| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,905,973 | C→G | 5.6% | P276P (CCG→CCC) | spuF ← | spermidine/putrescine ABC transporter ATP binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,905,973 | 0 | C | G | 5.6% | 227.1 / 3.7 | 71 | P276P (CCG→CCC) | spuF | spermidine/putrescine ABC transporter ATP binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/28); new base G (2/2); total (41/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
TGGATCTTGCCGCGCGACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGT > NC_002947/5905827‑5906121 | tGGATCTTGCCGCGCGACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCgg < 1:49316/149‑1 (MQ=255) ggATCTTGCCGCGCGACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCggg > 1:169224/1‑149 (MQ=255) tCTTGCCGCGCGACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTg > 8:298287/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCGACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTgg < 7:298287/146‑1 (MQ=255) gCCGCGCGACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTgg < 3:234417/146‑1 (MQ=255) gCCGCGCGACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTgg < 2:169224/146‑1 (MQ=255) gACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATcgc < 1:32554/149‑1 (MQ=255) cAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTa < 7:219185/149‑1 (MQ=255) ttGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGcc > 2:182212/1‑149 (MQ=255) cTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCgg > 7:180263/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGcgt > 7:103557/1‑149 (MQ=255) ggCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGa < 1:158216/148‑1 (MQ=255) gctgctGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCgg < 7:119892/138‑1 (MQ=255) gctgctGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCgg > 8:119892/1‑138 (MQ=255) gctgctGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGtcgtcg < 7:272223/146‑1 (MQ=255) gctgctGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCAAGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGtcgtcg > 8:272223/1‑146 (MQ=255) tgctgGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCAc > 1:325674/1‑149 (MQ=255) gggTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCa > 6:266973/1‑149 (MQ=255) ggtggtGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCAc > 6:28064/1‑149 (MQ=255) aCCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGaa < 5:266973/149‑1 (MQ=255) gCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAgg > 8:59045/1‑149 (MQ=255) gCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAgg < 5:174748/149‑1 (MQ=255) cATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGt > 1:173055/1‑149 (MQ=255) cATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGt > 1:63413/1‑149 (MQ=255) cATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCCCGGAGCTggagc > 6:126843/1‑98 (MQ=255) cATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCCCGGAGCTggagc < 5:126843/101‑4 (MQ=255) tCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGtt > 1:295428/1‑148 (MQ=255) ttttCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGAc < 5:28064/149‑1 (MQ=255) ttCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGAc < 1:182212/147‑1 (MQ=255) ccGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACAGAGGTGGTGATGCCGTGCCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGATGGCAATGATAGCTTAGACTTCGGCGTCGTCGACCACGACACCTTc > 7:86427/1‑133 (MQ=255) gcAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGAt > 7:76170/1‑148 (MQ=255) gggCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAAc > 1:290493/1‑149 (MQ=255) ggCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACt > 3:92605/1‑149 (MQ=255) tAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGca > 7:231286/1‑149 (MQ=255) tAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGca < 2:63413/149‑1 (MQ=255) tGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGAt > 5:140066/1‑136 (MQ=255) tGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGAt < 6:140066/136‑1 (MQ=255) tGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCacac > 3:156086/1‑148 (MQ=255) tgCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCGCACCAggc < 2:325674/148‑1 (MQ=255) gCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAggcgg > 7:345189/1‑149 (MQ=255) cTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAggcggc > 6:64689/1‑149 (MQ=255) tCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTgg < 1:31408/61‑1 (MQ=255) tCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTgg > 2:31408/1‑61 (MQ=255) ttCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAg > 5:227699/1‑149 (MQ=255) ttCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGGAg > 6:304517/1‑149 (MQ=255) ttCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGAGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGa > 5:108434/1‑113 (MQ=255) ccACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAg < 4:92605/147‑1 (MQ=255) ccACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAg < 7:59045/147‑1 (MQ=255) cACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCg > 1:136708/1‑149 (MQ=255) gAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGtctc < 8:180263/149‑1 (MQ=255) tggtgATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAg < 8:345189/149‑1 (MQ=255) gtgATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGAt < 6:227699/149‑1 (MQ=255) tgATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATg > 8:294093/1‑149 (MQ=255) gCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGt > 6:268100/1‑129 (MQ=255) gCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGt < 5:268100/129‑1 (MQ=255) gCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCa > 7:181910/1‑149 (MQ=255) cACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCGGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGc < 6:97930/149‑1 (MQ=255) tCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTc > 5:332315/1‑67 (MQ=255) tCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTc < 6:332315/67‑1 (MQ=255) ttGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGc > 6:203680/1‑149 (MQ=255) cgcTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGTCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGa < 2:290493/148‑1 (MQ=255) cgcTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGa < 8:324259/148‑1 (MQ=255) ttgccAGCCCGGAGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGc < 4:265821/128‑1 (MQ=255) ttgccAGCCCGGAGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGc > 3:265821/4‑131 (MQ=255) gcTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATc > 5:230293/1‑149 (MQ=255) gcTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATc < 2:295428/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGTACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAg > 8:62545/1‑149 (MQ=255) aGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGcc > 7:22433/1‑149 (MQ=255) gCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGcc > 7:75885/1‑148 (MQ=255) cTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGcc > 7:105916/1‑147 (MQ=255) tCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAg > 3:355504/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGTACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAg < 7:62545/147‑1 (MQ=255) cGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAg < 2:173055/147‑1 (MQ=255) cGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGt < 2:136708/149‑1 (MQ=255) | TGGATCTTGCCGCGCGACCAGTTGTGCTCGCAGGTTGGCTGCTGGGTGGTGACCAGCATCTTTTCCGGGCGCAGGGCGTAGGTGATGTGCTTGTCTTCCACCGAGGTGGTGATGCCGTGGCCCACGTAGATCTTGCGCTCCAGCTCCGGGCTGGCAATGATCGCGTAGCCTTCGGCGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGT > NC_002947/5905827‑5906121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |