Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 479,499 | A→T | 7.1% | intergenic (‑31/+25) | cca ← / ← ycgB | multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase/type IV piliation protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 479,499 | 0 | A | T | 7.1% | 200.7 / 3.9 | 70 | intergenic (‑31/+25) | cca/ycgB | multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase/type IV piliation protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/36); new base T (3/2); total (32/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GATAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTGG > NC_002947/479351‑479644 | gATAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATaa > 4:264745/1‑149 (MQ=255) ccATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGt > 7:303605/1‑149 (MQ=255) ccATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGt > 1:312431/1‑149 (MQ=255) ttGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTcggc > 1:244227/1‑149 (MQ=255) gCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTcggcg < 7:73383/148‑1 (MQ=255) cTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCACGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTcggcg < 1:241370/148‑1 (MQ=255) tAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGt > 1:171905/1‑148 (MQ=255) gCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTc < 2:312431/147‑1 (MQ=255) gCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTc < 6:296671/147‑1 (MQ=255) gCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCAt > 6:99582/1‑149 (MQ=255) aTTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATgg < 4:69715/149‑1 (MQ=255) aTTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATgg < 4:292101/149‑1 (MQ=255) tttCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACGGGTTATCCCGTCGGCAGTTATg > 2:352915/1‑147 (MQ=255) tttCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATggg < 3:186082/149‑1 (MQ=255) ttcttcGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACGGGTTATCCCGTCGGCAGTTATgga < 1:352915/148‑2 (MQ=255) tcttcGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGt > 5:44602/1‑149 (MQ=255) cttcGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGtt > 8:176155/1‑149 (MQ=255) cttcGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGt < 3:273827/148‑1 (MQ=255) ttcGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTc > 3:39370/1‑133 (MQ=255) ttcGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTc < 4:39370/133‑1 (MQ=255) ttcGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTg > 6:57358/1‑149 (MQ=255) ttcGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTg > 7:6008/1‑149 (MQ=255) tGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCagag > 1:85094/1‑149 (MQ=255) gcCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAggtgg > 2:69710/1‑149 (MQ=255) cccACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAggtggt < 1:69710/149‑1 (MQ=255) cccACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAggtggt < 2:85094/149‑1 (MQ=255) caccaGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCaga < 2:117743/138‑1 (MQ=255) caccaGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCaga > 1:117743/1‑138 (MQ=255) caccaGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGAt > 6:176808/1‑148 (MQ=255) cagccagTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGTTTGCATCAGAGGTGGTGGATaa < 8:303605/147‑1 (MQ=255) cagccagTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGtt < 8:342558/127‑1 (MQ=255) cagccagTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACa < 5:181197/149‑1 (MQ=255) ccagTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAggt > 2:165737/1‑135 (MQ=255) ccagTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAggt < 1:165737/135‑1 (MQ=255) gTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAgg > 3:250119/1‑149 (MQ=255) tCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGt < 2:244227/149‑1 (MQ=255) gATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTc < 4:250119/148‑1 (MQ=255) cGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCTTGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCg > 7:324782/1‑149 (MQ=255) cGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGc > 2:336384/1‑115 (MQ=255) cGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGc < 1:336384/115‑1 (MQ=255) cAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATa < 5:57358/149‑1 (MQ=255) gcggcCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCg > 3:131797/1‑149 (MQ=255) cggcCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCgg < 3:264745/149‑1 (MQ=255) gAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCtt < 3:334440/149‑1 (MQ=255) cAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCg > 2:134680/1‑149 (MQ=255) cgcACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGc < 2:238770/122‑1 (MQ=255) ccgccAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCTGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCgcggcg < 1:203931/149‑1 (MQ=255) tGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATgtggt < 6:44602/148‑1 (MQ=255) tGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATgtgg < 7:176155/147‑1 (MQ=255) tAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGa < 2:171905/148‑1 (MQ=255) catgtgca‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACtcat < 5:99582/148‑1 (MQ=255) gtgca‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACt > 6:287027/1‑149 (MQ=255) gtgca‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACt > 3:292983/1‑149 (MQ=255) gca‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCAGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTg > 5:230808/1‑149 (MQ=255) ca‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGc > 1:319554/1‑149 (MQ=255) ctctCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCg < 5:176808/149‑1 (MQ=255) ccATGACCGCCGACGGGTTATCCTGTCGGCAGTTATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCtt > 5:240/1‑149 (MQ=38) ccATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGGTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAg < 1:29968/128‑1 (MQ=255) ccATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAg > 2:29968/1‑128 (MQ=255) cATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGAGCAAGTGATGAGTACTCACCACATGccgcc < 6:134609/146‑5 (MQ=39) cATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTg < 1:134680/149‑1 (MQ=255) aCTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCAc < 5:287027/148‑1 (MQ=255) aCTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACg > 3:74460/1‑149 (MQ=255) ccGACGGGTTATCCTGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtc < 6:19121/148‑1 (MQ=255) ccGACGGGTTATCCTGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtc > 5:19121/1‑148 (MQ=255) gATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACtc > 2:81159/1‑117 (MQ=255) gATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACtc < 3:317875/117‑1 (MQ=255) gATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACtc < 1:81159/117‑1 (MQ=255) gATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACtc > 4:317875/1‑117 (MQ=255) gATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTg > 6:6233/1‑149 (MQ=255) aTAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTgg < 4:131797/149‑1 (MQ=255) | GATAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCA‑GCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTGG > NC_002947/479351‑479644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |