| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,183,456 | A→T | 6.8% | I310N (ATT→AAT) | mltF ← | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,183,456 | 0 | A | T | 6.8% | 216.9 / 4.9 | 73 | I310N (ATT→AAT) | mltF | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/35); new base T (2/3); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
TACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCGG > NC_002947/1183309‑1183602 | tACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAAt < 5:121589/149‑1 (MQ=255) aCTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGCAGCCATTg > 1:112885/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGCAGCCATTGGCtac < 2:112885/149‑3 (MQ=255) gccgccCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGCAGCCATTGGCTA‑Cca < 6:96222/149‑1 (MQ=255) cgccCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑Ccag > 8:290571/1‑148 (MQ=255) gccCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGCAGCCATTGGCTA‑Ccagga < 1:340042/149‑3 (MQ=255) gccCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGCAGCCATTGGCTA‑Ccagg > 2:340042/1‑147 (MQ=255) cccTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑Ccagcag > 1:159894/1‑149 (MQ=255) cTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGgc > 2:291665/1‑149 (MQ=255) cTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGgc < 5:297778/149‑1 (MQ=255) tGCTCTGCCTCGGGGCCAGTCGGGTCCACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAg < 2:333646/149‑1 (MQ=255) ctctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTc < 3:154064/149‑1 (MQ=255) tctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGgc > 6:284332/1‑141 (MQ=255) tctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGgc < 5:284332/141‑1 (MQ=255) tctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTc > 1:157556/1‑148 (MQ=255) ccTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCCGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑Cca > 6:162838/1‑131 (MQ=255) ccTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑Cca < 5:162838/131‑1 (MQ=255) ccTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGa < 2:99232/146‑1 (MQ=255) ccTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCt > 6:144952/1‑149 (MQ=255) cGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCt > 6:148597/1‑149 (MQ=255) gggTCCAGTCGGTTCGACACGCACATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGTTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCttgca > 8:114434/1‑145 (MQ=255) gTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGa > 6:10760/1‑149 (MQ=255) cAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGAcc < 1:15587/149‑1 (MQ=255) gTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 4:330759/149‑1 (MQ=255) tCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTgg > 3:10944/1‑149 (MQ=255) ggTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCg < 4:10944/149‑1 (MQ=255) ttCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCAGGTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACTTC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCg > 1:107564/1‑149 (MQ=255) cGACACGCCGATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAg < 7:240377/148‑1 (MQ=255) gcaccGCCCAGGCCATGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGct > 1:237007/5‑149 (MQ=255) gACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGc < 5:10760/148‑1 (MQ=255) acacGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGctc > 4:301799/1‑149 (MQ=255) acGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCg < 1:328773/123‑1 (MQ=255) acGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCg > 2:328773/1‑123 (MQ=255) acGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGctct < 8:41139/148‑1 (MQ=255) gCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTg > 7:85346/1‑148 (MQ=255) ggCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTtctc < 1:291665/147‑1 (MQ=255) gTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACtt < 2:237007/149‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTg < 5:144952/149‑1 (MQ=255) cgcTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTggg > 2:219641/1‑149 (MQ=255) cgcTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCAGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTggg > 4:90118/1‑149 (MQ=255) gcTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCTATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGc < 4:324703/149‑1 (MQ=255) catcatCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGtt < 1:219641/149‑1 (MQ=255) atcaGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCTCATC‑TATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCa < 4:262020/148‑1 (MQ=255) atcaGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAg < 5:148597/149‑1 (MQ=255) tcaGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGAAGGCGCTGTTGCAgg > 4:227355/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTg > 5:246676/1‑149 (MQ=255) cACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCg > 3:215346/1‑148 (MQ=255) aCGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGaa < 2:159894/149‑1 (MQ=255) cGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAg < 4:195869/149‑1 (MQ=255) tC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGGATTCCTGTTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGgtg > 1:210599/1‑147 (MQ=255) ggAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGgcgc > 8:231022/1‑149 (MQ=255) gACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGa < 3:339323/146‑1 (MQ=255) gACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGa > 4:339323/1‑146 (MQ=255) ttCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAgg > 8:246322/1‑118 (MQ=255) ttCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAgg < 7:246322/118‑1 (MQ=255) cGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCaa < 2:157556/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAg < 8:85346/149‑1 (MQ=255) ccACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGt > 3:265882/1‑149 (MQ=255) cacaTC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTc > 2:75100/1‑149 (MQ=255) cacaTC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTc < 7:231022/149‑1 (MQ=255) acaTC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAg > 6:362060/1‑125 (MQ=255) acaTC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAg < 5:362060/125‑1 (MQ=255) acaTC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCg > 7:281275/1‑149 (MQ=255) aTC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGa > 6:27322/1‑148 (MQ=255) gATTCCTTGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATg < 5:27322/149‑1 (MQ=255) ttCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGc > 5:96257/1‑149 (MQ=255) ccTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGcc < 6:246676/148‑1 (MQ=255) gTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgta < 1:94751/147‑1 (MQ=255) gTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgta < 1:75100/147‑1 (MQ=255) gTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgta > 2:94751/1‑147 (MQ=255) aGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGtagtag > 6:292635/1‑149 (MQ=255) ccAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCg < 5:292635/149‑1 (MQ=255) cAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCgg < 2:210599/149‑1 (MQ=255) aTGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTc < 7:196932/128‑1 (MQ=255) aTGGATG‑CCAGCACGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTc > 8:196932/1‑128 (MQ=255) | TACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTC‑‑TTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATC‑GATTCCTGGTAGCCAATGGCTG‑CCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCGG > NC_002947/1183309‑1183602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |