| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,790,143 | A→T | 7.6% | intergenic (+22/+46) | ynfM → / ← PP_5073 | efflux transporter/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,790,143 | 0 | A | T | 7.6% | 190.1 / 5.7 | 66 | intergenic (+22/+46) | ynfM/PP_5073 | efflux transporter/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/35); new base T (2/3); total (28/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.53e-01 | |||||||||||
GGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGT > NC_002947/5789998‑5790290 | ggcgggcgGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCAccc < 8:191991/149‑1 (MQ=255) cgggcgggGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCcac < 4:332722/149‑1 (MQ=255) ggcgggGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGAGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACaa > 3:166202/1‑149 (MQ=255) tgtTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTgg < 4:296245/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTgg > 1:324169/1‑147 (MQ=255) tGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCg < 7:119331/149‑1 (MQ=255) gCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCgg < 6:266499/148‑1 (MQ=255) gCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCgg < 2:292112/148‑1 (MQ=255) gCACCAGTGGGGCGGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACACCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCgg < 8:299230/148‑1 (MQ=39) cACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGgt < 3:2237/149‑1 (MQ=255) aCCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGTC‑ACACCCGCTCCCACAGGCTGTGGGTGCgggcg < 8:290756/149‑3 (MQ=38) ccAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGgtgt < 6:100688/149‑1 (MQ=255) ccAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGgtgt < 4:234842/149‑1 (MQ=255) tGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGGGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGAc < 4:166202/148‑1 (MQ=255) tGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACg > 2:183945/1‑146 (MQ=255) gAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAagag > 6:43832/1‑149 (MQ=255) gAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGGTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAagag < 7:90621/149‑1 (MQ=255) aaCGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCTGTTGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCTAACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACAACGAAGAgg < 4:162216/149‑1 (MQ=255) gggATGGGGCTGTTCATTGGGAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCTCGAAGAGGCCa < 7:5494/149‑1 (MQ=255) ggATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCat < 5:43832/149‑1 (MQ=255) ggCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatcacat > 4:604/1‑148 (MQ=255) gTTCATTGGCCGCTTGCTGCGGGTGCCCTTCTTGGTGGCGTGCAACCTCCGCATTTTGCAACCAAAAACGGGGTCATCCATTCGTGGCCAACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGt < 1:285387/149‑1 (MQ=255) cATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAg > 5:289536/1‑112 (MQ=255) cATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAg < 6:289536/112‑1 (MQ=255) aTTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGtt < 6:33487/145‑1 (MQ=255) aTTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGtt > 5:33487/1‑145 (MQ=255) aTTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTtgatg < 6:182146/149‑1 (MQ=255) aTTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTtgat > 6:208442/1‑148 (MQ=255) aTTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGAAGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTtgat > 1:203904/1‑148 (MQ=255) ggCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTgg < 3:90178/105‑1 (MQ=255) ggCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTgg > 4:90178/1‑105 (MQ=255) gCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGAtct > 6:318175/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTGCTGGCGGTGGCCTCGAGGGTGCCGTTGCACCGGAGCAATTTGCCACCCAAAAGGGTGGCATGCATTCGTGGGC‑ACGCCGGCACCCACAACCTGGGGGTGGGGGGGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGAtct < 8:119023/148‑1 (MQ=255) cTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGa > 8:314418/1‑148 (MQ=255) gCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatcc < 6:70668/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatc < 2:324169/148‑1 (MQ=255) gCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGAtctc > 8:199956/1‑133 (MQ=255) gCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGAtctc < 7:199956/133‑1 (MQ=255) cTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatccacatccac > 3:136329/1‑149 (MQ=255) aTGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTcc < 1:183945/149‑1 (MQ=255) ttGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGtt < 8:251599/109‑1 (MQ=255) ttGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGtt > 7:251599/1‑109 (MQ=255) ttGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGa > 7:47956/1‑120 (MQ=255) ttGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGa < 8:47956/120‑1 (MQ=255) aCCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatccacatcca < 6:250024/131‑1 (MQ=255) aCCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatccacatcca > 5:250024/1‑131 (MQ=255) cAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTc < 5:208442/149‑1 (MQ=255) ttGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGtt < 7:261546/94‑1 (MQ=255) ttGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGtt > 8:261546/1‑94 (MQ=255) cccAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGa > 5:368651/1‑99 (MQ=255) cccAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGa < 6:368651/99‑1 (MQ=255) ccAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGGCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCgg > 1:28478/1‑149 (MQ=255) ccAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACCAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCgg > 5:32649/1‑149 (MQ=255) tgATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCAc < 2:28478/148‑1 (MQ=255) aTGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACAACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCtt > 2:208766/1‑149 (MQ=255) gCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCACATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCTGTCAGCTTCACCTTgt > 4:199071/1‑148 (MQ=255) tcttCGTGGTC‑ACACCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGt > 5:118594/3‑149 (MQ=25) aTTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTc < 5:318175/149‑1 (MQ=255) ttCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCt > 3:166269/1‑149 (MQ=255) gTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTg < 3:604/148‑1 (MQ=255) gggC‑ACGCCCGCA‑CCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTAGGTCTTGTCGt > 1:291667/1‑149 (MQ=255) gggC‑ACGCCCGCA‑CCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGATCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGt > 1:287348/1‑149 (MQ=255) tc‑acaCCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGtt < 6:118594/148‑1 (MQ=38) gC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGtt < 2:203904/149‑1 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGgt > 7:246502/1‑149 (MQ=38) cACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGgtgt < 1:208766/149‑1 (MQ=255) | GGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGC‑ACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGT > NC_002947/5789998‑5790290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |