‑1 (MQ=255) aGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTGGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCcag > 7:13151/1‑149 (MQ=255) tCGGCATGTAAGGCGTCTCGGCTGGCATTGGCCTGTTCCAGATGTTCCGGGATGTTGCAGTACATGGCAGAGCGCTAATGGGTGCCTATGTCGTTGACCTGCCGCATACCTTCGCAGGGGTTATCAAGCTCCCAGAACATTGCcagcag > 4:336022/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGAAGGCGACGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGt > 4:148177/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTGGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTcgc < 8:13151/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCGTCGCGACTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTcgc < 7:159669/149‑1 (MQ=255) ggAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCgg > 4:97899/1‑149 (MQ=255) aaGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTGGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTa < 5:112193/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTATGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGc < 3:336022/149‑1 (MQ=255) cTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGAccttgtc < 3:69907/149‑1 (MQ=255) gccttggcctGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGAccttgtcc < 3:97899/147‑1 (MQ=255) cttggcctGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGAccttgtccttgt < 7:36879/149‑1 (MQ=255) cttggcctGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGAccttgtc > 8:20630/1‑144 (MQ=255) cttggcctGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGAccttgtc < 7:20630/144‑1 (MQ=255) ggcctGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCg < 1:190446/148‑1 (MQ=255) tGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAacac > 6:327733/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAAcaccac < 5:327733/148‑1 (MQ=255) ttCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGAccttgtccttgt > 1:86685/1‑131 (MQ=255) ttCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGAccttgtccttgt < 2:86685/131‑1 (MQ=255) ttCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGcacca > 2:74766/1‑149 (MQ=255) ttCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGcacc < 5:147409/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGTGGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGCACCACTTCGgt < 2:177008/149‑1 (MQ=255) gTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGCACCACTTCGgtgt < 8:284978/148‑1 (MQ=255) cAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCg < 2:229113/120‑1 (MQ=255) cAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCg > 1:229113/1‑120 (MQ=255) cAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGCACCACTTCGGTGTGGc < 3:148177/148‑1 (MQ=255) tAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGCACCACTTCGGTGTGGCCGGt > 7:230471/1‑149 (MQ=255) tAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGCACCACTTCGGTGTGGCCGGt > 3:208765/1‑149 (MQ=255) | GCTGGTGGTAGGCCTCGGCGAAATAGACGGTCGGTGCCTGGTCGATTTCGGTGGTGATCTCACCGAAGCCGGCCTTGCTCAGCTCGGCCTGGAAGGCGTCGCGGCTGGCCTTGGCCTGTTCCAGCTGTTCCGGGCTGGTGCAGTAGATGGCCGAGCGGTACTGGGTGCCGATGTCGTTGCCCTGGCGCATACCTTGGGTGGGGTTGTGCAGCTCCCAGAACATTGCCAGCAGTTCGCGGTAGCTGACCTTGTCCTTGTCGAACACCACCAGCACCACTTCGGTGTGGCCGGT > NC_002947/402612‑402903 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |