| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,277,325 | T→G | 8.3% | Q15H (CAA→CAC) | PP_1116 ← | resolvase family site‑specific recombinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,277,325 | 0 | T | G | 8.3% | 220.4 / 8.9 | 72 | Q15H (CAA→CAC) | PP_1116 | resolvase family site‑specific recombinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/32); new base G (2/4); total (36/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
GAGCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTCCCAAA > NC_002947/1277180‑1277473 | gagCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGa < 8:39391/149‑1 (MQ=255)gagCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGa > 8:123886/1‑149 (MQ=255) ttGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTg > 1:181278/1‑149 (MQ=255) ttGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCAAGGTGActctg < 1:81148/148‑2 (MQ=255) cACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCAAGGTGActctggcc < 5:90431/148‑5 (MQ=255) aCCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTgg > 3:203090/1‑146 (MQ=255) ccTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGa < 4:203090/149‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGa < 7:123886/149‑1 (MQ=255) ttCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGAt > 3:157317/1‑148 (MQ=255) ttCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCAAGGTGActctg > 8:127850/1‑140 (MQ=255) ttCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCAAGGTGActctg < 7:127850/141‑2 (MQ=255) cTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATAc < 4:157317/148‑1 (MQ=255) gACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCg > 1:88266/1‑148 (MQ=255) cGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAAt < 6:237848/149‑1 (MQ=255) gATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATg > 2:265131/1‑149 (MQ=255) tCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGt > 4:205111/1‑148 (MQ=255) ttCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAg > 1:326145/1‑149 (MQ=255) tCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACAACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAg < 4:275839/148‑1 (MQ=255) cAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGc > 4:175609/1‑148 (MQ=255) gagcgagcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGcaac > 1:232763/1‑148 (MQ=255) gagcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTgg < 4:73048/122‑1 (MQ=255) gagcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTgg > 3:73048/1‑122 (MQ=255) agcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCT‑GGCGTCCAGCCCTAGGCCAGAGTCCCCTTGACGCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGgtt > 4:101464/1‑149 (MQ=255) gcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGttt < 2:88266/149‑1 (MQ=255) gcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGttt > 4:33685/1‑149 (MQ=255) acaTCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGc > 4:186312/1‑149 (MQ=255) caTCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGAc > 3:198307/1‑99 (MQ=255) caTCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGAc < 4:198307/99‑1 (MQ=255) acaAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCt > 4:204360/1‑149 (MQ=255) aaTTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGTATGTAATCACGCT‑GGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTgtgt < 3:101464/149‑1 (MQ=255) cACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTAt < 2:181278/148‑1 (MQ=255) aCCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGTCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTaa < 5:245783/109‑1 (MQ=255) aCCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTaa > 6:245783/1‑109 (MQ=255) cAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGActct < 4:6776/87‑1 (MQ=255) cAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGActct > 3:6776/1‑87 (MQ=255) cAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAgg > 1:101041/1‑149 (MQ=255) cAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAgg < 1:265131/149‑1 (MQ=255) cAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAgg < 3:186312/149‑1 (MQ=255) aCGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGt > 7:2159/1‑89 (MQ=255) aCGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGt < 8:2159/89‑1 (MQ=255) ccAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTTGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTAt < 2:156769/148‑1 (MQ=255) ccAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTAt < 3:175609/148‑1 (MQ=255) ttCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGcc < 2:232763/149‑1 (MQ=255) gCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCAt > 7:241576/1‑148 (MQ=255) ttGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGACGCCAATTTATCAACTGCCATGAg > 5:157423/1‑149 (MQ=255) gggCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTg < 7:260830/96‑1 (MQ=255) gggCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTg > 8:260830/1‑96 (MQ=255) ggCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTa < 3:205111/148‑1 (MQ=255) gCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGt < 8:241576/149‑1 (MQ=255) ttGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCATACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAAtt < 3:33685/149‑1 (MQ=255) ttGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAAtt > 6:165559/1‑149 (MQ=255) ttGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAAtt < 2:101041/149‑1 (MQ=255) aTGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTg > 1:12246/1‑146 (MQ=255) aTGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTg < 2:12246/146‑1 (MQ=255) aaTCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGAc > 7:218254/1‑149 (MQ=255) aaTCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGAc > 7:154942/1‑149 (MQ=255) aaTCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGAc > 4:337237/1‑149 (MQ=255) aTCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGa < 4:246980/104‑1 (MQ=255) aTCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGa > 3:246980/1‑104 (MQ=255) ggCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTa < 5:165559/147‑1 (MQ=255) gCTTCCAGACCTAGGCCAGATTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGAGCAGACGTTCGTTAGt < 3:204360/148‑1 (MQ=255) aGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATg > 5:149262/1‑149 (MQ=255) tAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAAt > 5:149900/1‑149 (MQ=255) aGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGAcgttcgt < 6:193206/132‑1 (MQ=255) aGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGAcgttcgt > 5:193206/1‑132 (MQ=255) ccAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTa < 6:149262/149‑1 (MQ=255) aagagTCAAGGTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTc > 6:88345/2‑146 (MQ=255) agagTCAAGGTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGa < 5:88345/149‑1 (MQ=255) gagTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGAt > 3:269232/1‑149 (MQ=255) aCCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAGATGGAAATTCTAGATTTcc < 8:218254/148‑1 (MQ=255) aCCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTcc < 3:337237/148‑1 (MQ=255) aCCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTcc > 8:182550/1‑148 (MQ=255) ttGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTCCCaaa > 3:206924/1‑149 (MQ=255) ttGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTCCCaaa > 2:336004/1‑149 (MQ=255) ttGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATAAACTGCCAtac > 2:47911/1‑89 (MQ=255) | GAGCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTCCCAAA > NC_002947/1277180‑1277473 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |