Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 462,594 | A→T | 11.9% | intergenic (‑130/+11) | pqqF ← / ← davA | coenzyme PQQ synthesis protein F/5‑aminopentanamidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 462,594 | 0 | A | T | 11.9% | 180.2 / 12.8 | 67 | intergenic (‑130/+11) | pqqF/davA | coenzyme PQQ synthesis protein F/5‑aminopentanamidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/31); new base T (3/5); total (31/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.16e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
GCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAG > NC_002947/462447‑462733 | gCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGAGTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAg < 8:145303/149‑1 (MQ=255) tCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCTATGCGGcccattc < 4:6640/149‑5 (MQ=255) tCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCAATGCGGcccattc < 5:236540/149‑5 (MQ=255) aGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCTATGCGGcccattcgc < 8:149818/149‑7 (MQ=255) gCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGc < 6:288685/149‑1 (MQ=255) gCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCAAGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCTATGCGGcccattc < 6:185997/145‑5 (MQ=255) gCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCAAGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCTATGCGGcccattc > 5:185997/1‑141 (MQ=255) tCCGGTGGCTGCTCTGCATGCTAACCTATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGGGGGTATGGCGCCGTTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAg < 7:203269/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAg < 6:275313/147‑1 (MQ=255) tgctCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTc > 4:243002/1‑149 (MQ=255) tgctCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTc > 4:67184/1‑149 (MQ=255) ctctCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTc < 6:139080/147‑1 (MQ=255) cATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGgc < 7:41544/147‑1 (MQ=255) cATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTAGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGgcg > 7:202111/1‑148 (MQ=255) aTGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGt > 3:339007/1‑118 (MQ=255) aTGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGt < 4:339007/118‑1 (MQ=255) tAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATc > 8:143833/1‑149 (MQ=255) aaCCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATACCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCg > 5:25549/1‑149 (MQ=255) aCCGATTTGTTTGCAGGCTCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCg < 3:350918/148‑1 (MQ=255) ccGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGt < 2:211752/149‑1 (MQ=255) cGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGt < 1:128083/148‑1 (MQ=255) gATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCTGTCa < 1:286707/149‑1 (MQ=255) gATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGt > 7:345564/1‑147 (MQ=255) gATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGt > 2:128083/1‑147 (MQ=255) tttgtttgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCttt > 4:281166/1‑115 (MQ=255) tttgtttgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAgg < 7:143833/149‑1 (MQ=255) tttgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAgg < 1:147074/149‑1 (MQ=255) tttgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAgg < 3:92507/149‑1 (MQ=255) ttgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAg < 4:13214/147‑1 (MQ=255) ttgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAg > 3:13214/1‑147 (MQ=255) tgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGTCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAggg > 5:56524/1‑148 (MQ=255) gCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGa > 3:295831/1‑148 (MQ=255) cAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGaaa < 4:295831/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGc > 5:149131/1‑149 (MQ=255) cccGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGcc > 8:11789/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGccc > 4:254923/1‑149 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCACGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTg > 3:136292/1‑149 (MQ=255) cTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTgcgc > 4:166763/1‑149 (MQ=255) ttttCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAggg > 7:333707/1‑135 (MQ=255) ttttCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAggg < 8:333707/135‑1 (MQ=255) gggTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGcac > 3:321369/1‑149 (MQ=255) gTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGcacca > 8:294015/1‑149 (MQ=255) tATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGTAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGca > 4:318026/1‑145 (MQ=255) tATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGTAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGca < 3:318026/145‑1 (MQ=255) cGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCAt > 6:8088/1‑149 (MQ=255) cGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCAt < 3:166763/149‑1 (MQ=255) tGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTc < 4:321369/148‑1 (MQ=255) aaaGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAg < 8:202111/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGctc > 7:733/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGctct < 7:11789/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGctct < 4:136292/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGctct > 2:304733/1‑149 (MQ=255) cAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTg < 5:8088/149‑1 (MQ=255) aGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGc < 6:56524/149‑1 (MQ=255) tCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACt > 2:343368/1‑149 (MQ=255) ccGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTgg < 6:149131/149‑1 (MQ=255) ccGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCAGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTgg > 5:110948/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATcc < 3:254923/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTTGCACTCATCCCGCCCGGcc < 6:25549/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATcc < 2:188849/140‑1 (MQ=255) ccGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATcc > 1:188849/1‑140 (MQ=255) tgacaggggCCGCTATGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCa > 7:341078/7‑131 (MQ=255) tgacaggggCCGCTATGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCa < 8:341078/125‑1 (MQ=255) tGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCa < 8:345564/149‑1 (MQ=255) tGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCa < 8:733/149‑1 (MQ=255) gggCCGCTATGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAg > 1:359816/1‑149 (MQ=255) ggCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAg > 3:290661/1‑148 (MQ=255) | GCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAG > NC_002947/462447‑462733 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |