Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,693,792 | C→G | 7.7% | R87R (CGC→CGG) ‡ | PP_1489 → | CheW domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,693,792 | 0 | C | G | 7.7% | 206.5 / 7.1 | 65 | R87R (CGC→CGG) ‡ | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/29); new base G (2/3); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 |
TGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGG > NC_002947/1693647‑1693937 | tgtTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctg > 7:316912/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctgg < 4:1967/148‑1 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgct < 6:206911/149‑1 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgc < 3:219454/148‑1 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctg < 5:172971/149‑1 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctg > 6:336585/1‑149 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgctg < 4:145265/149‑1 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACATTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCCGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctg > 4:151313/1‑149 (MQ=255) gCCGCTCAAGCCAATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCAc > 2:69575/1‑148 (MQ=255) cGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAc > 6:198281/1‑149 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAgg > 1:83003/1‑149 (MQ=255) aGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc > 1:211308/1‑149 (MQ=255) aGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc < 4:6523/149‑1 (MQ=255) cGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggcggc < 4:152536/149‑1 (MQ=255) aGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCtt < 8:316912/149‑1 (MQ=255) ggCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTg < 1:69575/149‑1 (MQ=255) cACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGc < 2:211308/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCATGGcc > 2:300683/1‑149 (MQ=255) gcctgGGTCGCGGGCATTCTCGCCCAGCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGcc < 5:20353/145‑1 (MQ=255) gggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTg < 8:327494/149‑1 (MQ=255) ggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTg < 5:336585/148‑1 (MQ=255) ggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTg < 7:38016/148‑1 (MQ=255) gCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctg < 5:333356/87‑1 (MQ=255) gCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctg > 6:333356/1‑87 (MQ=255) gCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGCTCCAGGATCAGGCCaagctgca < 2:83003/149‑8 (MQ=255) cccATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAAcc < 5:198281/149‑1 (MQ=255) cATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCt < 8:14994/149‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTTAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCTTGCGTTGc < 4:358578/149‑1 (MQ=255) ggTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTgg > 1:105018/1‑105 (MQ=255) ggTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTgg < 2:105018/105‑1 (MQ=255) gTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGa > 4:197234/1‑149 (MQ=255) ttCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGc < 7:224591/96‑1 (MQ=255) ttCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGc > 8:224591/1‑96 (MQ=255) tCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCTGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCAcc < 8:26302/124‑1 (MQ=255) tCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCAcc > 7:26302/1‑124 (MQ=255) aTCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTc > 4:242771/1‑147 (MQ=255) ttGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTAt > 6:58779/1‑149 (MQ=255) ccgccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCTGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATggg < 3:151313/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTg > 6:110549/1‑149 (MQ=255) gAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGaca > 3:327247/1‑149 (MQ=255) gAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGaca > 3:257542/1‑149 (MQ=255) gCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGaca > 3:96205/1‑147 (MQ=255) cTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAg < 4:96205/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGAt > 7:315350/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCTGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGAt < 7:264771/148‑1 (MQ=255) ggcggTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCt > 6:339520/1‑148 (MQ=255) tGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTg > 3:358975/1‑149 (MQ=255) gCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTgg < 3:197234/149‑1 (MQ=255) cAACGCACCAGCAGCCTCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCTGCTTGGGCTGATGCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgcgc < 4:328646/139‑1 (MQ=255) cAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgctc > 3:328646/1‑137 (MQ=255) cAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCt > 5:161554/1‑141 (MQ=255) cAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCt < 6:161554/141‑1 (MQ=255) aaCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGc < 2:51103/131‑1 (MQ=255) aaCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGc > 1:51103/1‑131 (MQ=255) aaCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGc > 7:60446/1‑149 (MQ=255) aCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGcc > 7:339457/1‑149 (MQ=255) cACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGAGGCGCCTTATCTGGGCCCgg > 6:253592/1‑149 (MQ=255) aCCAGCACCAGGCGGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTgg < 7:92600/118‑1 (MQ=255) aCCAGCACCAGGCGGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTgg > 8:92600/1‑118 (MQ=255) ccAGCACCAGGCGGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTg > 5:14896/1‑149 (MQ=255) cAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGACACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTgc > 5:28184/1‑149 (MQ=255) cAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTgc > 3:288421/1‑149 (MQ=255) gCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTgcgc > 5:72897/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCa < 8:315350/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAgg < 3:242771/149‑1 (MQ=255) | TGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGG > NC_002947/1693647‑1693937 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |