Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 612,541 | C→T | 9.2% | E547E (GAG→GAA) | dxs ← | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 612,541 | 0 | C | T | 9.2% | 182.6 / 6.8 | 65 | E547E (GAG→GAA) | dxs | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/28); new base T (3/3); total (34/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.12e-01 |
CGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTG > NC_002947/612397‑612689 | cGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGt < 5:8213/149‑1 (MQ=255) cgCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGTCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCCCGCCACCCATCAGGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTc < 4:181148/148‑1 (MQ=255) gCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGc < 6:46998/149‑1 (MQ=255) cccAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCgg > 3:192924/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGc > 6:52437/1‑149 (MQ=255) aGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGaa < 7:67404/149‑1 (MQ=255) gAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCGCCAGCGCCTCGTCCa < 4:10937/135‑1 (MQ=255) gAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCGCCAGCGCCTCGTCCa > 3:10937/1‑135 (MQ=255) gAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAg < 3:353584/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGgcgctggt < 5:146150/149‑5 (MQ=255) ttGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTc > 4:338229/1‑149 (MQ=255) gAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGgcgctggtg < 7:166008/147‑6 (MQ=255) aaGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTTCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCt < 4:180789/149‑1 (MQ=255) tCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGc > 2:257625/1‑149 (MQ=255) cacccaccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGc > 1:163142/1‑148 (MQ=255) acccaccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCa > 3:321211/1‑149 (MQ=255) cccaccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCAc > 3:152354/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCAt < 4:152354/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGacca < 7:123989/117‑1 (MQ=255) cAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGacca > 8:123989/1‑117 (MQ=255) cAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATg < 4:321211/149‑1 (MQ=255) cACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCACCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGt > 8:124069/1‑149 (MQ=255) aCCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGtt < 5:52437/149‑1 (MQ=255) aCCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGtt > 5:291361/1‑149 (MQ=255) atgatgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCGAGCTCTAGCTCCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGTCCACGGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTAc < 5:112177/149‑1 (MQ=255) atgatgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTAc < 3:338229/149‑1 (MQ=255) atgatgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTAc > 6:182738/1‑149 (MQ=255) gatgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGc < 6:264670/138‑1 (MQ=255) gatgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGc > 5:264670/1‑138 (MQ=255) ttCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAacac < 4:154820/149‑1 (MQ=255) ctctTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAacac > 4:250416/1‑147 (MQ=255) ctctTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACAcc < 2:163142/148‑1 (MQ=255) tctTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACcag > 5:210539/1‑149 (MQ=255) ttCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACcag > 7:290568/1‑147 (MQ=255) tCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACtt < 5:23282/112‑1 (MQ=255) tCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACtt > 6:23282/1‑112 (MQ=255) gATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAggg < 8:290568/149‑1 (MQ=255) gATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAgg < 1:46674/148‑1 (MQ=255) aCCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTg > 4:298806/1‑122 (MQ=255) ccAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACttt < 4:7552/148‑1 (MQ=255) cagcTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGCGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCg < 1:257625/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCTGCCAGTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTg < 6:210539/147‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGc < 1:171590/132‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGc > 2:171590/1‑132 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCAc > 4:253566/1‑135 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCAc < 3:253566/135‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTgg < 5:182738/148‑1 (MQ=255) ctgcctgcCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTACGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGgcggcg < 4:192924/149‑1 (MQ=255) tgcctgccAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGcggcgg > 3:264161/1‑149 (MQ=255) gcctgccAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGa > 7:75638/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACg > 2:114395/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACg > 1:208237/1‑149 (MQ=255) ctctAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCt > 8:279241/1‑149 (MQ=255) tAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGc > 3:114302/1‑149 (MQ=255) aCCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAt > 6:353714/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAtc > 3:146058/1‑149 (MQ=255) catgcgcTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGcc < 8:98574/136‑1 (MQ=255) catgcgcTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGcc > 7:98574/4‑139 (MQ=255) catgcgcTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAtc > 7:333188/4‑149 (MQ=255) catgcgcTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTAGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAtc > 5:270907/4‑149 (MQ=255) cAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGc < 1:34387/63‑1 (MQ=255) cAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGc > 2:34387/1‑63 (MQ=255) cAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGc > 6:2748/1‑108 (MQ=255) cAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGc < 5:2748/108‑1 (MQ=255) gcgcCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAtctc > 8:281000/1‑148 (MQ=255) cTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTg < 8:75638/149‑1 (MQ=255) | CGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATG‑GCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTG > NC_002947/612397‑612689 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |