Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,436,436 | T→C | 6.6% | T210A (ACC→GCC) | PP_1257 ← | 1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,436,436 | 0 | T | C | 6.6% | 225.6 / 4.3 | 78 | T210A (ACC→GCC) | PP_1257 | 1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/38); new base C (3/2); total (37/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.57e-01 |
TCGCAGCCTTCATCGAACGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACCGCCAAACTCCTTGAAGCCGAT > NC_002947/1436288‑1436583 | tCGCAGCCTTCATCGAACGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGt < 6:134370/149‑1 (MQ=255) ccTTCATCGAACGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGgc < 5:106777/149‑1 (MQ=255) tCATCGAACGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGcc > 6:316209/1‑149 (MQ=255) aTCGAACGACGACAGCACCTCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACATCGCGCGGCAGCGCATTGACGATGCCGGTGATGTCGACgg > 4:307252/1‑149 (MQ=255) tCGAACGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGt < 5:247898/149‑1 (MQ=255) gAACGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTg < 7:246335/148‑1 (MQ=255) gAACGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTg < 5:66293/148‑1 (MQ=255) aaCGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGc < 6:31335/149‑1 (MQ=255) acgacgACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCg < 4:329362/149‑1 (MQ=255) cgacAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTg > 3:123635/1‑148 (MQ=255) gacAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCa < 3:46264/149‑1 (MQ=255) aGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGtt < 4:63983/149‑1 (MQ=255) aGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGtt > 3:63983/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACg > 5:368625/1‑148 (MQ=255) gCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACg > 3:274563/1‑147 (MQ=255) aGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGcc < 4:123635/149‑1 (MQ=255) gccgcTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATg < 7:85371/149‑1 (MQ=255) cgcTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGca > 4:356978/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGa < 7:79725/132‑1 (MQ=255) ccAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACAAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGa > 8:79725/1‑132 (MQ=255) cAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGGTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCt > 2:314214/1‑149 (MQ=255) aGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGACGATGCCGGCGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTg > 3:212750/1‑149 (MQ=255) cgcgcCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGTTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTc < 3:307252/149‑1 (MQ=255) cgcgcCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTc < 4:358692/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCg < 5:227137/107‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCg > 6:227137/1‑107 (MQ=255) cAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGacac > 1:178139/1‑149 (MQ=255) cAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGacac > 2:192010/1‑149 (MQ=255) ggcggcGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCg > 1:242844/1‑149 (MQ=255) ggCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCa < 1:192010/149‑1 (MQ=255) gCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCAt > 2:38520/1‑146 (MQ=255) gCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCa < 1:38520/148‑1 (MQ=255) cACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAgg > 1:225430/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGt < 5:316209/149‑1 (MQ=255) cGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGt < 2:225430/149‑1 (MQ=255) gggCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGt > 2:117051/1‑148 (MQ=255) gCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGt > 7:207469/1‑94 (MQ=255) gCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGt < 8:207469/94‑1 (MQ=255) gCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGAACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGa > 2:50983/1‑148 (MQ=255) gCGTCGCCGTTGGCGGGCTGTTTGCTGAGGCTCACCTGTTGCAGCACTTCGCGCGGGAGCGCATTGCCTATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCAACTGGGTGTCGACTCCGACCATCAGGGTGAc < 4:250102/149‑1 (MQ=38) cGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGgtgt < 3:325031/123‑1 (MQ=255) cGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGgtgt > 4:325031/1‑123 (MQ=255) cGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCg < 3:224239/149‑1 (MQ=255) ccTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGATGAcgatgt > 6:300228/1‑143 (MQ=255) ccTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGGTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTc < 1:314214/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGa > 7:269033/1‑118 (MQ=255) gcggcCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGa < 8:269033/118‑1 (MQ=255) cTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAgg > 4:231623/1‑149 (MQ=255) tGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGt > 5:280317/1‑149 (MQ=255) gTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGt > 8:60964/1‑148 (MQ=255) tttGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGt < 4:274563/147‑1 (MQ=255) tttGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTg < 1:117051/148‑1 (MQ=255) tCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGTGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGc > 6:295613/1‑149 (MQ=255) aGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTCGCGTTCCAGTTGACGAAGCCATGCACCACATGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCAACATTGGAGGTGATGTGCTc > 5:289541/1‑149 (MQ=39) tCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTcggcg > 7:26681/1‑149 (MQ=255) cACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTcggcgg > 5:259011/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCggcggc < 7:60964/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTcg < 7:80687/140‑1 (MQ=255) gTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTcg > 8:80687/1‑140 (MQ=255) gTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAg > 4:144857/1‑149 (MQ=255) ttGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAgc > 1:226949/1‑149 (MQ=255) agcaCTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCaa < 8:135795/149‑1 (MQ=255) agcaCTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCaa < 3:231623/149‑1 (MQ=255) agcaCTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGCGATGGCGCCGGTGGCGTTGCTGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATcc < 1:26747/117‑1 (MQ=255) agcaCTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGCGATGGCGCCGGTGGCGTTGCTGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATcc > 2:32115/1‑117 (MQ=255) agcaCTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGCGATGGCGCCGGTGGCGTTGCTGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATcc < 1:32115/117‑1 (MQ=255) agcaCTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGCGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATcc > 2:26747/1‑117 (MQ=255) cgcgggGCAGCTCATTGCCGATGCCGTTGATGGCGCAGGTGGCGTTGCAGTTGACTAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCTACGATCAGGTTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCgtc < 6:289541/148‑3 (MQ=255) gcgGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCa > 8:285037/1‑149 (MQ=255) ccGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACCGCCAAACTCCtt < 5:295613/149‑1 (MQ=255) ccGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACCGCCAAACTCCtt < 3:144857/149‑1 (MQ=255) ccGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACCGCCAAACTCCtt < 8:26681/149‑1 (MQ=255) ccGATGCCGGAGATGGCGGCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGAGATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACAGCCAAACTCCtt < 4:212750/149‑1 (MQ=255) cGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCaa < 6:176680/124‑1 (MQ=255) cGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCaa > 5:176680/1‑124 (MQ=255) aTGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACCGCCAAACTCCTTGaa < 3:356978/149‑1 (MQ=255) tGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGTGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTTCTCTGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACCGCCAAACTCCTTGAAg < 1:50983/149‑1 (MQ=255) ggTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACAACCTGGGTGTCCGCACCGACCATCAGGGAGACATCGTCTTCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCAACCGCCAAACTCCTTGAAGCCg > 5:253333/1‑148 (MQ=38) gTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACCGCCAAACTCCTTGAAGCCGAt < 3:307475/149‑1 (MQ=255) | TCGCAGCCTTCATCGAACGACGACAGCACCGCCAGCGCCGCTTCCAGCTCGCGCGCCAGGCGGCGGGCACGGGCGTCGCCTTTGGCGGCCTGTTTGCTCAGGCTCACCAGTTGCAGCACTTCGCGCGGCAGCGCATTGCCGATGCCGGTGATGGCGCCGGTGGCGTTGCAGTTGACGAAGCCATGCACCACCTGGGTGTCGACACCGACCATCAGGGTGACATCGTCATCCTTGGAGGTGATGTGCTCGGCGGCGTAGCGCAAGTCGGCGCCACCGCCAAACTCCTTGAAGCCGAT > NC_002947/1436288‑1436583 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |