| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,018,565 | G→T | 7.1% | R166R (CGG→AGG) ‡ | dppF ← | dipeptide ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,018,565 | 0 | G | T | 7.1% | 216.2 / 4.3 | 69 | R166R (CGG→AGG) ‡ | dppF | dipeptide ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/32); new base T (3/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCAGGTTGTGCGAGATGAACACGTAGGCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTGATCAGCA > NC_002947/1018418‑1018708 | ccAGGTTGTGCGAGATGAACACGTAGGCTGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCgg < 6:35812/149‑1 (MQ=255) gtgCGAGATGAACACGTAGGCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAgg > 1:43633/1‑149 (MQ=255) tccGAGATGAACACGAAGGCGGTGTTCAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGc > 2:151433/3‑149 (MQ=255) cGAGATGAACACGTAGGCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCg < 2:43633/148‑1 (MQ=255) aaCACGTAGGCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATAcgct < 1:334652/148‑1 (MQ=255) acacGTAGGCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATAcgct > 8:83823/1‑147 (MQ=255) acacGTAGGCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATAcgct < 7:83823/147‑1 (MQ=255) cacGTAGGCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATAcgctggc < 2:323694/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGgcc > 2:347203/1‑149 (MQ=255) gtgtTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGgccgcc < 2:215070/149‑1 (MQ=255) gtTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTCCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCAACTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGccgccg > 3:298699/1‑148 (MQ=255) gAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGccgccg < 1:172227/145‑1 (MQ=255) gAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGccgccg > 2:172227/1‑145 (MQ=255) aCTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAAc < 7:253153/149‑1 (MQ=255) ttCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCTACTGAATCGACACGTCCAGAGCAGAGGTCGGTTCGACTGCCACCAGCACCATGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGAAACGCAGGCGCTGCCCGCGGGAGAACAtttt > 3:9572/1‑146 (MQ=255) ttCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCTTGGCCCGGGCGAtgatg < 4:188944/123‑5 (MQ=255) ttCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCTTGGCCCGGGCGAtgatg > 3:188944/1‑119 (MQ=255) gCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTggg > 2:234520/1‑149 (MQ=255) gCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGCTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTgg > 3:112201/1‑148 (MQ=255) cAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGt < 2:293782/149‑1 (MQ=255) tCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAgcg < 4:298699/149‑1 (MQ=255) ccATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAgcgc > 1:184716/1‑149 (MQ=255) cATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCt < 6:140662/149‑1 (MQ=255) aTGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTg > 5:317594/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACAtgtgtg < 2:172811/137‑1 (MQ=255) gAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACAtgtgtg > 1:172811/1‑137 (MQ=255) aCAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAg > 5:51392/1‑149 (MQ=255) aggagcAGCCCCTGCGCCGGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGGGCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTg < 6:25943/144‑1 (MQ=255) aGGTTCAGCTCCTGCGCCTGAATGGACACGTCCAGCGCAGAGGTAGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGTGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCACGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGt < 4:9572/148‑1 (MQ=255) gTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCACAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCt > 1:235631/1‑149 (MQ=255) tCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCg > 4:253423/1‑149 (MQ=255) cAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAAGATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCg < 1:151433/148‑1 (MQ=255) cAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCgg > 2:217730/1‑149 (MQ=255) cgcCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAgg < 6:274367/148‑1 (MQ=255) cgcCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAgg < 1:347203/148‑1 (MQ=255) ccTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGCCCAAGGCGATACGATGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTACTGCACCGGGCGAAGGcc > 8:247270/1‑148 (MQ=255) cTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGa > 5:161634/1‑149 (MQ=255) cTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGa < 6:51392/149‑1 (MQ=255) tGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGAc > 3:253057/1‑149 (MQ=255) aaTCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCt > 6:166124/1‑149 (MQ=255) aTCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTg < 2:80773/149‑1 (MQ=255) cGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCcatc < 6:161634/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGgc > 3:145185/1‑128 (MQ=255) gTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGgc < 4:145185/128‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGAc < 7:19113/138‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGAc > 8:19113/1‑138 (MQ=255) cgcAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCt > 6:88860/1‑137 (MQ=255) cgcAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCt < 5:88860/137‑1 (MQ=255) cAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCggg > 2:362665/1‑118 (MQ=255) cAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCggg < 1:362665/118‑1 (MQ=255) gTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGGCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCAtttt > 6:8052/1‑149 (MQ=255) gTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGGCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCAtttt < 5:8052/149‑1 (MQ=255) tcgGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCGGCTCCATCATCTTCGGCACTGTGTCgcggcg > 8:293285/1‑149 (MQ=255) gCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTc > 1:191208/1‑149 (MQ=255) ccaGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCAtcttc < 5:66878/125‑1 (MQ=255) ccaGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCAtcttc > 6:66878/1‑125 (MQ=255) caGCACCTTGGGTTGCAGCATCATCGGCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGCCCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGc > 1:186834/1‑148 (MQ=255) caGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGc < 2:186834/147‑1 (MQ=255) cTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCa < 2:235631/149‑1 (MQ=255) ttGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAg > 2:126015/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAg > 1:118598/1‑149 (MQ=255) gcaTCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTg < 3:133792/149‑1 (MQ=255) gcaTCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTg < 7:324758/149‑1 (MQ=255) atcatc‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTGAt < 7:118895/149‑1 (MQ=255) tcatc‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTTCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTAGAt > 4:299457/1‑148 (MQ=255) gtatc‑GCCTTGGCCCGGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTGAt > 4:328601/3‑148 (MQ=255) atc‑GCCCTGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGACGCCGGAGAACATGAGTGGGTAGCTCAGGTAGTGCTAGATGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTATGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTGATcag > 5:259514/1‑149 (MQ=255) atc‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTGATcag < 6:317594/149‑1 (MQ=255) tc‑GCCTTGGCCCGGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTGATcagc < 3:328601/149‑1 (MQ=255) gCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTGATcagca < 3:253423/148‑1 (MQ=255) | CCAGGTTGTGCGAGATGAACACGTAGGCGGTGTTGAACTCCTTCTGCAGATCCATGAACAGGTTCAGCACCTGCGCCTGAATCGACACGTCCAGCGCAGAGGTCGGTTCGTCGGCCACCAGCACCTTGGGTTGCAGCATCATC‑GCCCGGGCCAAGGCGATACGCTGGCGCTGGCCGCCGGAGAACATGTGTGGGTAGCGCTGGTAGTGCTCGGGGCGCAGGCCGACCTGCTCCATCATCTTCTGCACTTTGTCGCGGCGCTCGGCCTTGCTCAGCGAGGTGTTGATCAGCA > NC_002947/1018418‑1018708 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |