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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,351,974 | 0 | T | C | 5.9% | 405.4 / 10.2 | 134 | I431V (ATT→GTT) | PP_2067 | EmrB/QacA family drug resistance transporter |
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Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GCATCACTGTAGGCCATCAGGTAAGCCTCTCGTCGAATGGTCGCCTCCAACGCTTCCAGCATTTGCTGCTGAGGCGGCAGCCAGCTTTGCACCGTCTGGTTGATACGCGCCTGCACGCTTGGCTCGA‑ACAGCGTCACCTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCACC > NC_002947/2351826‑2352119 | gCATCACTGTAGGCCATCAGGTAAGCCTCTCGTCGAATGGTCGCCTCCAACGCTTCCAGCATTTGCTGCTGAGGCGGCAGCCAGCTTTGCACCGTCTGGTTGATACGCGCCTGCACGCTTGGCTCGA‑ACAGCGTCACCTGCTCGTGAAt > 4:224965/1‑149 (MQ=255)gCATCACTGTAGGCCATCAGGTAAGCCTCTCGTCGAATGGTCGCCTCCAACGCTTCCAGCATTTGCTGCTGAGGCGGCAGCCAGCTTTGCACCGTCTGGTTGATACGCGCCTGCACGCTTGGCTCGA‑ACAGCGTCACCTGCTCGTGAAt < 5:250128/149‑1 (MQ=255)gCATCACTGTAGGCCATCAGGTAAGCCTCTCGTCGAATGGTCGCCTCCAACGCTTCCAGCATTTGCTGCTGAGGCGGCAGCCAGCTTTGCACCGTCTGGTTGATACGCGCCTGCACGCTTGGCTCGA‑ACAGCGTCACCTGCTCGTGAAt < 1:83302/149‑1 (MQ=255) 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gA‑ACAGCGTCACCTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCa > 6:36670/1‑149 (MQ=255) a‑aCAGCGTCACCTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCa < 5:48759/148‑1 (MQ=255) aCCTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCAc > 3:104567/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGc > 6:146509/1‑130 (MQ=255) cTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGc < 5:146509/130‑1 (MQ=255) cTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCa < 8:294536/149‑1 (MQ=255) tCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGt < 6:197990/50‑1 (MQ=255) tCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGt > 5:197990/1‑50 (MQ=255) tCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAg > 4:18366/1‑149 (MQ=255) ccGTGAACGCTTTCACAGTGAGCGCATTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAg > 6:360927/2‑149 (MQ=255) cGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAg > 7:342727/1‑148 (MQ=255) gTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCa < 4:85938/149‑1 (MQ=255) gTGAACGCTTTCACAGTGAGCGCATTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCa > 4:72527/1‑149 (MQ=255) tGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCAc < 3:13647/149‑1 (MQ=255) | GCATCACTGTAGGCCATCAGGTAAGCCTCTCGTCGAATGGTCGCCTCCAACGCTTCCAGCATTTGCTGCTGAGGCGGCAGCCAGCTTTGCACCGTCTGGTTGATACGCGCCTGCACGCTTGGCTCGA‑ACAGCGTCACCTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCACC > NC_002947/2351826‑2352119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |