| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,452,862 | A→T | 6.4% | T342S (ACG→TCG) | PP_1271 → | putative Multidrug efflux MFS transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,452,862 | 0 | A | T | 6.4% | 221.3 / 2.0 | 75 | T342S (ACG→TCG) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/34); new base T (2/3); total (38/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTACCTGCTGCAGGT > NC_002947/1452715‑1453010 | gTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTCTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGAc > 1:242838/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCCGTcagcgg > 3:169509/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCCGTcagcgg > 2:43419/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGCTCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCa > 7:167947/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCa < 1:7091/147‑1 (MQ=255) gCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCCGTCAGCGGCag < 4:169509/148‑2 (MQ=255) gCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCCCAACTGATCGCCCTGCCGCCGTCAGCGGCagg < 1:43419/149‑3 (MQ=255) cggcggGCTGGGCGTGCTTTCGGGTGGGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCCGTCAGCGGCagggc < 4:237484/149‑5 (MQ=255) ggCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACtgtg > 3:210010/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCTGACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACtgtg > 1:289509/1‑148 (MQ=255) gTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCaa > 2:311115/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCagggc > 4:23976/1‑138 (MQ=255) cTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACAt < 8:276885/149‑1 (MQ=255) tttCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTg > 8:165063/1‑149 (MQ=255) tCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGa > 4:216214/1‑149 (MQ=255) gggTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACt < 4:210010/149‑1 (MQ=255) gggCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCt < 1:139667/149‑1 (MQ=255) gcagcaTCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTg < 7:251474/142‑1 (MQ=255) gcagcaTCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTg > 8:251474/1‑142 (MQ=255) gcagcaTCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTgg < 5:315564/149‑1 (MQ=255) gcagcaTCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTgg < 7:165063/149‑1 (MQ=255) caTCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGc > 3:86395/1‑149 (MQ=255) tCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGa < 5:121943/102‑1 (MQ=255) tCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGa > 6:121943/1‑102 (MQ=255) tCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTg > 1:56729/1‑149 (MQ=255) ccccTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACtgtg > 4:241400/1‑114 (MQ=255) ccccTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACtgtg < 3:241400/114‑1 (MQ=255) cccTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGt > 1:162445/1‑143 (MQ=255) cccTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGt < 2:162445/143‑1 (MQ=255) ccTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCAGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGc > 3:227944/1‑149 (MQ=255) gCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTgg > 8:16598/1‑149 (MQ=255) gCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTgg > 6:299101/1‑149 (MQ=255) ccTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGc < 5:223387/149‑1 (MQ=255) tACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCTTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCt > 4:19069/1‑149 (MQ=255) ccTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTgg < 8:167947/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTgg < 7:16598/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCCGCACAGTGCAACATCCGCGACGTGGACTGCCGCTGGGTGATGGGAATTGGCCTGGc > 4:62335/1‑149 (MQ=255) ttGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGt < 8:58975/130‑1 (MQ=255) ttGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGt > 7:58975/1‑130 (MQ=255) gcAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGc > 8:79024/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTACCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGAt < 3:186851/141‑1 (MQ=255) ccAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACAAGCCCGTTTATGATGCTGGAGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTACAGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGATGGGTGCTGGCCATTGGCCTCGCGAt > 4:186851/1‑141 (MQ=255) cAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCgg < 3:216214/148‑1 (MQ=255) cAGGGCT‑ACCGCCCAGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCTCGCAGTTGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGTCGATGCTGGCGgt < 3:354318/149‑1 (MQ=255) gggCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCTACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGgtgt > 1:276972/1‑149 (MQ=255) ccGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCtgt < 1:311115/148‑1 (MQ=255) cGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCAGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTgtgt < 4:227944/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGtt < 2:276972/149‑1 (MQ=255) cGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGgc < 2:289509/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTgg > 2:45148/1‑147 (MQ=255) gACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGgcagc < 6:259027/145‑1 (MQ=255) gACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGgcagc > 5:259027/1‑145 (MQ=255) aCCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCTTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCct < 3:19069/149‑1 (MQ=255) atgCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGt < 5:15262/148‑1 (MQ=255) tgCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTgg < 1:45148/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGa > 2:348588/1‑149 (MQ=255) tggtggCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATc > 3:269826/1‑149 (MQ=255) ccATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGc > 5:346607/1‑149 (MQ=255) cATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCAGCTGGGTGCTGGGCATTGGACTTGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCATCAGACTGCTGACACGAGAGTGGAGACGTgtc > 6:250773/1‑146 (MQ=255) ccGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACt < 2:56729/148‑1 (MQ=255) cGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGc < 8:57700/80‑1 (MQ=255) cGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGc > 7:57700/1‑80 (MQ=255) gCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGAt < 1:227013/135‑1 (MQ=255) gCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGAt > 2:227013/1‑135 (MQ=255) cAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTa < 4:269826/149‑1 (MQ=255) cAACTGATCGCCCTGCCGATGACGGCGGCACTGTGCACCATCCGCGCCGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGGTGGCAGCAGCCTTCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTcaa < 5:250773/149‑3 (MQ=255) gATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGCCTTCTACCCGt > 4:198849/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGgcagca < 5:55661/103‑1 (MQ=255) gCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGgcagca > 6:55661/1‑103 (MQ=255) gCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTa > 5:218070/1‑149 (MQ=255) cccTGCCGCTGACGGTGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTAc < 1:330887/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTAcc < 1:348588/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTAcc > 2:178600/1‑149 (MQ=255) ccGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTACctgct < 6:346607/149‑1 (MQ=255) ccGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTACctgct > 4:324555/1‑149 (MQ=255) gACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTg > 4:243579/1‑56 (MQ=255) gACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTg < 3:243579/56‑1 (MQ=255) aCGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTACCTGCTGCAGgt < 1:178600/149‑1 (MQ=255) | GTGACCCTGGCCGGCGTGCTGGTCGTGCTTTCGGGTGTGGGCAGCATCCCCTCGGCCTACCTTGCGCAGATCCAGGGCT‑ACCGCCCGGCGCAGACCAGCCCGTTGATGATGCTGGTGGCCATGCCGCAACTGATCGCCCTGCCGCTGACGGCGGCACTGTGCAACATCCGCGCAGTGGACTGCCGCTGGGTGCTGGGCATTGGCCTGGCGATGCTGGCGGTGTCCTGTGTTGGCAGCAGCCTGCTGACCAGCGAGTGGATCCGTGGCGACTTCTACCCGTTCTACCTGCTGCAGGT > NC_002947/1452715‑1453010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |