Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,481,515 | T→C | 10.6% | S75G (AGC→GGC) | rhlB ← | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,481,515 | 0 | T | C | 10.6% | 171.7 / 10.4 | 66 | S75G (AGC→GGC) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/26); new base C (5/2); total (38/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.16e-01 |
TAACCCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGT > NC_002947/1481367‑1481662 | tAACCCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCt > 6:231285/1‑149 (MQ=255) ccAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGcc > 7:314472/1‑149 (MQ=255) ggACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCtgt > 4:137396/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAATCCCAGGTCGTGTATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCtgtg < 7:346669/148‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGc < 5:79476/141‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGc > 6:79476/1‑141 (MQ=255) tGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTggctt > 5:134986/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGtt < 8:314472/148‑1 (MQ=255) aggaCGGTAAGCCCAGGTCGTGGAGGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTggcttg < 8:150994/128‑1 (MQ=255) aGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTggcttt > 7:150994/1‑130 (MQ=255) tACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTggctt > 8:287812/1‑128 (MQ=255) tACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCCAGCCTGTgg < 8:25110/125‑1 (MQ=255) tACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCCAGCCTGTgg > 7:25110/1‑125 (MQ=255) gggAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGttt < 4:231932/149‑1 (MQ=255) gggAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGCGTATTGCCTTACTGCGGC‑TCGACCCCGAAGTCATCGGGCTTCCAC‑AGGCTCGACTGTGGCTTCGGCTTGCGTTcgcgacgccacct > 8:92136/1‑144 (MQ=255) aaGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTggcttg > 3:339706/1‑123 (MQ=255) aaGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTggcttg < 4:339706/123‑1 (MQ=255) cccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCtt < 8:133217/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑GGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGttt > 3:340730/1‑142 (MQ=255) ccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑GGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGttt < 4:340730/142‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTAGCGGAGAGGTTTGTCCTTg > 3:72118/1‑149 (MQ=255) tCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCgg < 2:337711/149‑1 (MQ=255) tGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCg > 8:205891/1‑149 (MQ=255) ggCGTGGATCAGCTGGTTGGACTGCTTGATGTCGTGGTAGCGGGTTTTGCCTTCCTGGGGC‑TGGACCACGAAGTGTTGGGGCTTCCACTGGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATc < 1:103208/148‑1 (MQ=255) cctGCATAAGCTCGTAGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCCGGTTAAGCCTACCTGAGGC‑TCGAACACTAACTCATCGCGCTTCCAC‑AGGCTGGCCAGTGGCATGGGCTAGCGTTCGCGGCGCGGTTTCTCCTAGGCAGGTTCATCgc > 4:295024/3‑146 (MQ=255) aTCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTgg > 7:66730/1‑149 (MQ=255) gTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCgcgg > 7:279351/1‑149 (MQ=255) gTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCgcgg < 7:205891/149‑1 (MQ=255) gACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGcggcgg > 4:155936/1‑148 (MQ=255) gACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCggcggc < 6:310770/149‑1 (MQ=255) aGCTTGAAGTCGTGGAAGTGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAgg > 2:137089/1‑149 (MQ=255) aGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAgg < 5:231285/149‑1 (MQ=255) cTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGtt > 3:210199/1‑149 (MQ=255) gAAGTCGTGGAAGTGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTg < 1:137089/147‑1 (MQ=255) gTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAg < 2:164334/149‑1 (MQ=255) gTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCGTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGcc > 1:204555/1‑149 (MQ=255) gTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCt > 4:4271/1‑149 (MQ=255) ggAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTg < 3:155936/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTggg > 3:155555/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTggggg > 3:321485/1‑149 (MQ=255) gggTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCg > 2:270729/1‑149 (MQ=255) tGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGtt < 3:295024/148‑1 (MQ=255) gCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTg < 2:204555/148‑1 (MQ=255) ttCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTGCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCAt > 5:289988/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCt > 7:318809/1‑129 (MQ=255) ccTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCt < 8:318809/129‑1 (MQ=255) cTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATgg < 8:279351/148‑1 (MQ=255) tCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTg > 6:34543/1‑75 (MQ=255) aCCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTAATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTggg < 6:147289/122‑1 (MQ=255) aCCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTAATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTggg > 5:147289/1‑122 (MQ=255) cACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGtt > 5:38892/1‑149 (MQ=255) aCGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGttt > 3:28459/1‑149 (MQ=255) tCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCcgc > 7:277221/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCcg < 7:274788/146‑1 (MQ=255) ttCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCcg > 8:274788/1‑146 (MQ=255) ggCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggccg < 6:134986/149‑1 (MQ=255) gccAC‑AGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgg > 7:114036/2‑102 (MQ=255) gccAC‑AGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgg < 8:114036/101‑1 (MQ=255) gccAC‑AGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCt > 3:78607/2‑149 (MQ=255) gccAC‑AGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCt > 2:123450/2‑149 (MQ=255) ccAC‑AGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCtt > 5:150249/1‑149 (MQ=255) cac‑aGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTAGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATAGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTc > 7:90723/1‑149 (MQ=255) c‑aGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCg < 2:322265/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCgg > 1:358254/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGACCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGc > 1:259027/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCg < 4:28459/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCCGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGt < 8:90723/149‑1 (MQ=255) | TAACCCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGC‑TCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCAC‑AGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGT > NC_002947/1481367‑1481662 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |