| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,926,513 | T→G | 5.3% | D118A (GAC→GCC) | PP_1726 ← | ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,926,513 | 0 | T | G | 5.3% | 240.9 / 2.6 | 75 | D118A (GAC→GCC) | PP_1726 | ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/31); new base G (2/2); total (42/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
GACCTTGTACTTGCCTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAGCTCATGTCGGTGTC > NC_002947/1926365‑1926661 | gACCTTGTACTTGCCTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGt < 6:321168/149‑1 (MQ=255) aCCTTGTACTTGCCTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTc < 3:88630/149‑1 (MQ=255) ttGTACTTGCCTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTcc > 2:337765/1‑147 (MQ=255) tGTACTTGCCTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑Ag > 4:80795/1‑149 (MQ=255) gCCTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTgcttg > 6:124646/1‑149 (MQ=255) gCCTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATACGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGGACC‑AGGTgccg < 6:299338/148‑3 (MQ=255) cTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTgcttggc < 5:133961/149‑1 (MQ=255) tttCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTCTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCACAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGTCACCTGGTCCC‑AGGTgcttggct > 8:8967/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAggctggct > 8:27974/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGa > 7:47748/1‑149 (MQ=255) tCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCtt < 5:124646/148‑1 (MQ=255) gCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGt > 3:299207/1‑148 (MQ=255) gTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCAcc > 6:327245/1‑149 (MQ=255) ttCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTg > 2:241283/1‑142 (MQ=255) ttCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTg < 1:241283/142‑1 (MQ=255) tctTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGAt > 2:168720/1‑149 (MQ=255) ttCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCTCGAt < 6:24455/147‑1 (MQ=255) ttCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCg > 5:61521/1‑149 (MQ=255) ttGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTgctt < 1:330224/105‑1 (MQ=255) ttGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTgctt > 2:330224/1‑105 (MQ=255) cAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAgg < 6:61521/149‑1 (MQ=255) cAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAgg < 4:299207/149‑1 (MQ=255) cTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCa < 3:80795/148‑1 (MQ=255) cgccatgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCAc < 6:214763/143‑1 (MQ=255) atgatgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCGTTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCAc < 6:113094/146‑1 (MQ=255) atgatgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCGTTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCAc > 5:113094/1‑146 (MQ=255) atgatgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGt > 1:303126/1‑148 (MQ=255) atgatgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGt > 2:133663/1‑148 (MQ=255) atgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTccc > 8:327935/1‑76 (MQ=255) atgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTccc < 7:327935/76‑1 (MQ=255) atgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCAcc > 6:141767/1‑149 (MQ=255) tgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAggctgg > 8:147867/1‑98 (MQ=255) tgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAggctgg < 7:147867/98‑1 (MQ=255) tgaAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCAcc < 8:47748/148‑1 (MQ=255) aaaGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGAt < 1:337765/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGgc < 1:168720/149‑1 (MQ=255) cGGTATAGGCCAGGGGCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCg < 5:59693/149‑1 (MQ=255) tataGGCCAGCGCCCAGTGTCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGTTCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑Tg < 8:291794/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGCTGTCGGCGCTGGCGT‑GGTCCt > 8:273842/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTcc < 1:133663/148‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCt < 2:58810/137‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCt > 1:58810/1‑137 (MQ=255) gcCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGc > 2:178144/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCCGTCCTTGTCCTAGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTCAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTc > 6:260071/1‑149 (MQ=255) ggCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAAc > 8:358/1‑149 (MQ=255) gCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACt > 3:331214/1‑149 (MQ=255) ccctccttgtccatgGCCCAATCCCGCACCTGGTCCC‑AGCTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGCTCACCCCGATCGGGACGAAGCCGGCACCCACGTCACCGATGTAGGCGCTGGACT‑TGTCCTTATCGGCATCGAACtt > 4:82165/4‑149 (MQ=255) ccGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCCAAGGTGCTTGGCTTGTAAGGATGGCTGACGCCCTTGGACACCGCGATCGGGCCGAAGCCGGCACCCACGAAACCGATGTCGGAGCTGGCGT‑TGTCCTTATCGGCTTCGACCt > 1:245720/1‑149 (MQ=255) cGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGcc > 1:204944/1‑88 (MQ=255) cGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGcc < 2:204944/88‑1 (MQ=255) cGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTc < 4:154181/142‑1 (MQ=255) cGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTc > 3:154181/1‑142 (MQ=255) cGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTg < 2:303126/149‑1 (MQ=255) cttgtccttgGCCCATTCCGGCAGCTGGTCCG‑AGGTGCGTGTGTTGTATGGCTGGCTGACGCGCTTGGTCAGGGCGATGGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTGACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTgggc < 3:82165/148‑3 (MQ=255) gtccttgGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGtt > 5:329596/1‑149 (MQ=255) ttgGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTg > 7:300879/1‑149 (MQ=255) ggCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTggg > 4:56900/1‑149 (MQ=255) ggCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTgg < 7:27974/148‑1 (MQ=255) cccATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTtct > 6:215232/1‑120 (MQ=255) cccATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTtct < 5:215232/120‑1 (MQ=255) cccATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGcc > 6:120369/1‑149 (MQ=255) ccATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTg < 5:67877/144‑1 (MQ=255) ccATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTg > 6:67877/1‑144 (MQ=255) ccATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGcc > 6:262574/1‑148 (MQ=255) ccATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCATCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGcc > 4:68195/1‑148 (MQ=255) aTTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAg > 2:307054/1‑149 (MQ=255) caagCACCTGGGACC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACtt < 2:164403/124‑1 (MQ=255) caagCACCTGGGACC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAGCt > 8:59945/4‑148 (MQ=255) cGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAGCTCa > 6:184344/1‑149 (MQ=255) aagCACCTGGGACC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGATGGCGTACAGAATACACGGCTACGAACTAGGCAAGTTCCTGGGCCgccaac > 1:302722/3‑144 (MQ=255) ggCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAg < 2:190548/144‑1 (MQ=255) ggCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAg > 1:190548/1‑144 (MQ=255) ggCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAGCTCAt > 5:56743/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAGCTCATGTCg < 6:56743/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAGCTCATGTCg < 8:300879/149‑1 (MQ=255) gTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAGCTCATGTCGgtgt < 5:327245/149‑1 (MQ=255) tCCC‑AGGGGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGTCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTTGCCAGTTCCTGGGCCGAGCTCATGTAGGTGTc < 7:8967/149‑1 (MQ=255) | GACCTTGTACTTGCCTTTCTCCAGGTCATGCCAGGTTTTCGGCCGTTCCTCTTCCTTGACCAGGTCCTTGTTGATGATGAAAGCGATGGTGCCGGTATAGGCCAGCGCCCAGTGGCCGTCCTTGTCCTTGGCCCATTCCGGCACCTGGTCCC‑AGGTGCTTGGCTTGTAAGGCTGGCTGACGCCCTTGGTCACCGCGATCGGGCCGAAGGCGGCACCCACGTCACCGATGTCGGCGCTGGCGT‑TGTCCTTCTCGGCTTCGAACTTGGCCAGTTCCTGGGCCGAGCTCATGTCGGTGTC > NC_002947/1926365‑1926661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |