| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,565,754 | A→T | 6.2% | C578S (TGC→AGC) | mutL ← | DNA mismatch repair protein MutL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,565,754 | 0 | A | T | 6.2% | 238.5 / 2.0 | 79 | C578S (TGC→AGC) | mutL | DNA mismatch repair protein MutL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/35); new base T (3/2); total (42/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGCCAGGGTCTCG > NC_002947/5565613‑5565902 | caaGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGCTACGACGACCATCCTTGCACTGGACGCTGCGCTCCGTGTTTTCCATGTAGAGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑ATGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATg > 7:236334/3‑149 (MQ=255) cAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCaa < 4:73064/142‑1 (MQ=255) cAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCaa > 3:73064/1‑142 (MQ=255) cAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATgg > 4:332271/1‑149 (MQ=255) cAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATgg > 5:340754/1‑149 (MQ=255) aGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGt > 5:101411/1‑149 (MQ=255) tCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCATGGCTTGCCACGGTGcc < 5:180927/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGcc > 6:14831/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGcc > 6:20017/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGa < 1:333288/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGag > 4:197665/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCAGGGTGCCGag > 8:257103/1‑149 (MQ=255) cAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGag > 2:20932/1‑147 (MQ=255) aGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGagccg > 8:328319/1‑147 (MQ=255) aGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGagcag > 4:74179/1‑149 (MQ=255) gCCCCATGTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGTAA‑TTGGGAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGagcagc < 8:236334/149‑1 (MQ=255) cccATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCCCCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCt > 3:329577/1‑148 (MQ=255) cATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCAt > 1:91951/1‑149 (MQ=255) gggTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAg < 4:201642/148‑1 (MQ=255) gggTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAg > 3:201642/1‑148 (MQ=255) cAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTgcgc < 5:14831/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTgcgc < 5:20017/149‑1 (MQ=255) aGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGcc > 3:358917/1‑149 (MQ=255) tAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGa < 1:20932/149‑1 (MQ=255) ggACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAAt < 6:340754/149‑1 (MQ=255) gacgacCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTCAGGCGCACCTCAAt < 6:101411/148‑1 (MQ=255) acgacCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGAAAGTTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATg > 1:112335/1‑149 (MQ=255) gacCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCCGCTCATTGAg > 2:145930/1‑133 (MQ=255) ccATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGAt > 2:228443/1‑148 (MQ=255) cATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTg < 4:3669/113‑1 (MQ=255) cATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTg > 3:3669/1‑113 (MQ=255) aTGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCAc < 4:358917/149‑1 (MQ=255) gCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTg < 6:38020/148‑1 (MQ=255) cACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGTCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGcc > 3:42826/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCg > 2:358701/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCa > 8:264003/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCa < 7:264003/149‑1 (MQ=255) ctacgcTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCAt < 5:54500/146‑1 (MQ=255) tGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCAt > 7:217692/1‑148 (MQ=255) gcTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAgg > 8:258709/1‑149 (MQ=255) cTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGt > 1:12262/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGa > 5:250570/1‑123 (MQ=255) tCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGa < 6:250570/123‑1 (MQ=255) ggTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATTGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTc < 4:329577/147‑1 (MQ=255) gtTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGc > 8:177922/1‑147 (MQ=255) ttCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGc < 6:214736/148‑1 (MQ=255) aTGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGTCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTc < 4:42826/149‑1 (MQ=255) cgcgCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCg > 7:67897/1‑134 (MQ=255) cgcgCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCg < 8:67897/134‑1 (MQ=255) cgcgCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTg > 4:218216/1‑148 (MQ=255) gcagGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAgg < 1:358701/149‑1 (MQ=255) 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aGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGc > 4:14214/1‑147 (MQ=255) ccGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCg < 2:112335/149‑1 (MQ=255) ccGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCg > 4:112085/1‑149 (MQ=255) cGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCgg > 5:290543/1‑149 (MQ=255) tGGCGCGCACGGCACCGTGGCTAGCCATGGTGCCGAGGAGCTGAGTGAGGAGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCCTACTCCATAACGTCGGCAAGCGCGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATc > 1:41715/1‑149 (MQ=255) cgcgcACGGCACGGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCTCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAATGTGGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTTGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCGGGGTTCTgg < 2:41715/149‑1 (MQ=255) gcgcACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGc > 1:29939/1‑149 (MQ=255) gcgcACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGc < 8:170654/149‑1 (MQ=255) tgctcGGCACCATGGCTTGCCACGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCAc > 2:203393/5‑104 (MQ=38) tgctcGGCACCATGGCTTGCCACGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACACCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCAc < 1:203393/100‑1 (MQ=38) cACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCTCTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGaa < 5:55372/149‑1 (MQ=255) cACCATGGCTTGCCACGGTGCCGTGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATAACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGc > 3:300989/1‑148 (MQ=255) cGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGACTCGCCAgg > 6:251118/1‑149 (MQ=255) cGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGCCAgg < 3:14214/149‑1 (MQ=255) tGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGCCAGGGt < 7:328319/149‑1 (MQ=255) aaGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGATTCGCCAgatcccgg < 3:74179/149‑8 (MQ=255) | CCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAA‑TTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCCGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGCCAGGGTCTCG > NC_002947/5565613‑5565902 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |