| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,258,189 | T→A | 8.4% | D323V (GAC→GTC) | PP_4635 ← | trans‑2‑enoyl‑CoA reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,258,189 | 0 | T | A | 8.4% | 221.7 / 10.0 | 84 | D323V (GAC→GTC) | PP_4635 | trans‑2‑enoyl‑CoA reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/34); new base A (3/4); total (45/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.05e-01 | |||||||||||
TAACCGGCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTT > NC_002947/5258045‑5258337 | tAACCGGCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGt < 1:326591/149‑1 (MQ=255)tAACCGGCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGt > 1:177657/1‑149 (MQ=255) cGGCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCgg < 6:176332/149‑1 (MQ=255) cGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGACGGTGCgccgg < 4:53461/149‑5 (MQ=255) gtcagtcaGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATa < 2:199278/148‑1 (MQ=255) tcagtcagCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACg < 5:261475/149‑1 (MQ=255) tcagCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTcg < 1:122418/149‑1 (MQ=255) agCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTcgcg > 3:219757/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTc < 3:78041/149‑1 (MQ=255) ggtggtCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGc < 4:219757/148‑1 (MQ=255) aCCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTg > 4:53307/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGCCCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGGCCAATAGGGGGGGGGACATTCGGTCGTGCGGGTGCTgg > 6:245547/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTgg < 1:224650/149‑1 (MQ=255) tgtaGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATg > 7:16311/1‑129 (MQ=255) tgtaGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATg < 8:16311/129‑1 (MQ=255) tgGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGc > 1:174749/1‑149 (MQ=255) gCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCt > 3:184443/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAg < 6:61232/123‑1 (MQ=255) cTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAg > 5:61232/1‑123 (MQ=255) aGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGt > 4:312610/1‑114 (MQ=255) aGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGt < 3:312610/114‑1 (MQ=255) gTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCt < 1:165137/149‑1 (MQ=255) gTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCt < 2:177657/149‑1 (MQ=255) tttGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTg > 3:7987/1‑148 (MQ=255) aCGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGa > 3:61894/1‑148 (MQ=255) aCGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGAt > 5:269513/1‑149 (MQ=255) aCGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCCGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTACTCCTGCATGa > 2:38087/1‑148 (MQ=255) aCGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGACGGt < 3:343457/74‑1 (MQ=255) aCGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGACGGt > 4:343457/1‑74 (MQ=255) cgtcgtCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATc < 3:53307/149‑1 (MQ=255) gtcgtcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCt > 2:335477/1‑149 (MQ=255) gtcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTg > 2:271317/1‑148 (MQ=255) gtcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCCGTGCGCTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCTAGCTGGTCATGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTg > 4:256000/1‑148 (MQ=255) tcACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGaa < 4:61894/149‑1 (MQ=255) gCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTg > 5:277710/1‑133 (MQ=255) gCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTg < 6:277710/133‑1 (MQ=255) gCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAgcc > 2:202249/1‑146 (MQ=255) gCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGAc > 1:316537/1‑148 (MQ=255) gCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGAc > 8:195152/1‑148 (MQ=255) gCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGAc > 8:7787/1‑148 (MQ=255) gTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATc < 4:7987/149‑1 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGTCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCGTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGa > 7:229814/1‑148 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt < 8:147500/111‑1 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt > 5:8365/1‑111 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt > 7:147500/1‑111 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGt < 6:8365/111‑1 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCt > 2:19284/1‑126 (MQ=255) cccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCt < 1:19284/126‑1 (MQ=255) ccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGc < 1:24681/127‑1 (MQ=255) ccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGc > 2:24681/1‑127 (MQ=255) ccAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGa > 1:166276/1‑147 (MQ=255) tcCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTg < 8:124363/104‑1 (MQ=255) tcCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTg > 7:124363/1‑104 (MQ=255) tcCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTa < 4:61846/146‑1 (MQ=255) tcCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTa > 3:61846/1‑146 (MQ=255) gcCCCTTCTCGTCGACCTGTGCCGGCGCACCGTCGGTGCCGTACAAACCGTCGCGGTACAAGCGCTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGCACACCATTCTCCTCCATGATCTTGCAGACAATCGACAGGTACAGTGGCATGACCgg > 6:5785/1‑148 (MQ=255) 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cTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATgg < 1:335477/149‑1 (MQ=255) cTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAAAACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATAGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATgg > 8:225082/1‑149 (MQ=255) tctcGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGcc > 1:237947/1‑149 (MQ=255) tctcGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCATGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGcc > 1:259983/1‑149 (MQ=255) ctcGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGc < 8:229814/147‑1 (MQ=255) 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tctGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTg > 4:176510/1‑144 (MQ=255) tctGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTg < 3:176510/144‑1 (MQ=255) ccGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTgg < 5:245547/146‑1 (MQ=255) cGGCCCACCGGCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTaa < 2:174749/149‑1 (MQ=255) ccgcACCGACGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAg > 7:85319/2‑106 (MQ=255) ccgcACCGACGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAg < 8:85319/105‑1 (MQ=255) ccgcACCGACGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATg > 7:342140/2‑128 (MQ=255) ccgcACCGACGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATg < 8:342140/127‑1 (MQ=255) gcACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAaccac > 4:214018/1‑149 (MQ=255) cGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAg < 1:18385/106‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAg > 2:18385/1‑106 (MQ=255) tCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACtt < 7:195152/149‑1 (MQ=255) | TAACCGGCGTAGTCAGTCAGCTCGAACAGGTTCTCGGTGGTCACCTGTGGCCACAGGGCCTTGCAGGCGTTTTGCACGTCGTCACGCAGTTCCCAGTCGTCCAGGCGCAGGCGCCCCTTCTCGTCGACCTCTGCCGGCGCACCGTCGGTGCGGTACATACGGTCGCGGTACATGCGGTCGAGCTGGTCCTGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTT > NC_002947/5258045‑5258337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |