| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 655,691 | A→T | 7.3% | C218S (TGC→AGC) | PP_0563 ← | two‑component system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 655,691 | 0 | A | T | 7.3% | 236.1 / 7.2 | 82 | C218S (TGC→AGC) | PP_0563 | two‑component system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/39); new base T (4/2); total (41/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.98e-01 | |||||||||||
GCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCTGTGTGCGCGAATCG > NC_002947/655550‑655839 | gCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGc < 1:117018/149‑1 (MQ=255)gCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGc < 6:248466/149‑1 (MQ=255) gTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCAt > 5:57676/1‑146 (MQ=255) gTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCAt < 6:57676/146‑1 (MQ=255) gTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTa > 5:90681/1‑149 (MQ=255) cAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTa > 7:341805/1‑147 (MQ=255) aaaaaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAg > 7:293060/1‑149 (MQ=255) aaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTc < 2:341819/149‑1 (MQ=255) aGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCg < 8:341805/149‑1 (MQ=255) gTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGa < 6:335233/149‑1 (MQ=255) atcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAgg < 7:27007/148‑1 (MQ=255) tcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCTGCACCGGCCCGGAGCTGGccaag < 6:265499/132‑4 (MQ=255) tcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCTGCACCGGCCCGGAGCTGGccaag > 5:265499/1‑129 (MQ=255) caCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgat > 6:74848/1‑148 (MQ=255) caCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGga < 6:134237/147‑1 (MQ=255) caCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGga > 5:134237/1‑147 (MQ=255) aCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatga > 6:38547/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatg < 8:119269/148‑1 (MQ=255) aCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatg < 8:124388/148‑1 (MQ=255) aCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTAGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAgcaag > 1:145864/1‑144 (MQ=255) cccccTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCACACAGGAAGATGATCGGCACACTCAAATAACGGTCACTGAGGCGGATTACCTTGGACAGCTACGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTAGAGgaaga > 2:5144/4‑148 (MQ=255) cGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatgat > 3:321691/1‑148 (MQ=255) gCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCTGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatgat > 5:102617/1‑147 (MQ=255) ccTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAg < 5:292050/149‑1 (MQ=255) cTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCggg > 4:28482/1‑149 (MQ=255) tCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGc > 3:253448/1‑149 (MQ=255) aTCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCgg < 8:290544/111‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTc < 4:270417/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCg > 7:46150/1‑149 (MQ=255) cAGTTGGTTGTGCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTTGATGATCGGCACACTCACATAAGGGTCAGTGTGGCGGATTAGCTTGGCCAGCTCCGTGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGtag < 1:5144/148‑3 (MQ=255) cAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCg < 4:253448/148‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCaa < 6:90681/149‑1 (MQ=255) gtcCTCGGCATACATGTAGATGATCGGCACACTCTCATAACGGTGACTGTGGCGGATTTCCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTg < 2:270752/148‑1 (MQ=255) gtcCTCCGCAGACAGCTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGc < 2:132404/149‑1 (MQ=255) cTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGACTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGa > 6:257728/1‑149 (MQ=255) ggCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCg < 8:293060/149‑1 (MQ=255) gCAGACAGGTTGATGATCGGCACTCTCAGATAACTGTCAGTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCGGGGCCGGTGCAGGGCTGCATGTAGAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCgg < 2:145864/149‑1 (MQ=255) gACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGggtc > 7:256950/1‑149 (MQ=255) aCAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGggtcc > 3:310966/1‑148 (MQ=255) ggTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGggtcggt > 5:271416/1‑148 (MQ=255) gTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAgg < 8:240994/91‑1 (MQ=255) gTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAgg > 7:240994/1‑91 (MQ=255) gTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGggtcggt > 2:89763/1‑147 (MQ=255) gTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACACGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGggtcggt > 1:280274/1‑147 (MQ=255) tAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAg > 6:27378/1‑149 (MQ=255) aGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAgg > 7:245392/1‑149 (MQ=255) aGATGATCGGCACAATCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGATCCGCGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGCTCCAGGATGATCAGGTCGGCCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAgg > 5:169811/1‑149 (MQ=255) gatgatCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGc > 8:57279/1‑149 (MQ=255) gCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCTGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGt > 6:277946/1‑148 (MQ=255) cacaCTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGa < 8:46150/149‑1 (MQ=255) cacaCTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGa < 5:27378/149‑1 (MQ=255) aTAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGAt < 6:326564/117‑1 (MQ=255) aTAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGAt > 5:326564/1‑117 (MQ=255) aaCGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATgccggcg > 4:15077/1‑149 (MQ=255) ggTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCggg > 6:301393/1‑116 (MQ=255) ggTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCggg < 5:301393/116‑1 (MQ=255) ggTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATgccggcgccg > 7:115189/1‑149 (MQ=255) aCTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGTGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCa < 2:280274/149‑1 (MQ=255) aCTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAg < 6:136077/132‑1 (MQ=255) aCTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAg > 5:136077/1‑132 (MQ=255) aCTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATgccggcgccggc > 1:49095/1‑147 (MQ=255) ggCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTaca < 1:89763/149‑1 (MQ=255) gCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTacac < 2:49095/149‑1 (MQ=255) cGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTacac < 5:38547/148‑1 (MQ=255) ggATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGc > 8:184634/1‑149 (MQ=255) aTTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTc < 5:74848/149‑1 (MQ=255) ttACCTTGGCCAGCTCTGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCg < 5:277946/149‑1 (MQ=255) atgccggCCTGCACCGGCCCGGAGCTGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGgt < 5:195609/144‑1 (MQ=255) atgccggCCTGCACCGGCCCGGAGCTGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGgt > 6:195609/6‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGgt < 8:245392/148‑1 (MQ=255) gccggCCTGCACCGGCCCGGAGCTGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGgtg > 6:73358/4‑148 (MQ=255) cggCCTGCACCGGCCCGGAGCTGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTa > 1:71572/2‑148 (MQ=255) aGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGc < 8:256950/149‑1 (MQ=255) cTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACTCTCGGTGTACATGGCCt < 4:310966/149‑1 (MQ=255) cTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCt < 7:319559/149‑1 (MQ=255) cTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCt > 8:319559/1‑149 (MQ=255) ccGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCAAGTACACGCTCgg < 2:34276/135‑1 (MQ=255) ccGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCAAGTACACGCTCgg > 1:34276/1‑135 (MQ=255) gCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCTGTGTgc < 7:57279/149‑1 (MQ=255) cGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCTGTGTgcgc < 8:115189/149‑1 (MQ=255) cGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCTGTGTgcgc > 8:94251/1‑149 (MQ=255) cGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCCGGAAGTCGGCAAGCTAGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCTGTGTgcgc > 1:295098/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTTGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCTGTGTGCGCGAAtcg > 3:104631/1‑149 (MQ=255) | GCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGGAAGTCGGCAAGCTCGGCCATGGTGCGGATCGGGTCGGTCAGGCTGCGGGTGAGCATGCCGGCGCCGGCCAGTACACGCTCGGTGTACATGGCCTGTGTGCGCGAATCG > NC_002947/655550‑655839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |