| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,985,761 | G→A | 8.9% | V10M (GTG→ATG) | PP_5245 → | AraC family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,985,761 | 0 | G | A | 8.9% | 186.7 / 6.5 | 67 | V10M (GTG→ATG) | PP_5245 | AraC family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/35); new base A (2/4); total (28/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
AACCTGAATTGTTGTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGACCTTGGCCGAGGGGCAAGCAGTGGTACGCGGCTCATG > NC_002947/5985615‑5985909 | aaCCTGAATTGTTGTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTg < 1:346233/149‑1 (MQ=255)aaCCTGAATTGTTGTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTg > 7:284041/1‑149 (MQ=255) aTTGTTGTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATgg < 4:108491/149‑1 (MQ=255) aTTGTTGTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATgg < 1:259734/149‑1 (MQ=255) aTTGTTGTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATgg > 4:51554/1‑149 (MQ=255) aTTGTTGTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATgg < 7:58133/149‑1 (MQ=255) ttgttgTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGt > 8:72427/1‑149 (MQ=255) gttgttAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGTGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGc > 8:250694/1‑149 (MQ=255) tgttAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCATGGCCacg < 8:124937/143‑3 (MQ=255) tgttAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCATGGCCacg > 7:124937/1‑141 (MQ=255) gttAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGCAAGGAAAAACCCGCCCACCGCACCATGGCCACGGTGcg < 1:246309/148‑2 (MQ=255) aaTTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCATGGCCACGGTGCGGtgg < 1:188758/148‑3 (MQ=255) ttGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAAc > 7:180093/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAAc < 8:180093/149‑1 (MQ=255) ttGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAAc > 3:353232/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAAc > 1:264418/1‑149 (MQ=255) gtgCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTCAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACg < 8:243988/148‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑CAGGAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑Atgt < 1:84567/149‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑Atgt < 2:125298/149‑1 (MQ=255) gctgctGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑Atgtg < 3:51554/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATgtgt < 4:353232/149‑1 (MQ=255) tgctgGCTCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGtt > 6:28384/1‑149 (MQ=255) gctgGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGtt > 4:196685/1‑148 (MQ=255) ggCCCTGGGCGGTTTTCCGATACCTTAATTTGCGTTTCGTTTTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGACGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTActg < 4:184561/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTActgctg > 5:263836/1‑149 (MQ=255) tGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGa > 4:181952/1‑149 (MQ=255) gggCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGAt > 6:1916/1‑149 (MQ=255) ggCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGAt < 4:214183/148‑1 (MQ=255) ggCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGAt < 3:196685/148‑1 (MQ=255) gTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCa < 5:1916/149‑1 (MQ=255) ttGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCAcc < 8:304297/148‑1 (MQ=255) gCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCgg < 2:264418/148‑1 (MQ=255) cGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTActgc > 6:62524/1‑133 (MQ=255) cGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTActgc < 5:62524/133‑1 (MQ=255) cGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTAc < 6:81980/130‑1 (MQ=255) cGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTAc > 5:81980/1‑130 (MQ=255) cTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGa < 5:129120/149‑1 (MQ=255) ttAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGt > 7:54941/1‑94 (MQ=255) ttAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGt < 8:54941/94‑1 (MQ=255) gtccgATGCGTTTCGTATTGAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAATACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTa < 4:225236/118‑1 (MQ=255) tAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATg > 3:286615/1‑149 (MQ=255) aaGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGAt < 7:72427/147‑1 (MQ=255) gATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCAt > 7:250900/1‑149 (MQ=255) tGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCAtt < 3:40581/148‑1 (MQ=255) tCGTAATCAGCTTCTGGCCGCTAACCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATTGTGCTCTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATgcgccatc > 6:308694/1‑149 (MQ=255) cGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATtcgccatcg > 3:135044/1‑149 (MQ=255) ttCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCATGGCCACGGTGcgg < 7:76651/90‑3 (MQ=255) ttCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCATGGCCACGGTGcgg > 8:76651/1‑88 (MQ=255) cAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAAc < 7:337638/148‑1 (MQ=255) cAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAAc < 2:176522/148‑1 (MQ=255) ttCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGt > 2:2976/1‑148 (MQ=255) cTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGtt < 8:284041/147‑1 (MQ=255) cTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTc < 4:175489/148‑1 (MQ=255) gCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCtt < 8:250900/147‑1 (MQ=255) gCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGc < 6:263836/149‑1 (MQ=255) ccGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGATAAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGc > 1:209735/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCAc < 4:99974/149‑1 (MQ=255) gcgGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACg < 3:181952/149‑1 (MQ=255) gTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCACCG‑CTGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGc > 6:172669/1‑148 (MQ=255) aTTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCg > 5:89789/1‑149 (MQ=255) a‑aaGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑AGGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGAcc < 5:28384/149‑1 (MQ=255) c‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGACCTTGGCCGAgg < 3:81417/148‑1 (MQ=255) aGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACGAATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGACCTTGGCCGAggg > 1:79043/1‑149 (MQ=255) ggAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGACCTTGGCCGAGGGGc < 2:209735/149‑1 (MQ=255) gAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCAtt < 4:164321/83‑1 (MQ=255) gAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCAtt > 3:164321/1‑83 (MQ=255) cGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGACCTTGGCCGAGGGGCAAGCAGTgg > 4:43678/1‑149 (MQ=255) caccgTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGACCTTGGCCGAGGGGCAAGCAGTGGTACGCGGCt < 4:135044/149‑1 (MQ=255) gTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTGACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGACCTTGGCCGAGGGGCAAGCAGTGGTACGCGGCTCATg < 7:250694/149‑1 (MQ=255) | AACCTGAATTGTTGTTAATTGTGCGCTGCTGGCCCTGGGCGTTTTGCCGATACCTTAAGATGCGTTTCGTATTCAGCTTCTGGCCGCTACCCGCGGTCGGCATTCAAGGCGA‑AAGAGGTATGC‑AGGAAAAACCCGCCCACCGCACCGTGGCCATGGTGCTGTTCAACG‑ATGTGTTACTGCTGGATGTCACCGGTCCCATGGATGCATTCGCCATCGCCAACCGGTTCTTGCCTGCAGCACGGCAATATCGGCTGCTGACCTTGGCCGAGGGGCAAGCAGTGGTACGCGGCTCATG > NC_002947/5985615‑5985909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |