| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,824,541 | A→G | 86.7% | L238P (CTG→CCG) | mutS ← | DNA mismatch repair protein MutS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,824,541 | 0 | A | G | 86.7% | 147.1 / 12.2 | 60 | L238P (CTG→CCG) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/3); new base G (28/24); total (33/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.04e-01 | |||||||||||
GTCGCGCCCGCCGGCCAGGTTGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAGTCCCAGGGGGCGCGGCGGCGGGC > NC_002947/1824399‑1824677 | gtCGCGCCCGCCTGCCAGGTTGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTcggca < 3:296537/146‑1 (MQ=255)gtCGCGCCCGCCGGCCAGGTTGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGCCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTcggca > 4:296537/1‑146 (MQ=255) tCGCGCCCGCCGGCCAGGTTGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGgcagg > 6:241747/1‑147 (MQ=255) tCGCGCCCGCCGGCCAGCTTGATGTCCAGCTCCAGGTTGCCGAGGCTCGCCCCATCGAGGATGACAGTATCGTCCAGACGCTCCTGGCGCAGGCAGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTAGGCATAGGTCggcaggca > 6:247036/1‑149 (MQ=255) cgccgGCCAGGTTGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCcggcg > 2:28423/1‑149 (MQ=255) gTTGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATgg > 6:142413/1‑149 (MQ=255) ttGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGcc < 4:29171/134‑1 (MQ=255) ttGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGcc > 3:29171/1‑134 (MQ=255) aTGGCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCa < 5:47024/148‑1 (MQ=255) tGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAgg > 6:63817/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGt > 6:310079/1‑149 (MQ=255) gcggcgGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGc < 3:30499/149‑1 (MQ=255) gcggcTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGa < 1:28423/149‑1 (MQ=255) tGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATg > 8:237834/1‑119 (MQ=255) tGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATg < 7:237834/119‑1 (MQ=255) gCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGCGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCtt > 1:340666/1‑149 (MQ=255) ccccATCGAGGAGGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGATGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCGGGGTTTCCTTGTCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCtt < 1:315104/148‑1 (MQ=255) ccATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAg > 4:353250/1‑125 (MQ=255) ccATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAg < 3:353250/125‑1 (MQ=255) ccATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAg > 6:232443/1‑149 (MQ=255) cATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAgg > 4:33222/1‑149 (MQ=255) cATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAgg > 1:144408/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGt > 3:106593/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGt > 4:188286/1‑149 (MQ=255) tCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTc > 5:33446/1‑149 (MQ=255) aGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAg < 3:42692/143‑1 (MQ=255) aGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAg > 4:42692/1‑143 (MQ=255) ggATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTg < 7:261675/149‑1 (MQ=255) tGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTc < 3:146824/149‑1 (MQ=255) tGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGAGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTc < 5:310079/149‑1 (MQ=255) gACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTcg > 7:105992/1‑149 (MQ=255) tcTGTTTCTTCCAGACGGTCGTGGCGGAGGCTGCGGAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGGTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCGGGCGGCGTGGATGGCCAgg < 8:51540/107‑1 (MQ=255) aCTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGAAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGCGCGCTGCGCTGGGTTTCATTGGAAAAGGTCGTCAGGCATCCGGCGCCGCCGATGGCCacg > 7:51540/1‑106 (MQ=255) gTCCTGAGGCTCGTGGCGCAGGGTGCGCAGGTGCGGCTTGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCGGATGGCGAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCGTTGATGTCCTTGGTCGCGAActgct < 5:247036/149‑1 (MQ=255) gTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAActgct < 5:241747/149‑1 (MQ=255) gTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAActgc < 5:347401/148‑1 (MQ=255) tCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAActgctg > 1:360551/1‑149 (MQ=255) cTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGCTGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGACCAGCTGGCACAggg > 2:174565/1‑149 (MQ=255) tCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTg > 1:229051/1‑126 (MQ=255) tCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTg < 2:229051/126‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGcc > 3:75250/1‑145 (MQ=255) gcgcAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGcc < 4:75250/145‑1 (MQ=255) aGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGc < 3:188286/149‑1 (MQ=255) ggCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAg > 8:342138/1‑101 (MQ=255) ggCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAg < 7:342138/101‑1 (MQ=255) gCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGaa < 8:225999/123‑1 (MQ=255) gCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGaa > 7:225999/1‑123 (MQ=255) gCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGcc > 2:281007/1‑148 (MQ=255) cTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGa < 3:33222/149‑1 (MQ=255) gcAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGtct > 7:239755/1‑149 (MQ=255) gcAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGtct < 5:142413/149‑1 (MQ=255) tGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTc > 5:217474/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAg > 2:23182/1‑149 (MQ=255) ggCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCTGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAGTccc < 4:232353/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAGTcc < 3:19814/148‑1 (MQ=255) ggCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAGTcc > 4:19814/1‑148 (MQ=255) gCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAgg < 2:33009/117‑1 (MQ=255) gCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAgg > 1:33009/1‑117 (MQ=255) cGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAGTCCCAg < 6:33446/149‑1 (MQ=255) tGGGTTTCCTTGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAGTCCCAGGGGGcgcg > 1:284026/1‑149 (MQ=255) ttGGCATAGGTCGGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAGTCCCAGGGGGCGCGGCggcgggc > 4:161634/1‑149 (MQ=255) ttGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGcc < 2:359010/111‑1 (MQ=255) ttGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGcc > 1:359010/1‑111 (MQ=255) | GTCGCGCCCGCCGGCCAGGTTGATGTCCAGCTCCAGGTTGCGGCGGCTGGCCCCATCGAGGATGACTGTATCGTCCAGACGCTCGTGGCGCAGGCTGCGCAGGTGCGGCAGGGCGGTGCGCTGGGTTTCCTTGGCATAGGTCAGCAGGCAGCCGGCGGCGCCGATGGCCAGGGTCAGCTTGTCGCAGCCGAAGCCCTTGAGGTCCTTGGTCGCGAACTGCTGGCACAGGGCCTTGCGTGCCGAGTCTCGGTCGAAGTCCCAGGGGGCGCGGCGGCGGGC > NC_002947/1824399‑1824677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |