| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,570,243 | A→G | 5.8% | I352V (ATT→GTT) | pcaF‑I → | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,570,243 | 0 | A | G | 5.8% | 203.2 / 2.1 | 69 | I352V (ATT→GTT) | pcaF‑I | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/32); new base G (2/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 | |||||||||||
GCAAACTGACCGAGCGTCTGGGGATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTGGGTGTCGGCCAAGGTCTGGCGTTGGCCATC > NC_002947/1570097‑1570380 | gcAAACTGACCGAGCGTCTGGGGATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCAtt > 2:337138/1‑149 (MQ=255) aCCGAGCGTCTGGGGATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTg < 4:87739/147‑1 (MQ=255) aCCGAGCGTCTGGGGATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAAAGGCGGTGCCATTGCCCTgg < 6:303325/148‑1 (MQ=255) cGAGCGTCTGGGGACAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCGCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGcc > 6:247483/1‑149 (MQ=255) tCTGGGGATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCAccccc > 7:53771/1‑149 (MQ=255) tGGGGATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTg > 6:276347/1‑149 (MQ=255) gggATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTggg > 1:299162/1‑149 (MQ=255) gggATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTggg > 2:351729/1‑149 (MQ=255) gCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGa < 2:299162/148‑1 (MQ=255) cGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGc > 7:330138/1‑149 (MQ=255) tAAGTGATTTCGACGTGCTCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGt < 3:272207/149‑1 (MQ=255) tAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGt > 8:302663/1‑149 (MQ=255) tGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAGTGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCAc > 4:319628/1‑149 (MQ=255) tGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCaa > 3:75176/1‑148 (MQ=255) gATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGACCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACg > 5:20348/1‑149 (MQ=255) aTTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGc > 2:310208/1‑149 (MQ=255) aTTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGGGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACg < 5:297360/148‑1 (MQ=255) ttCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCt > 8:1924/1‑149 (MQ=255) ttCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACAATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCt > 1:102153/1‑149 (MQ=255) tCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTg > 2:327404/1‑149 (MQ=255) cGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTgg > 3:134377/1‑149 (MQ=255) gACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACTCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTgg < 8:53771/148‑1 (MQ=255) gACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTgg < 8:330138/148‑1 (MQ=255) gATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTactga < 5:219829/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTactga < 5:276347/148‑1 (MQ=255) cGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAACGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTCTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCATAATGCCGGTGCCATTGCCCTGGGCCAcc > 5:157670/1‑113 (MQ=255) gAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGc < 4:134377/149‑1 (MQ=255) ttAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGt‑ta > 4:64397/1‑148 (MQ=255) gAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGa > 7:87668/1‑115 (MQ=255) gAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGa < 8:87668/115‑1 (MQ=255) gAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCAc > 2:278357/1‑147 (MQ=255) gAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCAc > 2:88095/1‑147 (MQ=255) aaGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAg > 2:38150/1‑149 (MQ=255) aaGCGTTTGCCAACCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAg > 4:323691/1‑149 (MQ=255) aGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGc > 1:316113/1‑149 (MQ=255) tttGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAGTGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGga < 3:319628/149‑1 (MQ=255) tttGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTg > 4:262996/1‑147 (MQ=255) tttGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGga < 1:351729/149‑1 (MQ=255) ccagccaAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGcc < 8:311294/117‑1 (MQ=255) ccagccaAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGcc > 7:311294/1‑117 (MQ=255) caAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTgg < 1:337138/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCg < 7:302663/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCg > 3:118531/1‑149 (MQ=255) tGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGT‑AACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCg < 3:12884/143‑1 (MQ=255) tGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGT‑AACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCg > 4:12884/1‑143 (MQ=255) gCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCaa < 3:261481/149‑1 (MQ=255) gCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCa < 7:312457/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGTATGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAg < 1:38150/149‑1 (MQ=255) tgcGTGAGCTGGGTGTGGCTGACAATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCGCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTg < 2:102153/149‑1 (MQ=255) tGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGagaaga > 1:66506/1‑125 (MQ=255) tGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGagaaga < 2:66506/125‑1 (MQ=255) tGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGa < 6:20348/149‑1 (MQ=255) aGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCCAGGCCCTTGCGAc < 1:310208/148‑1 (MQ=255) cTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCAt < 7:1924/149‑1 (MQ=255) ggTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCAtgt < 3:262996/148‑1 (MQ=255) gtgtGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCAtgtgt < 5:247483/149‑1 (MQ=255) gCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTgg < 1:88095/148‑1 (MQ=255) tGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCaa > 4:253548/1‑123 (MQ=255) tGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCaa < 3:253548/123‑1 (MQ=255) gATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCGTTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTactgact < 6:319187/84‑1 (MQ=255) gATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCGTTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTactgact < 6:313546/84‑1 (MQ=255) gATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCGTTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTactgact > 5:319187/1‑84 (MQ=255) gATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCGTTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTactgact > 5:313546/1‑84 (MQ=255) tGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTGGGTGTCGGcc < 1:278357/149‑1 (MQ=255) aGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTGGGTGTCGGCCAAGGTCTg < 2:316113/149‑1 (MQ=255) cccTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTGGGTGTCGGCCAAGGTCTGGCGTTgg > 6:55338/1‑149 (MQ=255) ccTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTGGGTGTCGGCCAAGGTCTGGCGTTGGc > 2:245452/1‑149 (MQ=255) aTGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTGGGTGTCGGCCAAGGTCTGGCGTTGGCCATc > 4:346748/1‑149 (MQ=255) aTGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTGGGTGTCGGCCAACGCCAGACCTTGGccgac < 1:327404/149‑4 (MQ=39) | GCAAACTGACCGAGCGTCTGGGGATAGCGGTAAGTGATTTCGACGTGATCGAGCTTAACGAAGCGTTTGCCAGCCAAGGCCTGGCGGTGCTGCGTGAGCTGGGTGTGGCTGACGATGCGCCCCAGGTAAACCCTAATGGCGGTGCCATTGCCCTGGGCCACCCCCTGGGCATGAGCGGTGCACGCCTGGTACTGACTGCGT‑TGCACCAGCTGGAGAAGAGTGGCGGTCGCAAGGGCCTGGCGACCATGTGTGTGGGTGTCGGCCAAGGTCTGGCGTTGGCCATC > NC_002947/1570097‑1570380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |