| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,961,628 | T→A | 6.3% | I175N (ATT→AAT) | lysA‑II → | diaminopimelate decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,961,628 | 0 | T | A | 6.3% | 241.0 / 5.1 | 79 | I175N (ATT→AAT) | lysA‑II | diaminopimelate decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/39); new base A (3/2); total (38/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.39e-01 | |||||||||||
CACCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGT > NC_002947/5961482‑5961766 | cACCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtg < 2:344202/149‑1 (MQ=255)cACCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtg > 1:344202/1‑149 (MQ=255) aCCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgc > 7:32223/1‑149 (MQ=255) aCCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgc < 4:57837/149‑1 (MQ=255) aCCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgc > 5:359424/1‑149 (MQ=255) cgacgaGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgccg < 4:326642/149‑1 (MQ=255) cgacgaGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCCGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgcc > 7:284838/1‑148 (MQ=255) cgaGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGGCAAtggcgatg < 5:178941/149‑1 (MQ=255) gCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATtgccgatgcc > 3:274525/1‑148 (MQ=255) gAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAgg < 4:250414/148‑1 (MQ=255) gAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAgg > 3:250414/1‑148 (MQ=255) gAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGc > 7:6991/1‑149 (MQ=255) gAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGCACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGc > 3:217676/1‑149 (MQ=255) cAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtacgt < 3:218278/149‑1 (MQ=255) cAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtac < 7:313235/147‑1 (MQ=255) cAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtac < 5:305620/147‑1 (MQ=255) agtagtCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtacgtac > 8:7283/1‑149 (MQ=255) agtagtCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtacgtac > 5:243721/1‑149 (MQ=255) gtagtCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCtacgtacg > 6:199436/1‑149 (MQ=255) gccgccGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGACGAGGCCATCTACGTACGcgccg > 8:304293/1‑148 (MQ=255) gccgccGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCAACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGcgccg > 5:197745/1‑148 (MQ=255) cgccgAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGca > 5:103837/1‑148 (MQ=255) cgccgAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCCGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGcac < 8:284838/149‑1 (MQ=255) gccgAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGca > 8:36303/1‑147 (MQ=255) gccgAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGca > 8:30892/1‑147 (MQ=255) cgAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGc > 2:362074/1‑149 (MQ=255) cgAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGc < 4:332519/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGaa < 7:36303/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGaa < 7:30892/149‑1 (MQ=255) ctcggccGGTTGCGCTTCGGGTCAACCCGGACCGCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGaa < 6:251622/144‑1 (MQ=255) gcccGGTGTCGGTGCGGGTCAACCCGGTCGTTGATGCCGGTTACCCACGCCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGaa < 1:120654/147‑1 (MQ=255) ctggTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGaa < 6:256041/142‑1 (MQ=255) ccGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACCTCTCCACCGGCCTGAAAGAAAACAAGATCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGCGGCCATCTACGTACGCGCCGCACACCTACCGAACCGGGAAgacag > 5:251622/1‑145 (MQ=255) ccGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCGGAGGCCATCTACGTACGAGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAgagat > 5:256041/1‑145 (MQ=255) ccGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGt < 5:199436/149‑1 (MQ=255) ggTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCg < 4:274525/149‑1 (MQ=255) tGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCAt > 8:153719/1‑100 (MQ=255) tGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCAt < 7:153719/100‑1 (MQ=255) tCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCca > 5:285742/1‑148 (MQ=255) aaCCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACAt < 8:32223/149‑1 (MQ=255) aCCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATc < 1:16517/149‑1 (MQ=255) cccGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCTTAAATCTCCACCGTCCTTAATGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCg < 8:226235/149‑1 (MQ=255) gACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTc < 7:304293/149‑1 (MQ=255) gACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTc > 1:228423/1‑149 (MQ=255) cGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGaa > 4:354592/1‑118 (MQ=255) cGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGaa < 3:354592/118‑1 (MQ=255) cGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGc < 7:126654/149‑1 (MQ=255) gTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGgtg < 4:72925/127‑1 (MQ=255) gTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGgtg > 3:72925/1‑127 (MQ=255) gTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCa < 4:217676/149‑1 (MQ=255) gATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGc < 2:292428/148‑1 (MQ=255) cGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGacca > 6:366027/1‑149 (MQ=255) cac‑ccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGa < 1:362074/149‑1 (MQ=255) ac‑ccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGacca < 8:243416/141‑1 (MQ=255) ac‑ccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGGGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGacca > 7:243416/1‑141 (MQ=255) ac‑ccGGACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAg < 6:197745/149‑1 (MQ=255) c‑ccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTTGTCTGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGc < 6:243721/149‑1 (MQ=255) c‑ccGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGc < 1:143717/149‑1 (MQ=255) ccACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGAc > 8:80589/1‑149 (MQ=255) cACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGgtgt < 6:58243/99‑1 (MQ=255) cACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGgtgt > 5:58243/1‑99 (MQ=255) 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ttAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGAc > 8:7862/1‑149 (MQ=255) ttAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGAc > 1:71797/1‑149 (MQ=255) aGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCAGATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGcc < 6:103837/149‑1 (MQ=255) gAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCct < 6:359424/149‑1 (MQ=255) aaCAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCctgct > 5:70307/1‑149 (MQ=255) cctcggcatcggcaATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGa > 3:100626/3‑81 (MQ=38) cctcggcatcggcaATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGa < 4:100626/79‑1 (MQ=38) ttCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTc < 2:334771/120‑1 (MQ=255) ttCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTc > 1:334771/1‑120 (MQ=255) ctcggcatcggcaATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgct > 3:270785/2‑149 (MQ=255) ctcggcatcggcaATGGCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgct > 5:70264/2‑149 (MQ=255) ggCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGTAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTgctggtgctggt < 1:162862/149‑1 (MQ=255) ggCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCtgctggtgctgg < 6:70307/148‑1 (MQ=255) | CACCGACGAGCTGGAGCGCCTGCAAGTAGTCGCCGCCGAAATGGGCAAGGTTGCCCCGGTGTCGCTGCGGGTCAACCCGGACGTCGATGCCGG‑TACCCAC‑CCGTACATCTCCACCGGCCTTAAAGAAAACAAGTTCGGCATCGCCATTGCCGATGCCGAGGCCATCTACGTACGCGCCGCACAGCTACCGAACCTGGAAGTGGTCGGTGTCGACTGCCACATCGGCTCGCAGCTGACCACCGTCGAGCCCTTCCTCGACGCCCTCGACCGCCTGCTGGTGCTGGT > NC_002947/5961482‑5961766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |